MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16

Total Repeats: 10809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021514	TTAA	2	8	311708	311715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021514	AGG	2	6	311719	311724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021514	CTC	2	6	312624	312629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_021514	T	6	6	312639	312644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021514	T	6	6	312652	312657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021514	GACT	2	8	312669	312676	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_021514	TAT	2	6	312721	312726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_021514	TGAA	2	8	312810	312817	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_021514	A	6	6	312820	312825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_021514	A	6	6	314312	314317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021514	TTGT	2	8	314355	314362	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021514	ATA	2	6	315512	315517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021514	TTG	2	6	315584	315589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021514	TGC	2	6	315619	315624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_021514	A	7	7	315715	315721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021514	TGA	2	6	315792	315797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021514	G	6	6	315816	315821	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021514	TCA	2	6	315837	315842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_021514	GTT	2	6	315853	315858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_021514	GGA	2	6	315884	315889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021514	ATT	2	6	315909	315914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021514	TAG	2	6	315916	315921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021514	AAC	2	6	315963	315968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_021514	GAA	2	6	315976	315981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021514	GAT	2	6	315990	315995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021514	ATT	2	6	316011	316016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_021514	GATTA	2	10	316017	316026	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021514	T	6	6	317048	317053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_021514	TGG	2	6	317150	317155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021514	TAA	2	6	317181	317186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021514	TTA	2	6	318669	318674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021514	T	6	6	318981	318986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021514	TGT	2	6	319027	319032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021514	AGG	2	6	319662	319667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021514	TAG	2	6	320971	320976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021514	A	6	6	321013	321018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_021514	ATG	2	6	322309	322314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021514	TAA	2	6	322392	322397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021514	TCA	2	6	323662	323667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_021514	ATT	2	6	323703	323708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021514	GT	3	6	323724	323729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021514	GTAA	2	8	323739	323746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021514	CTCAT	2	10	323774	323783	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1044	NC_021514	TG	3	6	323868	323873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_021514	CAACA	2	10	323874	323883	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1046	NC_021514	A	6	6	323905	323910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021514	GAT	2	6	323920	323925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021514	ATG	2	6	323968	323973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021514	T	6	6	323998	324003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021514	CTTT	2	8	324025	324032	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_021514	ATA	2	6	324072	324077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021514	TAA	2	6	324088	324093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021514	A	6	6	324092	324097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021514	ACAT	2	8	324205	324212	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_021514	CGG	2	6	326147	326152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_021514	ATTAA	2	10	326168	326177	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_021514	T	6	6	326216	326221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_021514	TTGG	2	8	326241	326248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021514	TACAA	2	10	326256	326265	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1060	NC_021514	ATT	2	6	326274	326279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_021514	TAC	2	6	326333	326338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_021514	T	6	6	326410	326415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021514	ATT	2	6	326458	326463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021514	TGG	2	6	326483	326488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021514	GAT	2	6	326824	326829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021514	GTC	2	6	326830	326835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_021514	T	7	7	326849	326855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_021514	A	6	6	326949	326954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021514	AT	3	6	326973	326978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021514	AT	4	8	326986	326993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021514	A	6	6	329022	329027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_021514	GAT	2	6	329047	329052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_021514	A	7	7	329153	329159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021514	TCG	2	6	329189	329194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_021514	TCT	2	6	329224	329229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_021514	ATT	2	6	330703	330708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021514	T	7	7	330722	330728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021514	CTG	2	6	330781	330786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_021514	TTG	2	6	330868	330873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_021514	AAT	2	6	330928	330933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021514	G	6	6	330942	330947	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021514	ATTA	2	8	330954	330961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021514	GTGC	2	8	330994	331001	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_021514	TAA	2	6	331009	331014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021514	ATG	2	6	331016	331021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_021514	ACTA	2	8	331058	331065	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1087	NC_021514	CAC	2	6	331081	331086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_021514	ATT	2	6	331107	331112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_021514	TAA	2	6	331124	331129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_021514	GTT	2	6	332119	332124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_021514	TGG	2	6	332199	332204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021514	GCA	2	6	332484	332489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_021514	CAA	2	6	332567	332572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_021514	A	6	6	332596	332601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_021514	TCA	2	6	332611	332616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1097	NC_021514	AAT	2	6	333315	333320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021514	AGTT	2	8	333403	333410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021514	ATG	2	6	333430	333435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_021514	ATG	3	9	333446	333454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021514	GAC	2	6	334148	334153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_021514	T	6	6	334202	334207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021514	AAT	2	6	334210	334215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_021514	T	6	6	334250	334255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021514	TGA	2	6	335821	335826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021514	AAGT	2	8	335985	335992	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021514	A	6	6	336045	336050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021514	TAA	2	6	336467	336472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021514	A	6	6	336471	336476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021514	GTT	2	6	336509	336514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021514	CTC	2	6	337064	337069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_021514	T	6	6	338283	338288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_021514	TGG	2	6	338348	338353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021514	TAGAA	2	10	338354	338363	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021514	GGA	2	6	338379	338384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_021514	AAG	2	6	339358	339363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021514	CCA	2	6	339375	339380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_021514	AATT	2	8	339419	339426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021514	T	6	6	340143	340148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021514	TTAA	2	8	340152	340159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021514	TCC	2	6	341104	341109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1122	NC_021514	TAC	2	6	341149	341154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_021514	GGA	2	6	341221	341226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021514	AAT	2	6	342150	342155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021514	AAG	2	6	342162	342167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021514	GTT	2	6	342185	342190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021514	CTT	2	6	342208	342213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_021514	GA	3	6	342255	342260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021514	GTTA	2	8	342270	342277	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_021514	GAT	2	6	342297	342302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_021514	GCA	2	6	342327	342332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_021514	CCCG	2	8	342414	342421	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1133	NC_021514	AAT	2	6	342474	342479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021514	CGGT	2	8	342511	342518	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_021514	TGA	2	6	342535	342540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_021514	TTG	2	6	342625	342630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_021514	TAC	2	6	342642	342647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_021514	GAA	2	6	342724	342729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_021514	ATG	2	6	342732	342737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_021514	GTG	2	6	342816	342821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_021514	GTG	2	6	342878	342883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_021514	CAC	2	6	342904	342909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1143	NC_021514	GCTG	2	8	343002	343009	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1144	NC_021514	CCT	2	6	343490	343495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1146	NC_021514	TTA	2	6	343684	343689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1147	NC_021514	TAA	2	6	343692	343697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1151	NC_021514	ATG	2	6	347758	347763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1154	NC_021514	TCG	2	6	347843	347848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1156	NC_021514	TGCT	2	8	347915	347922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1157	NC_021514	ATTTA	2	10	347984	347993	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1175	NC_021514	GTG	2	6	358573	358578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1181	NC_021514	AAT	2	6	358994	358999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1255	NC_021514	TAAG	2	8	374772	374779	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_021514	TAG	2	6	377442	377447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1263	NC_021514	A	6	6	378235	378240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1412	NC_021514	ATTT	2	8	401990	401997	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_021514	T	7	7	401995	402001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_021514	ATAG	2	8	402015	402022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_021514	CAT	2	6	402034	402039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1421	NC_021514	TGT	2	6	406409	406414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1443	NC_021514	TATT	2	8	412213	412220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1448	NC_021514	ATG	2	6	413177	413182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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