MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 6448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021235	GTG	2	6	172472	172477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_021235	GACA	2	8	172610	172617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
503	NC_021235	GGT	2	6	172653	172658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
504	NC_021235	CGT	2	6	172848	172853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_021235	GTT	2	6	172951	172956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021235	TATG	2	8	172981	172988	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
507	NC_021235	GAT	2	6	173074	173079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021235	GTGGAA	2	12	173092	173103	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021235	GTG	2	6	173222	173227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_021235	ATG	2	6	173228	173233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_021235	AGT	2	6	173293	173298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_021235	GAAA	2	8	173346	173353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
513	NC_021235	CTTTC	2	10	173356	173365	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
514	NC_021235	GTCG	2	8	174147	174154	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
515	NC_021235	AATT	2	8	174207	174214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021235	GGT	2	6	174255	174260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021235	ACC	2	6	174266	174271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_021235	A	7	7	174277	174283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_021235	T	6	6	174304	174309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_021235	GTT	2	6	174310	174315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_021235	CTC	2	6	174959	174964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
522	NC_021235	CAT	2	6	175035	175040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_021235	AAG	2	6	175060	175065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021235	GTG	2	6	175474	175479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021235	GGC	2	6	175491	175496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_021235	CCAG	2	8	175565	175572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
527	NC_021235	G	6	6	175614	175619	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021235	CCGC	2	8	175679	175686	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
529	NC_021235	AAG	2	6	175766	175771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_021235	CAC	2	6	177015	177020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_021235	GAC	2	6	177046	177051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_021235	GGC	2	6	177132	177137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_021235	CCGG	2	8	178129	178136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
534	NC_021235	C	6	6	178139	178144	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
535	NC_021235	ATG	2	6	178145	178150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_021235	CAA	2	6	178191	178196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_021235	ATG	2	6	179050	179055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_021235	AAG	2	6	179057	179062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_021235	GAG	2	6	179078	179083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021235	GT	3	6	179356	179361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021235	T	7	7	179450	179456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_021235	ATT	2	6	179808	179813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_021235	AAT	2	6	179843	179848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_021235	GAG	2	6	179861	179866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021235	AAC	2	6	180442	180447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_021235	CCG	2	6	180722	180727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_021235	TGA	2	6	180738	180743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_021235	CCT	2	6	180758	180763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_021235	ATT	2	6	180832	180837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_021235	CAAA	2	8	180861	180868	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
551	NC_021235	GTA	2	6	181244	181249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_021235	GAA	2	6	181260	181265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_021235	TCA	2	6	181333	181338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_021235	TGA	2	6	181375	181380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_021235	T	7	7	181407	181413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021235	TAA	2	6	181457	181462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_021235	A	6	6	181465	181470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021235	CGCC	2	8	181471	181478	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
559	NC_021235	CTT	2	6	181530	181535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_021235	TCC	2	6	183096	183101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_021235	ATT	2	6	183113	183118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021235	ATT	2	6	183137	183142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_021235	TAA	2	6	183154	183159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_021235	ACA	2	6	183162	183167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_021235	A	6	6	183170	183175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_021235	A	6	6	183178	183183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021235	GGA	2	6	183268	183273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_021235	GCT	2	6	186840	186845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_021235	TTG	2	6	186846	186851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_021235	AACC	2	8	188496	188503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_021235	TAAA	2	8	188521	188528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_021235	T	6	6	188565	188570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021235	T	6	6	188582	188587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_021235	GAA	2	6	188887	188892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_021235	TAAAG	2	10	190324	190333	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021235	T	6	6	190368	190373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021235	GAT	2	6	190386	190391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021235	TAA	2	6	190463	190468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021235	ATT	2	6	190557	190562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021235	TAA	2	6	190592	190597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021235	GGA	2	6	190624	190629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021235	GTG	2	6	190635	190640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
