MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp1

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021233	CTT	2	6	1074	1079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021233	GTT	2	6	1175	1180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021233	TGA	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021233	GAG	2	6	1401	1406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021233	GCT	2	6	4388	4393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021233	AAG	2	6	4437	4442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021233	CGT	2	6	4857	4862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021233	CAG	2	6	4875	4880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021233	ATA	2	6	4913	4918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021233	CTT	2	6	5462	5467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021233	TGT	2	6	6756	6761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021233	CTG	2	6	6857	6862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021233	CTG	2	6	6882	6887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021233	TTG	2	6	6888	6893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021233	CAA	2	6	6982	6987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021233	AAC	2	6	7049	7054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021233	AGT	2	6	7434	7439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021233	TAT	2	6	7513	7518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021233	AAG	2	6	7619	7624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021233	TTA	2	6	7763	7768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021233	TAA	2	6	7769	7774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021233	AGT	2	6	7848	7853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021233	GTA	2	6	7882	7887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021233	ATT	2	6	7892	7897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021233	AGT	2	6	7919	7924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021233	TAA	2	6	8025	8030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021233	TAA	2	6	8045	8050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021233	TAT	2	6	8420	8425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021233	TAG	2	6	8541	8546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021233	ACT	2	6	8576	8581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021233	CTT	2	6	8700	8705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021233	TTA	2	6	8770	8775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021233	AGC	2	6	8787	8792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021233	AAT	2	6	8799	8804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021233	TGT	2	6	8895	8900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021233	AAC	2	6	9046	9051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021233	GTA	2	6	9128	9133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021233	TTA	2	6	9219	9224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021233	TAA	2	6	9950	9955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021233	CAG	2	6	10674	10679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021233	TAA	2	6	10709	10714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021233	CTA	2	6	10892	10897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021233	GAA	2	6	12060	12065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021233	GAA	2	6	12144	12149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021233	TGA	2	6	12194	12199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021233	GCG	2	6	12247	12252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021233	ATT	2	6	12400	12405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021233	TAC	2	6	12418	12423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_021233	TAC	2	6	12492	12497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021233	TAT	2	6	12534	12539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021233	GAA	3	9	12545	12553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021233	AGC	2	6	12692	12697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021233	ACG	2	6	12881	12886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021233	GAA	2	6	12970	12975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021233	TTA	2	6	13220	13225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021233	ATT	2	6	13257	13262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021233	ATT	2	6	13814	13819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021233	GTT	2	6	13911	13916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021233	CTG	2	6	13998	14003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021233	GAG	2	6	14947	14952	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021233	ATA	2	6	15452	15457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021233	AAT	2	6	15458	15463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021233	ATG	2	6	15472	15477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021233	AAG	2	6	15487	15492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021233	TCA	2	6	15601	15606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021233	CAT	2	6	15671	15676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021233	GAT	2	6	16277	16282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021233	TGT	2	6	16358	16363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021233	ATC	2	6	16455	16460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021233	AGA	2	6	16501	16506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021233	ATA	2	6	16517	16522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021233	AGG	2	6	16577	16582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021233	TGA	2	6	16604	16609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021233	TTA	2	6	16708	16713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021233	CAC	2	6	16836	16841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_021233	CTT	2	6	17048	17053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021233	GAT	2	6	17071	17076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021233	ATC	2	6	17144	17149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_021233	TGA	2	6	17190	17195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021233	TTG	2	6	17224	17229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021233	CCA	2	6	17237	17242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_021233	TGA	2	6	17361	17366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021233	ATT	2	6	17405	17410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021233	AAC	2	6	17720	17725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021233	TTG	2	6	17741	17746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021233	ATG	2	6	17789	17794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021233	AGA	2	6	17894	17899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021233	TCC	2	6	19242	19247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_021233	TCT	2	6	20096	20101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021233	TTA	2	6	20475	20480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021233	ATA	2	6	20492	20497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021233	GTT	2	6	20580	20585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021233	TCA	2	6	20937	20942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_021233	AAT	2	6	21663	21668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021233	AGT	2	6	21699	21704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021233	ATA	2	6	21910	21915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021233	CAA	2	6	21989	21994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_021233	TAA	2	6	21996	22001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021233	TAT	2	6	22061	22066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021233	TAA	2	6	22083	22088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021233	TCT	2	6	24057	24062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_021233	TTC	2	6	24116	24121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_021233	ATT	2	6	24229	24234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021233	TAG	2	6	24925	24930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021233	AAT	2	6	24944	24949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021233	GAA	2	6	24959	24964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021233	ATA	2	6	24986	24991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021233	ATC	2	6	24999	25004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021233	GAA	2	6	25081	25086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021233	ATG	2	6	25198	25203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021233	TAT	2	6	25257	25262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021233	AAC	2	6	25270	25275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021233	ATA	3	9	25277	25285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021233	GAC	2	6	25358	25363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021233	GTT	2	6	26628	26633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021233	GTC	2	6	27002	27007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_021233	TAA	2	6	27061	27066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021233	CCT	2	6	28104	28109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_021233	ATT	2	6	28136	28141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021233	CAA	2	6	28176	28181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021233	ATC	2	6	29623	29628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_021233	AGT	2	6	31259	31264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021233	AAG	2	6	31510	31515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021233	TGC	2	6	31517	31522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021233	ATA	2	6	34422	34427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021233	GTC	2	6	34493	34498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021233	GAT	2	6	35717	35722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021233	TCT	2	6	35765	35770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021233	AAC	2	6	35914	35919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_021233	TAT	2	6	36011	36016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021233	CAA	2	6	36118	36123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021233	GTG	2	6	36142	36147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021233	GGT	2	6	36176	36181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021233	CTA	2	6	36253	36258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021233	GTG	2	6	36304	36309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021233	TGA	2	6	36517	36522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021233	CTC	2	6	36857	36862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_021233	GTT	2	6	36898	36903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021233	TTA	2	6	37354	37359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021233	CAA	2	6	39050	39055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021233	ATT	2	6	40076	40081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.