MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI01

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021503	TACA	2	8	2697	2704	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021503	TAAA	2	8	2756	2763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021503	TTTG	2	8	4103	4110	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021503	TATT	2	8	6143	6150	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021503	TAGA	2	8	7751	7758	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021503	AAAT	2	8	7770	7777	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021503	TGAT	2	8	8112	8119	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021503	ATTA	2	8	10002	10009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021503	TCAT	2	8	10630	10637	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021503	ATGA	2	8	10700	10707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021503	ATAA	2	8	12449	12456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021503	TCAT	2	8	12480	12487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021503	GGGA	2	8	13874	13881	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021503	AGTA	2	8	14097	14104	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021503	TATT	2	8	14153	14160	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021503	CAAA	3	12	14364	14375	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021503	ACTC	2	8	14406	14413	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_021503	ACTC	2	8	14483	14490	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021503	ACTC	2	8	14495	14502	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_021503	CACT	2	8	14582	14589	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021503	CATA	2	8	14780	14787	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021503	ACAA	2	8	15186	15193	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021503	TATT	2	8	15571	15578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021503	AGTA	2	8	16144	16151	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021503	GGCA	2	8	17779	17786	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021503	AGAA	2	8	23608	23615	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021503	AATG	2	8	31216	31223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021503	ATTT	2	8	31232	31239	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021503	TGAA	2	8	31407	31414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021503	ATTA	2	8	31486	31493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021503	CGTT	2	8	35416	35423	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021503	CCTT	2	8	36369	36376	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021503	AAGA	2	8	36456	36463	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021503	AGGA	2	8	36525	36532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021503	TTTG	2	8	36558	36565	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021503	CAAA	2	8	37663	37670	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021503	AAAG	2	8	41015	41022	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021503	TACT	2	8	41083	41090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021503	CATA	2	8	41734	41741	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021503	CGTA	2	8	42628	42635	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_021503	GCTT	2	8	44162	44169	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021503	CTTC	2	8	44377	44384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021503	ATGA	2	8	47691	47698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021503	AGAA	2	8	52007	52014	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021503	ATAA	2	8	52977	52984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.