583	NC_021235	AAT	2	6	190647	190652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021235	AGC	2	6	190687	190692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_021235	TTC	2	6	190749	190754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_021235	GGT	2	6	190766	190771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_021235	CAG	2	6	190829	190834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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589	NC_021235	CAG	2	6	190865	190870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_021235	GCG	2	6	190884	190889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_021235	T	7	7	192724	192730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021235	GA	3	6	192774	192779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021235	TGG	2	6	193664	193669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_021235	T	7	7	193676	193682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_021235	GTT	2	6	193687	193692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_021235	A	6	6	193727	193732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_021235	A	6	6	193736	193741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021235	GGT	2	6	193788	193793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021235	TGA	2	6	193822	193827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_021235	GGAG	2	8	193840	193847	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021235	TAA	2	6	193928	193933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_021235	TGT	2	6	193935	193940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_021235	CTT	2	6	193954	193959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_021235	A	6	6	193977	193982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_021235	GTT	2	6	193983	193988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_021235	TCAAA	2	10	193994	194003	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
607	NC_021235	AAT	2	6	194066	194071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021235	CGA	2	6	194076	194081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_021235	TGA	2	6	194106	194111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_021235	A	6	6	194119	194124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_021235	TTA	2	6	194150	194155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_021235	CTT	2	6	194172	194177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_021235	CGG	2	6	194217	194222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_021235	ATTG	2	8	194259	194266	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
615	NC_021235	TGAT	2	8	194281	194288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021235	ACA	2	6	194352	194357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_021235	AAC	2	6	194384	194389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_021235	GTT	2	6	194390	194395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_021235	AAC	2	6	194402	194407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_021235	TGGA	2	8	194438	194445	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_021235	TTG	2	6	194462	194467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021235	GAT	2	6	194491	194496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021235	GA	3	6	194510	194515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_021235	GCA	2	6	194564	194569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_021235	GTGA	2	8	194617	194624	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
626	NC_021235	TGT	2	6	194650	194655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_021235	AGA	2	6	194659	194664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_021235	CAG	2	6	194732	194737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_021235	AG	3	6	194787	194792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_021235	AGA	2	6	194873	194878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_021235	AT	3	6	194917	194922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021235	GAA	2	6	194924	194929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_021235	GGC	2	6	194943	194948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_021235	GAA	2	6	195187	195192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_021235	GGT	2	6	195261	195266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_021235	GTC	3	9	195272	195280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_021235	TCGTG	2	10	195284	195293	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
638	NC_021235	GGA	2	6	195387	195392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
639	NC_021235	GAC	2	6	195400	195405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_021235	ATC	2	6	195411	195416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_021235	AC	3	6	195438	195443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
642	NC_021235	GCAA	2	8	195485	195492	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
643	NC_021235	AC	3	6	195607	195612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
644	NC_021235	AGCC	2	8	195670	195677	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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647	NC_021235	ATA	2	6	195844	195849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
648	NC_021235	TAA	2	6	195858	195863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
649	NC_021235	AACT	2	8	195925	195932	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
650	NC_021235	ATC	2	6	196084	196089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
651	NC_021235	GAT	2	6	196096	196101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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654	NC_021235	GCG	2	6	196201	196206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
655	NC_021235	TC	3	6	196349	196354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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657	NC_021235	GGGAG	2	10	196486	196495	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
658	NC_021235	TC	3	6	196811	196816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
659	NC_021235	AT	3	6	197011	197016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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668	NC_021235	GA	3	6	197976	197981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
669	NC_021235	AATTG	2	10	197990	197999	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
670	NC_021235	TAC	2	6	198078	198083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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672	NC_021235	TGG	2	6	198140	198145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
673	NC_021235	TAC	2	6	198148	198153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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764	NC_021235	TGA	2	6	220693	220698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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771	NC_021235	CG	3	6	231375	231380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
772	NC_021235	GGC	2	6	231389	231394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
773	NC_021235	T	6	6	232396	232401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
774	NC_021235	A	6	6	232402	232407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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776	NC_021235	TTC	2	6	232440	232445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
777	NC_021235	GGA	2	6	232488	232493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
778	NC_021235	AAG	2	6	233455	233460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
779	NC_021235	CGG	2	6	234164	234169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
780	NC_021235	GTC	2	6	234277	234282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
781	NC_021235	CGG	2	6	234336	234341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
782	NC_021235	CGA	2	6	234408	234413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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784	NC_021235	GGT	2	6	234493	234498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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786	NC_021235	CGG	2	6	234672	234677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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942	NC_021235	AC	3	6	273865	273870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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948	NC_021235	TTG	2	6	274099	274104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
949	NC_021235	GGT	2	6	274153	274158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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