MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007

Total Repeats: 873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021494	TTAA	2	8	3607	3614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021494	TTTA	2	8	17778	17785	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021494	GTTA	2	8	18118	18125	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021494	ATTT	2	8	20976	20983	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021494	TAAT	2	8	23614	23621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021494	TTAA	2	8	30625	30632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021494	TAAC	2	8	32609	32616	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021494	TAAA	2	8	35771	35778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021494	GCCA	2	8	35832	35839	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021494	GTTA	2	8	38731	38738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021494	TGTT	2	8	38760	38767	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021494	TTTA	2	8	38858	38865	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021494	AAAG	2	8	39057	39064	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021494	CTTT	2	8	45014	45021	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021494	ATGA	2	8	45149	45156	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021494	CTTA	2	8	45200	45207	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021494	CTAT	2	8	45245	45252	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021494	GGAT	2	8	46728	46735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021494	TGAT	2	8	46921	46928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021494	TTGA	2	8	51532	51539	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021494	ATTA	2	8	51548	51555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021494	AATG	2	8	55025	55032	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021494	AGAA	2	8	58874	58881	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021494	ATTA	2	8	73905	73912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021494	GCAA	2	8	82627	82634	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021494	TCCA	2	8	82732	82739	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021494	CAAT	2	8	83534	83541	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021494	TGAA	2	8	84775	84782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021494	TTAT	2	8	87273	87280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021494	ATAA	2	8	87289	87296	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021494	ATTT	2	8	87359	87366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021494	TCGA	2	8	87367	87374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021494	TCCT	2	8	92619	92626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021494	ATTA	2	8	92666	92673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021494	GTAA	2	8	93250	93257	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021494	TTTA	2	8	93795	93802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021494	CACT	2	8	94295	94302	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021494	AAAG	2	8	102488	102495	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021494	TGAT	2	8	108318	108325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021494	GAAA	2	8	111150	111157	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021494	CCTA	2	8	111169	111176	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021494	ATAA	2	8	112813	112820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021494	ACAA	2	8	115734	115741	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021494	TAAA	2	8	117024	117031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021494	CTTT	2	8	119846	119853	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021494	TCAA	2	8	120413	120420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021494	TCTG	2	8	123812	123819	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021494	AAGG	2	8	125306	125313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021494	GATA	2	8	125763	125770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021494	CAAA	2	8	128447	128454	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021494	AATT	2	8	129363	129370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021494	ATTA	2	8	137591	137598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021494	AGGA	2	8	137600	137607	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021494	ATAA	2	8	142341	142348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021494	AGAA	2	8	143571	143578	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021494	CTTT	2	8	146055	146062	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021494	AAAG	2	8	146172	146179	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021494	ATAC	2	8	146314	146321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021494	GAAT	2	8	149853	149860	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021494	TAAA	2	8	150190	150197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021494	ATTA	2	8	150968	150975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021494	TTAA	2	8	155955	155962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021494	AAAG	2	8	155971	155978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021494	ATTT	2	8	159621	159628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021494	TGTA	2	8	160069	160076	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021494	AGAT	2	8	160810	160817	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021494	TTTA	2	8	161851	161858	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021494	AAAG	2	8	161930	161937	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021494	TTAA	2	8	164768	164775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021494	TTTG	2	8	165011	165018	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021494	GCAA	2	8	166433	166440	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_021494	AAAT	2	8	166554	166561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021494	AAAG	2	8	168168	168175	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021494	GCAA	2	8	169973	169980	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_021494	AGCG	2	8	170288	170295	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021494	ATAA	2	8	173982	173989	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021494	TCAC	2	8	174168	174175	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021494	TTTA	2	8	175134	175141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021494	TATT	2	8	177090	177097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021494	TTTG	2	8	177259	177266	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021494	TAAA	2	8	181035	181042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021494	GCAA	2	8	183094	183101	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021494	CTTT	2	8	183568	183575	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021494	AATA	2	8	183919	183926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021494	ACTT	2	8	183929	183936	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_021494	ATAA	2	8	185863	185870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021494	TTAA	2	8	192570	192577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021494	AGCT	2	8	192592	192599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_021494	ATAA	2	8	194086	194093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021494	CAAA	2	8	195778	195785	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021494	ATAA	2	8	195894	195901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021494	ATGA	2	8	195985	195992	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021494	AGAA	2	8	196903	196910	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021494	AAGT	2	8	197007	197014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021494	TTGA	2	8	201193	201200	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021494	CAAT	2	8	203424	203431	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_021494	TTCC	2	8	203803	203810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021494	TAAA	2	8	211083	211090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021494	ACAG	2	8	211148	211155	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021494	TATT	2	8	211240	211247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021494	GATT	2	8	211315	211322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021494	GGAA	2	8	211406	211413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021494	CAAT	2	8	214560	214567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021494	ATAA	2	8	214590	214597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021494	CACT	2	8	214828	214835	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021494	TACT	2	8	227106	227113	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_021494	TTAA	2	8	227120	227127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021494	ATGC	2	8	228330	228337	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021494	AGAA	2	8	228635	228642	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021494	TATT	2	8	229775	229782	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021494	AACT	2	8	231286	231293	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021494	AAAG	2	8	231493	231500	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021494	AAAT	2	8	232505	232512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021494	AATA	2	8	232545	232552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021494	ACTT	2	8	233064	233071	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021494	ATTG	2	8	240776	240783	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021494	ATTA	2	8	243384	243391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021494	TCTA	2	8	244619	244626	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_021494	AAAT	2	8	245321	245328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021494	AGTA	2	8	248735	248742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021494	TTTG	2	8	250713	250720	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021494	AAAT	2	8	250787	250794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021494	AATT	2	8	251984	251991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021494	AAAG	2	8	257023	257030	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021494	AAAG	2	8	259909	259916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021494	TAAA	2	8	260922	260929	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021494	GCAA	2	8	266459	266466	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_021494	TTTA	2	8	267462	267469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021494	ATTA	2	8	267483	267490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021494	TGTT	2	8	272436	272443	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021494	TAAA	2	8	276999	277006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021494	TAAA	2	8	278399	278406	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021494	AGAA	2	8	278537	278544	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021494	TTGT	2	8	280160	280167	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021494	GTTC	2	8	283455	283462	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_021494	CCAG	2	8	283776	283783	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_021494	ATTT	2	8	287372	287379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021494	CTTC	2	8	293024	293031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021494	ATTT	2	8	293040	293047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021494	ACTA	2	8	299855	299862	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021494	CTTT	2	8	301752	301759	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021494	TAAT	2	8	301940	301947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021494	ATCT	2	8	303799	303806	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021494	GAAG	2	8	303948	303955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021494	TAAA	2	8	309042	309049	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021494	TCAA	2	8	309087	309094	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_021494	TAAA	2	8	309715	309722	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021494	TTTA	2	8	321625	321632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021494	CACT	2	8	321764	321771	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021494	TTAA	2	8	321777	321784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021494	ATCT	2	8	323049	323056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_021494	CCCT	2	8	324251	324258	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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171	NC_021494	GCAA	2	8	366270	366277	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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