MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp3

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021226	ACGA	2	8	18	25	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021226	ATC	2	6	78	83	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_021226	CCA	2	6	175	180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_021226	TAG	2	6	229	234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021226	CGG	2	6	371	376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_021226	ATT	2	6	397	402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021226	GAA	2	6	437	442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021226	CAA	3	9	455	463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021226	TAAT	2	8	467	474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021226	AAATT	2	10	512	521	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021226	CAT	2	6	543	548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021226	C	6	6	1476	1481	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_021226	TTA	2	6	1571	1576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021226	TAAA	2	8	1605	1612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021226	GCCG	2	8	5570	5577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021226	ATT	2	6	5617	5622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021226	AGG	2	6	5727	5732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021226	CATTT	2	10	6944	6953	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021226	TTCG	2	8	7314	7321	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021226	T	6	6	7399	7404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021226	TGA	2	6	7455	7460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021226	ATT	2	6	8203	8208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021226	CAA	2	6	8224	8229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021226	CTAA	2	8	8242	8249	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021226	CAT	2	6	8549	8554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021226	CT	3	6	8556	8561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021226	T	6	6	8578	8583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021226	TAA	2	6	8620	8625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021226	TCC	2	6	8689	8694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_021226	TAAT	2	8	8788	8795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021226	GTA	2	6	8837	8842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021226	CCAA	2	8	8850	8857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021226	GTC	2	6	9493	9498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021226	TAAA	2	8	9573	9580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021226	TTGG	2	8	9594	9601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021226	GTC	2	6	9610	9615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021226	TGG	2	6	9767	9772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021226	G	6	6	9771	9776	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021226	AC	3	6	9777	9782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021226	TAG	2	6	9803	9808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021226	A	7	7	9809	9815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021226	ATTT	2	8	9849	9856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021226	CCT	2	6	10832	10837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_021226	GT	3	6	10847	10852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021226	ATT	2	6	10856	10861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021226	AT	3	6	10865	10870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021226	AAT	2	6	10944	10949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021226	A	6	6	11052	11057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021226	A	6	6	11335	11340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021226	CTT	2	6	12063	12068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021226	TTTTA	2	10	12071	12080	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021226	TGT	2	6	12127	12132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021226	AAG	2	6	12165	12170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021226	T	6	6	12258	12263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021226	T	6	6	12268	12273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021226	T	6	6	12297	12302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021226	GAA	2	6	12365	12370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021226	AT	3	6	13335	13340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021226	TTG	2	6	13523	13528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021226	TAT	2	6	13574	13579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021226	ATG	2	6	13580	13585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021226	ATT	2	6	13596	13601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021226	AGT	2	6	13646	13651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021226	AAG	2	6	13656	13661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021226	A	6	6	13670	13675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021226	A	8	8	13682	13689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021226	CACC	2	8	13690	13697	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_021226	TAT	2	6	13744	13749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021226	CAA	2	6	13851	13856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021226	GTG	2	6	13875	13880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021226	GGT	2	6	13909	13914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021226	AACA	2	8	13958	13965	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021226	T	6	6	13997	14002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021226	GTG	2	6	14037	14042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021226	CGAC	2	8	14084	14091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021226	TAG	3	9	14110	14118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021226	GAA	2	6	14397	14402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021226	TAG	2	6	14404	14409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021226	CTT	2	6	14599	14604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_021226	T	6	6	14603	14608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021226	GGT	2	6	14660	14665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021226	GCC	2	6	14678	14683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_021226	GATTT	2	10	14718	14727	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021226	TAG	2	6	14787	14792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021226	TC	3	6	14798	14803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021226	TAT	2	6	14968	14973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021226	CTG	2	6	15005	15010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021226	CTC	2	6	15017	15022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_021226	A	7	7	15036	15042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021226	GAA	2	6	16509	16514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021226	ATT	2	6	16548	16553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021226	GTT	2	6	16629	