MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp1

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021233	ATTG	2	8	1128	1135	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021233	TTAA	2	8	1256	1263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021233	ACTA	2	8	7242	7249	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021233	ATAG	2	8	7749	7756	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021233	AGTT	2	8	8217	8224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021233	CGCA	2	8	8618	8625	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021233	ACTA	2	8	8762	8769	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021233	ACGA	2	8	8918	8925	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021233	CGTG	2	8	9888	9895	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021233	GAAA	2	8	12673	12680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021233	AAAT	2	8	12887	12894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021233	ATAA	2	8	13307	13314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021233	AATT	3	12	13918	13929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021233	TGAA	2	8	15009	15016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021233	GGCT	2	8	15018	15025	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021233	ATTT	2	8	16545	16552	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021233	AAAT	2	8	16562	16569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021233	TCGA	2	8	16586	16593	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021233	ATCA	2	8	16934	16941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021233	ATTG	2	8	16951	16958	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021233	TCTT	2	8	17385	17392	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021233	AGGC	2	8	17927	17934	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021233	TTAA	2	8	17950	17957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021233	TAAA	2	8	17987	17994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021233	AATT	2	8	20115	20122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021233	ATTA	2	8	20413	20420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021233	CCTG	2	8	20622	20629	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021233	TTAT	2	8	20875	20882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021233	TATT	2	8	20888	20895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021233	ATAG	2	8	20900	20907	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021233	TAAG	2	8	21031	21038	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021233	ATTT	2	8	21620	21627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021233	AGTT	2	8	21850	21857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021233	GATG	2	8	21926	21933	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021233	CAAA	2	8	25087	25094	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021233	AAGC	2	8	25854	25861	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_021233	TTAG	2	8	26975	26982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021233	CGAT	2	8	27047	27054	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021233	GGTG	2	8	34289	34296	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021233	ATTG	2	8	34324	34331	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021233	TGTA	2	8	34386	34393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021233	CACC	2	8	35957	35964	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_021233	AACA	2	8	36225	36232	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021233	CGAC	2	8	36351	36358	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021233	CTTT	2	8	40924	40931	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021233	ATGA	2	8	41024	41031	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021233	CTAC	2	8	44839	44846	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021233	GAAT	2	8	45019	45026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021233	GTTT	2	8	45446	45453	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021233	AAGA	2	8	45536	45543	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021233	GCCA	2	8	45725	45732	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021233	TTAG	2	8	45876	45883	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021233	AGTA	2	8	47071	47078	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021233	AATG	2	8	48365	48372	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.