MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021224	CAACTA	2	12	55469	55480	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021224	GTTAAC	2	12	152002	152013	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021224	AAAGAT	2	12	199454	199465	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021224	AAAAGT	2	12	210906	210917	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021224	ATTAGA	2	12	348506	348517	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021224	AGAAGC	2	12	348794	348805	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021224	ACTAAT	2	12	469045	469056	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021224	TTTTTA	2	12	469488	469499	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021224	ATTAAG	2	12	469999	470010	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021224	TTAAAA	2	12	508869	508880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021224	TCTAAT	2	12	513793	513804	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_021224	TTGAGG	2	12	562909	562920	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021224	AAATTA	2	12	573481	573492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021224	ATAATT	2	12	667462	667473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021224	TTCTCT	2	12	667747	667758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021224	TCAATT	2	12	695056	695067	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021224	TATCAT	2	12	700924	700935	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_021224	ATGATT	2	12	706102	706113	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021224	TGAAAC	2	12	745039	745050	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021224	ACGATG	2	12	765997	766008	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_021224	AATTAT	2	12	779656	779667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021224	TTGACC	2	12	780855	780866	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021224	GTATTC	2	12	783344	783355	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_021224	TCAATT	2	12	787054	787065	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_021224	TTAAAC	2	12	809381	809392	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021224	TTACAT	2	12	884250	884261	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021224	ATAATT	2	12	952720	952731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021224	AAATCA	2	12	953650	953661	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021224	TTTTTA	2	12	961216	961227	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021224	ACTAAT	2	12	1027510	1027521	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021224	ACCATG	2	12	1036515	1036526	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021224	ACAATT	2	12	1049034	1049045	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021224	AGCGAC	2	12	1049775	1049786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021224	GATTCT	2	12	1049808	1049819	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021224	GATTCT	2	12	1049844	1049855	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_021224	TGATTC	2	12	1049897	1049908	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_021224	AGCGAC	2	12	1049931	1049942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021224	GATTCG	2	12	1049976	1049987	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021224	GACTCG	2	12	1049994	1050005	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021224	GACTCG	2	12	1050048	1050059	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021224	CGACAG	2	12	1050113	1050124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021224	GATAGC	2	12	1050168	1050179	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021224	CGACAG	2	12	1050191	1050202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021224	TCGGAT	2	12	1050297	1050308	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021224	TCGGAT	2	12	1050333	1050344	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021224	TCCGAC	2	12	1050375	1050386	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021224	TCGGAT	2	12	1050411	1050422	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_021224	TCGGAT	2	12	1050519	1050530	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021224	GATAGC	2	12	1050630	1050641	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021224	GACTCC	2	12	1050714	1050725	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021224	GACTCA	2	12	1050822	1050833	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021224	TCCGAC	2	12	1050879	1050890	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021224	TCCGAC	2	12	1050933	1050944	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021224	CGATTC	2	12	1051091	1051102	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021224	TCGGAT	2	12	1051143	1051154	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021224	TCAGAC	2	12	1051161	1051172	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_021224	TCGGAT	2	12	1051179	1051190	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021224	TCAGAC	2	12	1051197	1051208	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_021224	TCAGAC	2	12	1051251	1051262	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021224	AGCGAC	2	12	1051293	1051304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021224	AGCGAC	2	12	1051383	1051394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021224	CGATTC	2	12	1051427	1051438	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_021224	GATTCG	2	12	1051446	1051457	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021224	GATTCG	2	12	1051614	1051625	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_021224	GACAGC	2	12	1051716	1051727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021224	GACTCA	2	12	1051890	1051901	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021224	CGATTC	2	12	1051961	1051972	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021224	TCGGAT	2	12	1052007	1052018	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021224	TCGGAC	2	12	1052115	1052126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021224	GATTCG	2	12	1052220	1052231	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_021224	CAGATT	2	12	1052542	1052553	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021224	GATAAG	2	12	1052931	1052942	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021224	TAATTG	2	12	1095772	1095783	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021224	TCCGGT	2	12	1106667	1106678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021224	TTTGAT	2	12	1124999	1125010	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021224	TTTGCT	2	12	1163628	1163639	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021224	TTCGGC	2	12	1219056	1219067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021224	GAATTA	2	12	1230406	1230417	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021224	GTTATA	2	12	1272902	1272913	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021224	TTAATG	2	12	1324499	1324510	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021224	TGGTGC	2	12	1345158	1345169	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021224	TTATGA	2	12	1401470	1401481	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021224	ACCGTT	2	12	1442041	1442052	