MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus fermentum F-6

Total Repeats: 6448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021235	TAGC	2	8	1915896	1915903	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6002	NC_021235	GT	3	6	1915908	1915913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_021235	GCGTG	2	10	1916995	1917004	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6004	NC_021235	TAA	2	6	1917012	1917017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_021235	AGGA	2	8	1917028	1917035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_021235	GAA	2	6	1918418	1918423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_021235	GTGC	2	8	1918426	1918433	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6008	NC_021235	GGC	2	6	1918564	1918569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_021235	GTC	2	6	1918608	1918613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_021235	TACCA	2	10	1918740	1918749	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6011	NC_021235	TCC	2	6	1919714	1919719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_021235	TGAA	2	8	1920227	1920234	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_021235	AGG	2	6	1921673	1921678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_021235	CAC	2	6	1921707	1921712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6015	NC_021235	GAA	2	6	1921735	1921740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_021235	GAG	2	6	1921791	1921796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_021235	CAG	2	6	1923206	1923211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_021235	AG	3	6	1923220	1923225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_021235	TAT	2	6	1923348	1923353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_021235	AT	3	6	1923352	1923357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_021235	ACA	2	6	1923374	1923379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_021235	ATT	2	6	1926184	1926189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_021235	TCA	2	6	1926194	1926199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_021235	CAA	2	6	1926234	1926239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_021235	CGC	2	6	1926411	1926416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6026	NC_021235	AATG	2	8	1926419	1926426	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_021235	ATT	2	6	1926431	1926436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_021235	AAAATT	2	12	1926450	1926461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_021235	A	7	7	1926484	1926490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_021235	T	6	6	1926514	1926519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_021235	A	6	6	1927252	1927257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_021235	T	6	6	1927275	1927280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_021235	ATTTT	2	10	1927484	1927493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_021235	AT	3	6	1929633	1929638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_021235	AAC	2	6	1929648	1929653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_021235	GTT	2	6	1929724	1929729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_021235	GAC	2	6	1929770	1929775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6038	NC_021235	GTC	2	6	1929817	1929822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_021235	A	6	6	1929866	1929871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_021235	GAAA	2	8	1930894	1930901	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_021235	ACTT	2	8	1930948	1930955	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6042	NC_021235	CTT	2	6	1935838	1935843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_021235	TCC	2	6	1935900	1935905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6044	NC_021235	TTCT	2	8	1935906	1935913	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6045	NC_021235	AAT	2	6	1935984	1935989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_021235	TAAT	2	8	1936071	1936078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_021235	TTCCA	2	10	1936819	1936828	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6048	NC_021235	A	7	7	1938648	1938654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_021235	AGTT	2	8	1938703	1938710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_021235	CTAG	2	8	1938722	1938729	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6051	NC_021235	A	6	6	1938784	1938789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_021235	AAT	2	6	1938822	1938827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_021235	TA	3	6	1938835	1938840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_021235	TAGT	2	8	1938884	1938891	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_021235	TAAT	2	8	1938895	1938902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_021235	TCC	2	6	1940644	1940649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_021235	CCA	2	6	1940718	1940723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_021235	GTT	2	6	1940758	1940763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_021235	A	6	6	1940771	1940776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_021235	GAT	2	6	1940780	1940785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_021235	T	6	6	1940806	1940811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_021235	CTC	2	6	1942160	1942165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6063	NC_021235	TAA	2	6	1942566	1942571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_021235	TCC	2	6	1943510	1943515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_021235	GTTTA	2	10	1943574	1943583	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_021235	TCA	2	6	1943584	1943589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_021235	CAA	2	6	1943604	1943609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_021235	AAT	2	6	1943661	1943666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_021235	ACA	2	6	1943689	1943694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6070	NC_021235	A	7	7	1943703	1943709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_021235	CCT	2	6	1944712	1944717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6072	NC_021235	ATT	2	6	1944742	1944747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_021235	AATA	2	8	1944763	1944770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_021235	GAA	2	6	1946520	1946525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_021235	AT	3	6	1948996	1949001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_021235	AGA	2	6	1949045	1949050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_021235	CTAA	2	8	1949094	1949101	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6078	NC_021235	CT	3	6	1949121	1949126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6079	NC_021235	GCA	2	6	1949148	1949153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_021235	AACC	2	8	1950171	1950178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6081	NC_021235	TCA	2	6	1950294	1950299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_021235	TC	3	6	1950332	1950337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6083	NC_021235	T	6	6	1950341	1950346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_021235	TCC	2	6	1950361	1950366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6085	NC_021235	C	7	7	1950384	1950390	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6086	NC_021235	GCTAG	2	10	1950454	1950463	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6087	NC_021235	TGGT	2	8	1950470	1950477	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_021235	TGTCC	2	10	1950558	1950567	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6089	NC_021235	A	6	6	1950629	1950634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_021235	TTAG	2	8	1950677	1950684	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_021235	TCC	2	6	1952227	1952232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6092	NC_021235	A	6	6	1952243	1952248	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_021235	TAT	2	6	1952263	