MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16

Total Repeats: 10809

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_021514	TCC	2	6	2964244	2964249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10502	NC_021514	AAT	2	6	2964295	2964300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_021514	CAA	2	6	2964314	2964319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10504	NC_021514	T	6	6	2964370	2964375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_021514	GGA	2	6	2964392	2964397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_021514	TTCAT	2	10	2966463	2966472	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10507	NC_021514	T	6	6	2966549	2966554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_021514	ATT	2	6	2966555	2966560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_021514	AAT	2	6	2966562	2966567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_021514	C	6	6	2967226	2967231	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10511	NC_021514	A	6	6	2967239	2967244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_021514	AGG	2	6	2967280	2967285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_021514	GTT	2	6	2968414	2968419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_021514	TCC	2	6	2969741	2969746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10515	NC_021514	TC	3	6	2970071	2970076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10516	NC_021514	TCT	2	6	2970085	2970090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10517	NC_021514	TA	3	6	2970593	2970598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_021514	A	6	6	2970663	2970668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_021514	TAGA	2	8	2970787	2970794	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_021514	TAC	2	6	2970852	2970857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10521	NC_021514	ATTTT	2	10	2970868	2970877	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_021514	AGG	2	6	2970882	2970887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_021514	TCTT	2	8	2971701	2971708	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10524	NC_021514	ATT	2	6	2971732	2971737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_021514	ATA	2	6	2971778	2971783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_021514	ATAA	2	8	2971793	2971800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_021514	AAG	2	6	2974260	2974265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_021514	CTT	2	6	2974292	2974297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10529	NC_021514	TCTATT	2	12	2974308	2974319	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10530	NC_021514	ATG	2	6	2974361	2974366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_021514	C	6	6	2976510	2976515	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10532	NC_021514	CCT	2	6	2977360	2977365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10533	NC_021514	TACGTC	2	12	2977453	2977464	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10534	NC_021514	CAT	2	6	2977475	2977480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10535	NC_021514	TAA	2	6	2977490	2977495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_021514	TCG	2	6	2977517	2977522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10537	NC_021514	AAT	2	6	2980042	2980047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_021514	TAA	2	6	2980195	2980200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_021514	ATT	2	6	2980231	2980236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_021514	A	6	6	2981008	2981013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_021514	T	6	6	2981085	2981090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_021514	ATT	2	6	2981115	2981120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_021514	ATA	2	6	2981139	2981144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_021514	CTTT	2	8	2981160	2981167	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10545	NC_021514	TAAA	2	8	2981169	2981176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_021514	AAT	2	6	2981177	2981182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_021514	ATC	2	6	2982050	2982055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10548	NC_021514	ATT	3	9	2982061	2982069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_021514	AAT	2	6	2982108	2982113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_021514	T	7	7	2982116	2982122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10551	NC_021514	A	6	6	2982130	2982135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10552	NC_021514	TA	3	6	2982180	2982185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_021514	ATA	2	6	2982189	2982194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_021514	A	6	6	2982201	2982206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_021514	AAT	2	6	2982216	2982221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_021514	TTA	2	6	2982224	2982229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_021514	GAT	2	6	2982267	2982272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_021514	A	6	6	2982288	2982293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_021514	TAG	2	6	2983209	2983214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_021514	T	6	6	2983224	2983229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_021514	ATG	2	6	2983997	2984002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_021514	ACTTT	2	10	2985276	2985285	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10563	NC_021514	ATT	2	6	2985339	2985344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_021514	AAT	2	6	2985370	2985375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_021514	CTG	2	6	2985431	2985436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10566	NC_021514	ACA	2	6	2985442	2985447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10567	NC_021514	ATA	2	6	2985452	2985457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_021514	GTT	2	6	2985521	2985526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_021514	T	7	7	2985537	2985543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_021514	GCTAT	2	10	2985572	2985581	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10571	NC_021514	AAT	2	6	2985582	2985587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_021514	CGT	2	6	2985611	2985616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10573	NC_021514	ATC	2	6	2985622	2985627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10574	NC_021514	CAT	2	6	2985656	2985661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10575	NC_021514	ATG	2	6	2985663	2985668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_021514	ATA	2	6	2986162	2986167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10577	NC_021514	A	6	6	2986183	2986188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_021514	CATC	2	8	2986282	2986289	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10579	NC_021514	T	7	7	2986855	2986861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10580	NC_021514	TAA	2	6	2986885	2986890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_021514	TCG	2	6	2986931	2986936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10582	NC_021514	AATT	2	8	2987028	2987035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10583	NC_021514	ATC	2	6	2987176	2987181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10584	NC_021514	CCT	2	6	2987440	2987445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10585	NC_021514	TTA	2	6	2987450	2987455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10586	NC_021514	AAT	2	6	2987470	2987475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10587	NC_021514	CTT	2	6	2987515	