MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007

Total Repeats: 300

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021494	TAAAG	2	10	10128	10137	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021494	TGATA	2	10	11147	11156	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021494	AAAAT	2	10	18000	18009	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021494	AAAAT	2	10	18049	18058	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021494	AATTA	2	10	31267	31276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021494	GATTT	2	10	33495	33504	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021494	ACCTA	2	10	38603	38612	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_021494	AAATT	2	10	38690	38699	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021494	AAATG	2	10	54913	54922	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021494	AATGA	2	10	58906	58915	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021494	TAACT	2	10	82712	82721	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_021494	TTAAC	2	10	87300	87309	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021494	ATTTT	2	10	100560	100569	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021494	TAAAA	2	10	108444	108453	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021494	ACTCT	2	10	108480	108489	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_021494	AATTT	2	10	115592	115601	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021494	ATTCC	2	10	125070	125079	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_021494	ATAAA	2	10	132639	132648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021494	AGAGA	2	10	132656	132665	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021494	AATTT	2	10	134468	134477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021494	AAAAT	2	10	135526	135535	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021494	GAAAA	2	10	146136	146145	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021494	TTCCG	2	10	150871	150880	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_021494	TAGAA	2	10	153595	153604	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021494	ATTGA	2	10	161506	161515	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021494	CTTGA	2	10	163491	163500	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021494	TAACT	2	10	166517	166526	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021494	CCCAT	2	10	168338	168347	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_021494	TAACT	2	10	170056	170065	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021494	CTATA	2	10	175155	175164	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_021494	TAACT	3	15	183177	183191	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021494	TTATT	2	10	187601	187610	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021494	ACAAA	2	10	201230	201239	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_021494	AGAAA	2	10	209429	209438	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021494	CGTGC	2	10	214768	214777	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_021494	AAGAA	2	10	219618	219627	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021494	TAAAA	2	10	231226	231235	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021494	ATCAT	2	10	232923	232932	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021494	AAGGA	2	10	265519	265528	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021494	TAACT	2	10	266542	266551	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_021494	TATGA	2	10	268131	268140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021494	TAAAT	2	10	286006	286015	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021494	TAAAA	2	10	287327	287336	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021494	AAAAC	2	10	290672	290681	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_021494	TTTTA	2	10	292534	292543	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021494	ATTAA	2	10	302777	302786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021494	TGAGG	2	10	316961	316970	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021494	CGTGC	2	10	321704	321713	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_021494	TTTTG	2	10	335965	335974	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021494	GCACG	2	10	336902	336911	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_021494	TATCA	2	10	344348	344357	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_021494	AGTAA	2	10	347149	347158	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021494	TAACT	2	10	362169	362178	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_021494	AGAGA	2	10	362514	362523	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021494	AAAAT	2	10	374653	374662	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021494	GTTGC	2	10	376884	376893	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_021494	ATGAG	2	10	379375	379384	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021494	TAAAT	2	10	381370	381379	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021494	ACTAA	2	10	382767	382776	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021494	GCACG	2	10	383744	383753	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_021494	CGTGC	2	10	386282	386291	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_021494	AATTA	2	10	387832	387841	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021494	TTAAA	2	10	391834	391843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021494	AAAGC	2	10	393240	393249	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_021494	TTACA	2	10	395925	395934	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021494	TAAAT	2	10	400401	400410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021494	TATAA	2	10	400661	400670	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021494	AAATA	2	10	410409	410418	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021494	TTTCA	2	10	416783	416792	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021494	ATGAA	2	10	417058	417067	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021494	TAATT	2	10	421453	421462	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021494	TCTTT	2	10	422938	422947	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_021494	TAAAA	2	10	424068	424077	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021494	AAATA	2	10	430002	430011	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021494	GCACG	2	10	433518	433527	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_021494	ATTTT	2	10	435405	435414	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021494	AAAAT	2	10	438652	438661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021494	CGTGC	2	10	442131	442140	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_021494	TTTGA	2	10	457670	457679	