1952268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_021235	AAT	2	6	1952294	1952299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_021235	ACCA	2	8	1952445	1952452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6096	NC_021235	AAG	2	6	1952553	1952558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_021235	T	6	6	1952658	1952663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_021235	ACT	2	6	1953192	1953197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_021235	TTTA	2	8	1953216	1953223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6100	NC_021235	TAA	3	9	1953244	1953252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_021235	CTC	2	6	1953262	1953267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6102	NC_021235	AAT	2	6	1953275	1953280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_021235	ATT	3	9	1953285	1953293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_021235	GTA	2	6	1953303	1953308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_021235	ACA	2	6	1953319	1953324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_021235	A	7	7	1953324	1953330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_021235	ACC	2	6	1953332	1953337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_021235	T	6	6	1953363	1953368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_021235	TTCAA	2	10	1955806	1955815	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6110	NC_021235	TATGC	2	10	1957561	1957570	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6111	NC_021235	ATACC	2	10	1957585	1957594	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6112	NC_021235	ATT	2	6	1957622	1957627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_021235	AAGG	2	8	1958963	1958970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_021235	CCT	2	6	1960428	1960433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6115	NC_021235	AGCTA	2	10	1960447	1960456	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6116	NC_021235	TTC	2	6	1960483	1960488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_021235	ACCA	2	8	1960542	1960549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6118	NC_021235	GCAC	2	8	1960591	1960598	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6119	NC_021235	ACCA	2	8	1960661	1960668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6120	NC_021235	GAA	2	6	1961610	1961615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_021235	TTC	2	6	1961625	1961630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_021235	GAA	2	6	1961772	1961777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_021235	TAGCT	2	10	1961805	1961814	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6124	NC_021235	GGGAC	2	10	1962938	1962947	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6125	NC_021235	TAA	2	6	1962981	1962986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_021235	CCG	2	6	1963007	1963012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_021235	C	6	6	1964468	1964473	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6128	NC_021235	AAT	2	6	1964500	1964505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_021235	AGG	2	6	1964507	1964512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_021235	GCC	2	6	1965041	1965046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6131	NC_021235	GGC	2	6	1965049	1965054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_021235	ATCA	2	8	1965152	1965159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6134	NC_021235	TCC	2	6	1965668	1965673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6399	NC_021235	TGATA	2	10	2047537	2047546	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6400	NC_021235	ATG	2	6	2047557	2047562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6401	NC_021235	AAAC	2	8	2048012	2048019	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6402	NC_021235	ATCC	2	8	2048053	2048060	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6403	NC_021235	ATTA	2	8	2048092	2048099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6404	NC_021235	CGA	2	6	2048106	2048111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6405	NC_021235	TCG	2	6	2048127	2048132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6406	NC_021235	ACA	2	6	2048796	2048801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6407	NC_021235	TC	3	6	2053884	2053889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6408	NC_021235	TA	3	6	2053920	2053925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6409	NC_021235	TTTTA	2	10	2054029	2054038	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6410	NC_021235	AGAA	2	8	2054079	2054086	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6411	NC_021235	CTT	2	6	2054090	2054095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6412	NC_021235	CAA	2	6	2055594	2055599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6413	NC_021235	GCG	2	6	2055653	2055658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6414	NC_021235	GGT	2	6	2056080	2056085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6415	NC_021235	CAC	2	6	2056089	2056094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6416	NC_021235	TAA	2	6	2056108	2056113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6417	NC_021235	GGAT	2	8	2056147	2056154	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6418	NC_021235	ATT	3	9	2056631	2056639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6419	NC_021235	AGG	2	6	2056677	2056682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6420	NC_021235	GTG	2	6	2058029	2058034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6421	NC_021235	TCA	2	6	2058062	2058067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6422	NC_021235	TGCT	2	8	2058074	2058081	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6423	NC_021235	GTG	2	6	2058104	2058109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6424	NC_021235	TG	3	6	2058187	2058192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6425	NC_021235	TCA	2	6	2058233	2058238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6426	NC_021235	TTA	2	6	2058295	2058300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6427	NC_021235	TTC	2	6	2060227	2060232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6428	NC_021235	A	6	6	2061648	2061653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6429	NC_021235	ACT	2	6	2061705	2061710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6430	NC_021235	TATT	2	8	2061735	2061742	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6431	NC_021235	GCCC	2	8	2061754	2061761	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6432	NC_021235	A	8	8	2062605	2062612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6433	NC_021235	CT	3	6	2063503	2063508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6434	NC_021235	AGTC	2	8	2063856	2063863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6435	NC_021235	A	6	6	2063880	2063885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6436	NC_021235	ACA	2	6	2063905	2063910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6437	NC_021235	CTGCC	2	10	2063930	2063939	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6438	NC_021235	TAACG	2	10	2063955	2063964	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6439	NC_021235	CTT	2	6	2064076	2064081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6440	NC_021235	CCT	2	6	2064112	2064117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6441	NC_021235	AGC	2	6	2064119	2064124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6442	NC_021235	T	7	7	2064128	2064134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6443	NC_021235	TTA	2	6	2064142	2064147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6444	NC_021235	CT	3	6	2064170	2064175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6445	NC_021235	CA	3	6	2064500	2064505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6447	NC_021235	T	6	6	2064583	2064588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6448	NC_021235	AGG	2	6	2064608	2064613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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