2987520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10588	NC_021514	ATT	2	6	2987568	2987573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10589	NC_021514	TAA	2	6	2987574	2987579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_021514	CTA	2	6	2987588	2987593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10591	NC_021514	ATTAAA	2	12	2987649	2987660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_021514	TTAAC	2	10	2987678	2987687	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10593	NC_021514	A	6	6	2989126	2989131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_021514	A	6	6	2990179	2990184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_021514	GAAT	2	8	2990249	2990256	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_021514	ATT	2	6	2990310	2990315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_021514	ATG	3	9	2990329	2990337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_021514	TTA	2	6	2990349	2990354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_021514	A	6	6	2990416	2990421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_021514	CT	3	6	2990889	2990894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10601	NC_021514	TCA	2	6	2990904	2990909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10602	NC_021514	TAAAC	2	10	2990954	2990963	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10603	NC_021514	CCAAT	2	10	2990983	2990992	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10604	NC_021514	TAT	2	6	2991011	2991016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10605	NC_021514	ACCG	2	8	2991037	2991044	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10606	NC_021514	AAT	2	6	2991055	2991060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_021514	GAAC	2	8	2991105	2991112	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10608	NC_021514	CTA	2	6	2991198	2991203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10609	NC_021514	ATAC	2	8	2993967	2993974	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10610	NC_021514	ATTA	2	8	2993998	2994005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_021514	AT	3	6	2994024	2994029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_021514	ATT	2	6	2994032	2994037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_021514	ATT	2	6	2994087	2994092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_021514	TTAT	2	8	2994289	2994296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_021514	ACA	2	6	2996430	2996435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10616	NC_021514	ATA	2	6	2996471	2996476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_021514	AAT	2	6	2996552	2996557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10618	NC_021514	AAT	2	6	2996561	2996566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10619	NC_021514	TTTAA	2	10	2996683	2996692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10620	NC_021514	TTTA	2	8	2997080	2997087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10621	NC_021514	TGTT	2	8	2997106	2997113	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_021514	TTG	2	6	2997121	2997126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_021514	CAA	2	6	2997294	2997299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10624	NC_021514	TCA	2	6	2997320	2997325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10625	NC_021514	CCT	2	6	2997349	2997354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10626	NC_021514	GC	3	6	2997370	2997375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10627	NC_021514	CAG	2	6	2997593	2997598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10628	NC_021514	CCA	2	6	2997608	2997613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10629	NC_021514	TTA	2	6	2997631	2997636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10630	NC_021514	TGT	2	6	3000580	3000585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10750	NC_021514	T	6	6	3033928	3033933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10751	NC_021514	TCA	2	6	3033937	3033942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10753	NC_021514	CTA	2	6	3033977	3033982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10755	NC_021514	TCC	2	6	3035908	3035913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10756	NC_021514	CAT	2	6	3037313	3037318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10757	NC_021514	ATACC	2	10	3037348	3037357	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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10759	NC_021514	TAA	2	6	3037377	3037382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10760	NC_021514	A	7	7	3037400	3037406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10761	NC_021514	ACT	2	6	3037450	3037455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10762	NC_021514	CTA	2	6	3037484	3037489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10763	NC_021514	TCC	2	6	3038518	3038523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10764	NC_021514	CTA	2	6	3038626	3038631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10765	NC_021514	TTA	2	6	3038665	3038670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10766	NC_021514	AACC	2	8	3038678	3038685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10767	NC_021514	GCT	2	6	3038767	3038772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10768	NC_021514	CCGT	2	8	3038797	3038804	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10769	NC_021514	TAACGG	2	12	3040293	3040304	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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10775	NC_021514	CAAAA	2	10	3042071	3042080	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10776	NC_021514	CTA	2	6	3042088	3042093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10777	NC_021514	ACC	2	6	3042128	3042133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10781	NC_021514	CTC	2	6	3042316	3042321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10784	NC_021514	T	7	7	3042397	3042403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10785	NC_021514	CT	3	6	3042471	3042476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10786	NC_021514	ATT	2	6	3042524	3042529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10789	NC_021514	GAT	2	6	3042680	3042685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10790	NC_021514	CAA	2	6	3042693	3042698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10791	NC_021514	A	6	6	3042697	3042702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10793	NC_021514	TG	3	6	3043940	3043945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10795	NC_021514	TGGT	2	8	3044152	3044159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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10798	NC_021514	ACT	2	6	3044261	3044266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10799	NC_021514	TTTG	2	8	3044281	3044288	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10800	NC_021514	TAAAT	2	10	3044297	3044306	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10801	NC_021514	GTA	2	6	3044313	3044318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10802	NC_021514	A	6	6	3044329	3044334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10803	NC_021514	ATTT	2	8	3044349	3044356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10805	NC_021514	TGT	2	6	3044454	3044459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10807	NC_021514	AATT	2	8	3044536	3044543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10808	NC_021514	TTAACT	2	12	3044594	3044605	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10809	NC_021514	T	6	6	3044654	3044659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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