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021494	CGTGC	2	10	470298	470307	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_021494	CGTGC	2	10	473759	473768	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_021494	TTTTA	2	10	480310	480319	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021494	AGGGA	2	10	481113	481122	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021494	GAGAT	2	10	481813	481822	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021494	ACTAA	2	10	484709	484718	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_021494	TTTTA	2	10	489160	489169	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021494	TAATA	2	10	519441	519450	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021494	TTTAT	2	10	523501	523510	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021494	AGTCA	2	10	558037	558046	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_021494	TCTTT	2	10	563129	563138	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_021494	TGTTA	2	10	564443	564452	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021494	ACAAA	2	10	574645	574654	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_021494	TCTAA	2	10	581958	581967	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_021494	TATAT	2	10	581969	581978	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021494	ATTTG	2	10	601546	601555	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021494	ATCAT	2	10	636057	636066	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_021494	AAGCG	2	10	647263	647272	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_021494	GGTAA	2	10	658118	658127	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021494	GTCTG	2	10	658601	658610	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_021494	TCGTG	2	10	658935	658944	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021494	AACAA	2	10	659716	659725	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_021494	GAGAT	2	10	662607	662616	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021494	AGCTA	2	10	663825	663834	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_021494	CAGAA	2	10	666492	666501	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_021494	AACCA	2	10	675526	675535	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_021494	AAAAT	2	10	682621	682630	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021494	GCACG	2	10	685206	685215	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_021494	TAAAA	2	10	692500	692509	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021494	TGAAA	2	10	713474	713483	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021494	TAACT	2	10	721037	721046	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_021494	GAAAG	2	10	747783	747792	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021494	TGTAG	2	10	748139	748148	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021494	GTGCT	2	10	756749	756758	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021494	GAATT	2	10	759765	759774	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021494	TAATT	2	10	760132	760141	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021494	TAGCC	2	10	768021	768030	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_021494	TTACA	2	10	774315	774324	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021494	AGGAA	2	10	775947	775956	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021494	AAAAT	2	10	777481	777490	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021494	AAAAT	2	10	783540	783549	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021494	TAACT	2	10	785843	785852	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021494	ATTAA	2	10	816062	816071	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021494	GAAAG	2	10	830856	830865	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021494	TTCCT	2	10	832076	832085	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_021494	TGCTA	2	10	834057	834066	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_021494	TATTT	2	10	841985	841994	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021494	TTTAG	2	10	887933	887942	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021494	TTTAA	2	10	894848	894857	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021494	AATCA	2	10	909497	909506	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_021494	AAAAT	2	10	919395	919404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021494	GGTAA	2	10	947401	947410	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021494	GTCTG	2	10	947884	947893	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_021494	TCGTG	2	10	948218	948227	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_021494	AACAA	2	10	948799	948808	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_021494	GAGAT	2	10	951690	951699	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021494	TAAGT	2	10	957079	957088	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021494	TTATT	2	10	964220	964229	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021494	TAAAA	2	10	992758	992767	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021494	AAATA	2	10	1005981	1005990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021494	TTAAT	2	10	1006133	1006142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021494	TAATA	2	10	1011595	1011604	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021494	TCATT	2	10	1014497	1014506	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021494	CTTAA	2	10	1015661	1015670	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_021494	TCATT	2	10	1030897	1030906	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_021494	CCTTC	2	10	1043294	1043303	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
146	NC_021494	CATTA	2	10	1043305	1043314	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_021494	TAAGT	2	10	1047905	1047914	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_021494	TAATT	2	10	1293875	1293884	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_021494	GCACG	2	10	1864335	1864344	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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289	NC_021494	ATTTA	2	10	1896072	1896081	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_021494	TTAAT	2	10	1896306	1896315	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_021494	AGGCT	2	10	1898884	1898893	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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293	NC_021494	AAAAT	2	10	1920020	1920029	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_021494	AATCT	2	10	1939147	1939156	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
299	NC_021494	CTGCC	2	10	1947029	1947038	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
300	NC_021494	TGGTT	2	10	1947239	1947248	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.