MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp3

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021226	ATC	2	6	78	83	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021226	CCA	2	6	175	180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_021226	TAG	2	6	229	234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021226	CGG	2	6	371	376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_021226	ATT	2	6	397	402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021226	GAA	2	6	437	442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021226	CAA	3	9	455	463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021226	CAT	2	6	543	548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021226	TTA	2	6	1571	1576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021226	ATT	2	6	5617	5622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021226	AGG	2	6	5727	5732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021226	TGA	2	6	7455	7460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021226	ATT	2	6	8203	8208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021226	CAA	2	6	8224	8229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021226	CAT	2	6	8549	8554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021226	TAA	2	6	8620	8625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021226	TCC	2	6	8689	8694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_021226	GTA	2	6	8837	8842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021226	GTC	2	6	9493	9498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021226	GTC	2	6	9610	9615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021226	TGG	2	6	9767	9772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021226	TAG	2	6	9803	9808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021226	CCT	2	6	10832	10837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021226	ATT	2	6	10856	10861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021226	AAT	2	6	10944	10949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021226	CTT	2	6	12063	12068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021226	TGT	2	6	12127	12132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021226	AAG	2	6	12165	12170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021226	GAA	2	6	12365	12370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021226	TTG	2	6	13523	13528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021226	TAT	2	6	13574	13579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021226	ATG	2	6	13580	13585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021226	ATT	2	6	13596	13601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021226	AGT	2	6	13646	13651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021226	AAG	2	6	13656	13661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021226	TAT	2	6	13744	13749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021226	CAA	2	6	13851	13856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021226	GTG	2	6	13875	13880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021226	GGT	2	6	13909	13914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021226	GTG	2	6	14037	14042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021226	TAG	3	9	14110	14118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021226	GAA	2	6	14397	14402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021226	TAG	2	6	14404	14409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021226	CTT	2	6	14599	14604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021226	GGT	2	6	14660	14665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021226	GCC	2	6	14678	14683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_021226	TAG	2	6	14787	14792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021226	TAT	2	6	14968	14973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021226	CTG	2	6	15005	15010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021226	CTC	2	6	15017	15022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_021226	GAA	2	6	16509	16514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021226	ATT	2	6	16548	16553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021226	GTT	2	6	16629	16634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021226	TTG	2	6	16702	16707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021226	AGA	2	6	16724	16729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021226	TCA	2	6	16734	16739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021226	GCT	2	6	18300	18305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021226	TGG	2	6	18309	18314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021226	ATT	2	6	18370	18375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021226	TGC	2	6	19498	19503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021226	ATC	2	6	19548	19553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021226	TCA	2	6	19588	19593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021226	ATC	2	6	19614	19619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_021226	ATG	2	6	19640	19645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021226	CAG	2	6	20215	20220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021226	TAA	2	6	20250	20255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021226	CTA	2	6	20433	20438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021226	GAC	2	6	20588	20593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021226	GAA	2	6	20594	20599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021226	GTA	2	6	21024	21029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021226	GTA	2	6	21035	21040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021226	AGA	2	6	22468	22473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021226	TCA	2	6	22507	22512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021226	ACA	2	6	22567	22572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021226	TCC	2	6	29125	29130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_021226	TTC	2	6	29733	29738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021226	AAT	2	6	29831	29836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021226	GCC	2	6	29953	29958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_021226	TAT	2	6	30074	30079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021226	CCT	2	6	31451	31456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_021226	AAC	2	6	31537	31542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021226	TTA	2	6	33276	33281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021226	GAG	2	6	33349	33354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021226	GAA	3	9	33355	33363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021226	AAG	2	6	36693	36698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021226	GAA	2	6	36750	36755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021226	GCT	2	6	36756	36761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021226	TGG	2	6	36847	36852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021226	TTC	2	6	36869	36874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021226	TAG	2	6	37754	37759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021226	ACT	2	6	37778	37783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021226	AGC	2	6	37877	37882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021226	ATT	2	6	37985	37990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021226	AAC	2	6	38030	38035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021226	AAG	2	6	38128	38133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021226	GCA	2	6	38157	38162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021226	ATA	2	6	38169	38174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021226	TAG	2	6	38685	38690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021226	TAT	2	6	38866	38871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021226	CTG	2	6	38903	38908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021226	CTC	2	6	38915	38920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.