MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 6448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021235	CGC	2	6	448690	448695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_021235	TGG	2	6	448699	448704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_021235	GAA	2	6	448777	448782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_021235	AAG	2	6	448785	448790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_021235	TGG	2	6	448791	448796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_021235	ATT	2	6	448804	448809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_021235	CCAT	2	8	448833	448840	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_021235	TAC	2	6	448958	448963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_021235	TGA	2	6	449059	449064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_021235	CT	3	6	449090	449095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_021235	TAAAT	2	10	449551	449560	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_021235	TGAT	2	8	449565	449572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_021235	TTG	2	6	449640	449645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_021235	CAT	2	6	449678	449683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_021235	AAAT	2	8	449689	449696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_021235	T	6	6	449713	449718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_021235	TAAA	2	8	449730	449737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_021235	TTA	2	6	449740	449745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_021235	ATT	2	6	451986	451991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_021235	AAT	2	6	451997	452002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_021235	TAA	2	6	452008	452013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_021235	ACG	2	6	452019	452024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_021235	TTG	2	6	452049	452054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_021235	T	6	6	452059	452064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_021235	CA	3	6	452078	452083	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_021235	T	7	7	452097	452103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_021235	TTGA	2	8	452185	452192	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_021235	T	6	6	453573	453578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_021235	ACA	2	6	453581	453586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_021235	TAGA	2	8	453622	453629	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_021235	T	6	6	453632	453637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_021235	T	6	6	453690	453695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_021235	A	6	6	453705	453710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_021235	CGC	2	6	453715	453720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_021235	GGGGA	2	10	453728	453737	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_021235	CCT	2	6	453890	453895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_021235	TC	4	8	453899	453906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_021235	GGC	2	6	453981	453986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_021235	TGT	2	6	454020	454025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_021235	TGG	2	6	454032	454037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_021235	A	6	6	454062	454067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_021235	ACG	2	6	454071	454076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_021235	T	6	6	454086	454091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_021235	ATT	2	6	454124	454129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_021235	AGG	2	6	454137	454142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_021235	GAG	2	6	455200	455205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_021235	TCTTT	2	10	455218	455227	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1548	NC_021235	AGG	2	6	455234	455239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021235	GAAA	2	8	456469	456476	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_021235	T	7	7	456498	456504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_021235	T	6	6	456537	456542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_021235	ATA	2	6	457384	457389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_021235	GA	3	6	457429	457434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_021235	GAA	2	6	458789	458794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_021235	TTC	2	6	458803	458808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_021235	T	6	6	458814	458819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_021235	TGA	2	6	458837	458842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_021235	GTT	2	6	458890	458895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_021235	AG	3	6	458941	458946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_021235	GCC	2	6	460387	460392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_021235	T	6	6	460394	460399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_021235	AAT	2	6	460407	460412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_021235	AGG	2	6	462043	462048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_021235	T	7	7	462322	462328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_021235	AGG	2	6	464748	464753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_021235	CCG	2	6	465253	465258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1568	NC_021235	GGA	2	6	466693	466698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_021235	GTC	2	6	468756	468761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1571	NC_021235	AAG	2	6	469436	469441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_021235	GAA	2	6	472095	472100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_021235	GAA	2	6	472106	472111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_021235	A	6	6	473538	473543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_021235	ATT	3	9	473595	473603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1582	NC_021235	T	6	6	475732	475737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_021235	AGG	2	6	475757	475762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_021235	A	6	6	475770	475775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_021235	TA	3	6	477960	477965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_021235	GAA	2	6	477967	477972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_021235	AGA	2	6	477973	477978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_021235	T	6	6	478859	478864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_021235	T	7	7	478878	478884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_021235	CCGG	2	8	478934	478941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1591	NC_021235	T	6	6	478964	478969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_021235	CGC	2	6	479016	479021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_021235	TAGGT	2	10	479757	479766	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1595	NC_021235	T	7	7	479814	479820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_021235	TGG	2	6	479870	479875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_021235	TAA	2	6	479899	479904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_021235	GCC	2	6	479915	479920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_021235	AAG	2	6	479996	480001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_021235	ATG	2	6	480051	480056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_021235	A	6	6	480086	480091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_021235	CT	4	8	481184	481191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_021235	TTTA	2	8	481260	481267	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_021235	AGG	2	6	481274	481279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_021235	GTC	2	6	482256	482261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_021235	T	6	6	482268	482273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_021235	ACC	2	6	482294	482299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_021235	ATC	2	6	482332	482337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_021235	GTC	2	6	482410	482415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_021235	CCT	2	6	483725	483730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1613	NC_021235	TGATA	2	10	483735	483744	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_021235	ATG	2	6	483755	483760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_021235	A	6	6	483799	483804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_021235	TCG	2	6	483824	483829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_021235	TCA	2	6	484956	484961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_021235	ATCC	2	8	485439	485446	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_021235	ACC	2	6	486518	486523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1620	NC_021235	CTATT	2	10	487419	487428	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1621	NC_021235	CTT	2	6	487501	487506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_021235	TGG	2	6	487511	487516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_021235	AGG	2	6	487524	487529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021235	ATCTG	2	10	488240	488249	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1625	NC_021235	AGTT	2	8	488258	488265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_021235	ACT	2	6	488270	488275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_021235	CCT	2	6	489232	489237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1628	NC_021235	T	6	6	489358	489363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_021235	A	7	7	489364	489370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_021235	TTGA	2	8	489410	489417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_021235	C	7	7	489507	489513	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1632	NC_021235	GA	3	6	489639	489644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_021235	GAG	2	6	490688	490693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_021235	AG	3	6	490692	490697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_021235	GGAT	2	8	492835	492842	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_021235	CAT	2	6	493333	493338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1638	NC_021235	AGG	2	6	493363	493368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1912	NC_021235	CAC	2	6	573170	573175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1914	NC_021235	AGG	2	6	573222	573227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1915	NC_021235	G	6	6	573885	573890	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1930	NC_021235	ATT	2	6	582715	582720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1932	NC_021235	CAA	2	6	582771	582776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1941	NC_021235	T	6	6	594964	594969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1944	NC_021235	G	6	6	597775	597780	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1945	NC_021235	TGG	2	6	597795	597800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1988	NC_021235	TTC	2	6	616508	616513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1989	NC_021235	G	6	6	616587	616592	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1990	NC_021235	GGT	2	6	616650	616655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1991	NC_021235	GAA	2	6	616727	616732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1992	NC_021235	AGT	2	6	616772	616777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1995	NC_021235	AAG	3	9	616970	616978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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