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021224	CATAAC	2	12	1450620	1450631	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021224	AATCAT	2	12	1472332	1472343	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_021224	TCATTA	2	12	1491161	1491172	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021224	TTGACG	2	12	1529111	1529122	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021224	CAAACT	2	12	1595049	1595060	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_021224	GCACAA	2	12	1636213	1636224	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021224	TGGCCT	2	12	1643647	1643658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021224	TACAGA	2	12	1686787	1686798	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021224	CACCTA	2	12	1693796	1693807	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021224	AATTCA	2	12	1735670	1735681	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021224	TAAATT	2	12	1762065	1762076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021224	CGACAC	2	12	1796514	1796525	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021224	TGCCAA	2	12	1814163	1814174	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021224	CAGTTT	2	12	1815273	1815284	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_021224	ATTAGT	2	12	1874960	1874971	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021224	ACAACC	2	12	1898676	1898687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021224	CCAAAA	2	12	1899914	1899925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021224	CTTTAA	2	12	1922315	1922326	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021224	TTTTAT	2	12	1977348	1977359	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021224	TTTCAT	2	12	2002330	2002341	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_021224	TTAAAA	2	12	2002595	2002606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021224	TAACCT	2	12	2003367	2003378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021224	AAAGCA	2	12	2068029	2068040	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021224	ACTTGA	2	12	2081687	2081698	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_021224	CAATAT	2	12	2090699	2090710	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_021224	ACCATA	2	12	2093281	2093292	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_021224	TTACCG	2	12	2099957	2099968	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_021224	AATTCA	2	12	2111315	2111326	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_021224	AATTTA	2	12	2113865	2113876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021224	TAAAAT	2	12	2132451	2132462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021224	GGCTAA	2	12	2149969	2149980	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_021224	AAACTG	2	12	2153868	2153879	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_021224	CCGTCG	2	12	2164107	2164118	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021224	CTTTGT	2	12	2164583	2164594	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_021224	TTCATC	2	12	2202878	2202889	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_021224	ATTTTG	2	12	2205796	2205807	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021224	AAACTA	2	12	2226494	2226505	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_021224	TTAATA	2	12	2232564	2232575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021224	TTTTCA	2	12	2262602	2262613	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_021224	GAATAT	2	12	2300223	2300234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021224	AATCAC	2	12	2335059	2335070	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021224	TCATCC	2	12	2340551	2340562	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_021224	TCTTAA	2	12	2348299	2348310	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021224	ATTAGT	2	12	2348774	2348785	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021224	CTCATT	2	12	2369614	2369625	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021224	TAGGAC	2	12	2378573	2378584	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_021224	CACTGA	2	12	2399835	2399846	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021224	TAAAAT	2	12	2428530	2428541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021224	GAGCCG	2	12	2433517	2433528	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021224	ATGCAA	2	12	2491573	2491584	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_021224	CCGTTG	2	12	2492871	2492882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021224	CATCGT	2	12	2493511	2493522	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_021224	GTATTT	2	12	2497905	2497916	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021224	CTATTT	2	12	2536055	2536066	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_021224	TACTTT	2	12	2536076	2536087	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_021224	TAATTA	2	12	2602526	2602537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021224	ACTAAT	2	12	2653054	2653065	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_021224	AAAGAT	2	12	2653672	2653683	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021224	TAGTTT	2	12	2659859	2659870	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021224	TTTTTA	2	12	2665087	2665098	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021224	AGCGAC	2	12	2678467	2678478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021224	TGATTT	2	12	2683838	2683849	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021224	ATAATC	2	12	2739743	2739754	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_021224	TAATCG	2	12	2744941	2744952	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_021224	ATTAGT	2	12	2761985	2761996	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021224	TCAGAA	2	12	2786037	2786048	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_021224	ATTAAT	2	12	2788678	2788689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021224	CGTAAA	2	12	2810906	2810917	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_021224	CGGATT	2	12	2811799	2811810	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
153	NC_021224	ACAAAG	2	12	2819908	2819919	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_021224	AGAAAA	2	12	2829317	2829328	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021224	ATACCA	2	12	2847915	2847926	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_021224	TTATTT	2	12	2848068	2848079	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021224	TAATCA	2	12	2855508	2855519	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_021224	AAAGCA	2	12	2867158	2867169	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_021224	ACTTCA	2	12	2881285	2881296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_021224	TCTATT	2	12	2959795	2959806	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_021224	TACGTC	2	12	2962940	2962951	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_021224	ATTAAA	2	12	2975677	2975688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021224	TTAAAA	2	12	3014354	3014365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_021224	GCCATC	2	12	3021842	3021853	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
165	NC_021224	TAACGG	2	12	3029182	3029193	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.