MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI01

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021503	TCT	2	6	2686	2691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021503	TGG	2	6	2750	2755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021503	ACA	2	6	4003	4008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_021503	AAT	2	6	4012	4017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021503	AGG	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021503	TCG	2	6	4136	4141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021503	TAT	2	6	4492	4497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021503	AAT	2	6	6072	6077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021503	TTC	2	6	6078	6083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021503	GAT	2	6	6210	6215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021503	GAA	2	6	6277	6282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021503	TTA	2	6	6354	6359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021503	TAA	2	6	7523	7528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021503	TTA	2	6	7658	7663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021503	ATC	2	6	7738	7743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021503	TAA	2	6	8010	8015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021503	ACA	2	6	8064	8069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021503	ATA	2	6	8199	8204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021503	CAG	2	6	8224	8229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021503	ATA	2	6	8244	8249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021503	AAT	2	6	9688	9693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021503	CTT	2	6	9738	9743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021503	GTA	2	6	9777	9782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021503	TAA	2	6	9786	9791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021503	TAA	2	6	9802	9807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021503	TAG	4	12	9847	9858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021503	CTT	2	6	9913	9918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021503	ATA	2	6	9955	9960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021503	ATT	2	6	10020	10025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021503	TGC	2	6	10138	10143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021503	TAT	2	6	10188	10193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021503	GGA	2	6	10773	10778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021503	TAT	2	6	12382	12387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021503	TAA	2	6	12397	12402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021503	TAA	2	6	12589	12594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021503	TAT	2	6	12607	12612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021503	GGT	2	6	12940	12945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021503	GGT	2	6	12966	12971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021503	TTA	2	6	12975	12980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021503	TTA	2	6	13200	13205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021503	TAT	2	6	13216	13221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021503	TAA	2	6	13341	13346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021503	TAA	2	6	13441	13446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021503	TAA	2	6	13487	13492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021503	TGA	2	6	13641	13646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021503	GAA	2	6	13657	13662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021503	GAA	2	6	13683	13688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021503	TAG	2	6	13708	13713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021503	ATA	2	6	13804	13809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021503	ATA	2	6	14055	14060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021503	TAT	2	6	14172	14177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021503	TTA	2	6	14203	14208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021503	AAG	2	6	14256	14261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021503	AAC	2	6	14285	14290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021503	AAC	2	6	14297	14302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021503	ATA	2	6	14385	14390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021503	ATA	2	6	14395	14400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021503	CAT	2	6	14511	14516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021503	ACT	2	6	14743	14748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021503	CAT	2	6	14758	14763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021503	ATT	2	6	14772	14777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021503	TAC	2	6	14794	14799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021503	ATC	2	6	14845	14850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021503	ATT	2	6	15125	15130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021503	TAT	2	6	15146	15151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021503	TAT	2	6	15250	15255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021503	TTA	2	6	15257	15262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021503	ACC	2	6	15466	15471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021503	TGT	2	6	15488	15493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021503	TAT	2	6	15533	15538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021503	TGT	2	6	15556	15561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021503	TAT	2	6	15597	15602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021503	ATA	2	6	16071	16076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021503	TCT	2	6	16178	16183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021503	ATT	2	6	17663	17668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021503	GTA	2	6	17794	17799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021503	ATA	2	6	17934	17939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021503	ATA	2	6	17965	17970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021503	TGT	2	6	21809	21814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021503	AAT	2	6	23104	23109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021503	ACA	2	6	23205	23210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021503	GAA	2	6	23211	23216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021503	GGA	2	6	23217	23222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021503	TTA	2	6	24582	24587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021503	ACT	2	6	24665	24670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021503	TAT	2	6	24801	24806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021503	ACC	2	6	24931	24936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_021503	TAT	2	6	24983	24988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021503	TAA	2	6	25936	25941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021503	TTA	2	6	25944	25949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021503	AAC	2	6	25992	25997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021503	AAT	2	6	27536	27541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021503	TTA	2	6	28759	28764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021503	ATA	2	6	28827	28832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021503	TAT	2	6	29445	29450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021503	GTT	2	6	29477	29482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021503	TTA	2	6	29584	29589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021503	CGG	2	6	29593	29598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021503	GTA	2	6	29658	29663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021503	CTC	2	6	29673	29678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_021503	TTG	2	6	29693	29698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021503	AGC	2	6	31125	31130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021503	TAA	2	6	31160	31165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021503	GCT	2	6	31272	31277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021503	GCA	2	6	31284	31289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021503	GTT	2	6	31467	31472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021503	TTG	2	6	34422	34427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021503	TAA	2	6	35428	35433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021503	ATA	2	6	35466	35471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021503	GGA	2	6	35538	35543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021503	CTT	2	6	35592	35597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021503	TTA	2	6	36398	36403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021503	TTG	2	6	36413	36418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021503	TAC	2	6	36427	36432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021503	ACA	2	6	36445	36450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021503	ATT	2	6	36489	36494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021503	TCT	2	6	36499	36504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021503	ATA	2	6	36507	36512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021503	TCT	2	6	36601	36606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021503	TTG	2	6	36634	36639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021503	TAT	2	6	36683	36688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021503	AAT	2	6	36749	36754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021503	TAC	2	6	36764	36769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021503	ACA	2	6	36822	36827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021503	TTC	2	6	36867	36872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021503	ACC	2	6	37559	37564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_021503	CTT	2	6	37604	37609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021503	TTA	2	6	37657	37662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021503	CTT	2	6	37676	37681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021503	ATT	2	6	37816	37821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021503	ATT	2	6	39290	39295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021503	TGG	2	6	39301	39306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021503	AGT	2	6	39338	39343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021503	ATT	2	6	39556	39561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021503	TAA	2	6	40990	40995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021503	ATT	2	6	41652	41657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021503	AAT	2	6	41715	41720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021503	TAT	2	6	41745	41750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021503	TCC	2	6	42511	42516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_021503	TTA	2	6	42535	42540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021503	CAC	2	6	42622	42627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_021503	CGG	2	6	42648	42653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021503	ACT	2	6	44109	44114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_021503	AGT	2	6	44282	44287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021503	AGC	2	6	44307	44312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_021503	CTT	2	6	44343	44348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_021503	ACT	2	6	44432	44437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_021503	CAC	2	6	44457	44462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_021503	TAA	2	6	45043	45048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021503	CCT	2	6	45345	45350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_021503	TAA	2	6	45366	45371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021503	TCA	2	6	45379	45384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_021503	CCA	2	6	47639	47644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_021503	GCA	2	6	47759	47764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_021503	TCC	2	6	48232	48237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_021503	TTA	2	6	48279	48284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021503	AAT	2	6	48303	48308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021503	ATA	2	6	48355	48360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_021503	TCT	2	6	48458	48463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_021503	TCC	2	6	49479	49484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_021503	ATA	2	6	49488	49493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021503	ATT	2	6	49513	49518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021503	TAA	2	6	49565	49570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021503	ACC	2	6	49609	49614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_021503	ATT	2	6	49712	49717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_021503	ACC	2	6	49779	49784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_021503	ATT	2	6	49949	49954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021503	ATA	2	6	49979	49984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_021503	TAT	2	6	49988	49993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_021503	ATT	2	6	50383	50388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_021503	GAA	2	6	51431	51436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021503	GTA	2	6	53011	53016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.