16634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021226	TTG	2	6	16702	16707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021226	AGA	2	6	16724	16729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021226	TCA	2	6	16734	16739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_021226	T	6	6	16808	16813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021226	TAAT	2	8	18236	18243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021226	GCT	2	6	18300	18305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021226	TGG	2	6	18309	18314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021226	ATT	2	6	18370	18375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021226	ATGAT	2	10	18979	18988	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021226	AACC	2	8	18996	19003	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021226	TGC	2	6	19498	19503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021226	TA	3	6	19536	19541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021226	ATC	2	6	19548	19553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021226	AT	3	6	19562	19567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021226	T	6	6	19578	19583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021226	TCA	2	6	19588	19593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021226	ATC	2	6	19614	19619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021226	ATG	2	6	19640	19645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021226	T	7	7	20183	20189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021226	CAG	2	6	20215	20220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021226	TAA	2	6	20250	20255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021226	GA	3	6	20422	20427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021226	CTA	2	6	20433	20438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021226	AAATC	2	10	20498	20507	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_021226	GAC	2	6	20588	20593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021226	GAA	2	6	20594	20599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021226	C	7	7	20861	20867	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
120	NC_021226	GTA	2	6	21024	21029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021226	GTA	2	6	21035	21040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021226	AAAAG	2	10	21043	21052	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021226	AGA	2	6	22468	22473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021226	TCA	2	6	22507	22512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021226	ACA	2	6	22567	22572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_021226	AAATC	2	10	24683	24692	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_021226	TCC	2	6	29125	29130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_021226	TA	3	6	29145	29150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021226	CT	3	6	29174	29179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021226	CAAA	2	8	29678	29685	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021226	A	6	6	29704	29709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021226	AC	3	6	29711	29716	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021226	TTC	2	6	29733	29738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021226	CAAG	2	8	29765	29772	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021226	AAT	2	6	29831	29836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021226	ACAT	2	8	29922	29929	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_021226	A	6	6	29947	29952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021226	GCC	2	6	29953	29958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_021226	TAT	2	6	30074	30079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021226	AT	3	6	31445	31450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021226	CCT	2	6	31451	31456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_021226	AAC	2	6	31537	31542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021226	TC	3	6	32561	32566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021226	T	7	7	32610	32616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021226	T	8	8	33257	33264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021226	TTA	2	6	33276	33281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021226	TCCA	2	8	33295	33302	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021226	GAG	2	6	33349	33354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021226	GAA	3	9	33355	33363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021226	ATAA	2	8	36650	36657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021226	AAG	2	6	36693	36698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021226	GAA	2	6	36750	36755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021226	GCT	2	6	36756	36761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_021226	T	6	6	36819	36824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021226	TGG	2	6	36847	36852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021226	TTC	2	6	36869	36874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_021226	T	6	6	36883	36888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021226	GC	3	6	36997	37002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
159	NC_021226	TC	3	6	37723	37728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_021226	TAG	2	6	37754	37759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_021226	ACT	2	6	37778	37783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_021226	TTGG	2	8	37849	37856	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021226	AGC	2	6	37877	37882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_021226	GGGAA	2	10	37887	37896	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
165	NC_021226	AAAT	2	8	37907	37914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_021226	ATT	2	6	37985	37990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_021226	TA	3	6	38002	38007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021226	AAC	2	6	38030	38035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_021226	AAAT	2	8	38104	38111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_021226	AAG	2	6	38128	38133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_021226	A	8	8	38148	38155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021226	GCA	2	6	38157	38162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_021226	ATA	2	6	38169	38174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021226	AAAG	2	8	38196	38203	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
175	NC_021226	T	6	6	38255	38260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_021226	GATTT	2	10	38616	38625	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
177	NC_021226	TAG	2	6	38685	38690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NC_021226	TC	3	6	38696	38701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
179	NC_021226	TAT	2	6	38866	38871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_021226	CTG	2	6	38903	38908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_021226	CTC	2	6	38915	38920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_021226	A	7	7	38934	38940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.