MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 DNA

Total Repeats: 242

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020819	TATAA	2	10	3265	3274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020819	GTGTG	2	10	9547	9556	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020819	TAATT	2	10	26092	26101	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020819	AAGCG	2	10	31364	31373	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020819	TATCA	2	10	31558	31567	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_020819	CTAAA	2	10	44757	44766	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020819	TAAAA	2	10	49163	49172	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020819	TGCGT	2	10	66284	66293	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020819	CTGAT	2	10	66301	66310	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020819	GGACC	2	10	71915	71924	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_020819	GATAT	2	10	73192	73201	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020819	CAAAT	2	10	73356	73365	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_020819	TCGTG	2	10	74567	74576	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020819	GCTAA	2	10	74767	74776	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020819	TTGGT	2	10	80008	80017	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020819	CGGGC	2	10	83225	83234	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
17	NC_020819	TTTAA	2	10	89660	89669	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020819	TTAAA	2	10	91643	91652	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020819	TCACT	2	10	92743	92752	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_020819	TCATT	3	15	106265	106279	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020819	ACTAA	2	10	106429	106438	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_020819	TCTAT	2	10	151877	151886	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_020819	GATAA	2	10	152980	152989	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020819	AAAAG	2	10	165921	165930	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020819	GACTA	2	10	170754	170763	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020819	CGTGG	2	10	183838	183847	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020819	TAGAA	2	10	184933	184942	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020819	TTTTA	2	10	184981	184990	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020819	GCAGG	2	10	186394	186403	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020819	ATAGC	2	10	186461	186470	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_020819	AATTC	2	10	187422	187431	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020819	TAGAA	2	10	204489	204498	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020819	ATTGT	2	10	219880	219889	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020819	ATATA	2	10	223118	223127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020819	TAGTT	2	10	237519	237528	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020819	TTGAA	2	10	257840	257849	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020819	AGTAT	2	10	265919	265928	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020819	ATTTG	2	10	292502	292511	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020819	ACTAG	2	10	299091	299100	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020819	GGATG	2	10	308278	308287	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020819	TCATG	2	10	312015	312024	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_020819	CTAGT	2	10	317450	317459	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_020819	AACTG	2	10	320896	320905	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020819	AATTG	2	10	329554	329563	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020819	AAAAT	2	10	329722	329731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020819	TTATT	2	10	333658	333667	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020819	GTAAA	2	10	359584	359593	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020819	TTGGG	2	10	369488	369497	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020819	GGCTG	2	10	370878	370887	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_020819	TTTAA	2	10	383165	383174	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020819	AGCTT	2	10	428461	428470	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_020819	GGTGA	2	10	443965	443974	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020819	ATAAA	2	10	444745	444754	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020819	GATAT	2	10	448048	448057	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020819	ATGAT	2	10	448141	448150	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020819	TCGTG	2	10	449423	449432	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_020819	GCTAA	2	10	449623	449632	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_020819	TTATT	2	10	467065	467074	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020819	CAGTC	2	10	467203	467212	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_020819	ATACG	2	10	489342	489351	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_020819	TCCCC	2	10	497296	497305	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
62	NC_020819	GAGAT	2	10	497404	497413	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020819	TGAAA	2	10	508394	508403	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020819	AAGCC	2	10	510828	510837	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_020819	TGGCA	2	10	510948	510957	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_020819	TGAAT	2	10	534037	534046	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020819	AAAGC	2	10	549949	549958	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_020819	CTATA	2	10	559480	559489	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_020819	GGTAA	2	10	571175	571184	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020819	TCGTG	2	10	574705	574714	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_020819	GCTAA	2	10	574905	574914	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_020819	AAATA	2	10	579022	579031	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020819	TTTTA	2	10	593694	593703	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020819	ATATC	2	10	605039	605048	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_020819	ACTTA	2	10	623843	623852	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_020819	AATTG	2	10	633249	633258	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020819	GGTTA	2	10	646148	646157	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020819	AAAAT	2	10	661790	661799	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020819	AAGCA	2	10	667659	667668	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_020819	TAAAA	2	10	714044	714053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020819	CTTTC	2	10	719412	719421	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_020819	CCGAC	2	10	727867	727876	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_020819	AAGCT	2	10	735755	735764	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_020819	GTTTT	2	10	737319	737328	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020819	TTTTG	2	10	737885	737894	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020819	ATAAA	2	10	755388	755397	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020819	ATTTA	2	10	772903	772912	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020819	ACAAA	2	10	774459	774468	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_020819	ACAAA	2	10	774796	774805	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_020819	TTACT	2	10	776801	776810	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_020819	AGTAT	2	10	776885	776894	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020819	TAGAA	2	10	780563	780572	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020819	TACGG	2	10	829624	829633	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_020819	CGTGA	2	10	849009	849018	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_020819	GGGCA	2	10	885441	885450	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_020819	TTATT	2	10	885465	885474	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020819	ATGGT	2	10	885907	885916	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020819	GCCCA	2	10	888440	888449	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
99	NC_020819	TTTGA	2	10	890599	890608	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020819	CCGTT	2	10	905106	905115	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_020819	AAAAT	2	10	910108	910117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020819	TCGTG	2	10	921532	921541	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_020819	GCTAA	2	10	921732	921741	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_020819	TATTT	2	10	925875	925884	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020819	TATTT	2	10	926073	926082	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020819	ATTAA	2	10	929861	929870	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020819	TATAA	2	10	938608	938617	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020819	TTAAG	2	10	957500	957509	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020819	CAACT	2	10	960354	960363	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
110	NC_020819	TCCGT	2	10	967809	967818	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_020819	CATGA	2	10	979327	979336	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_020819	CTTTT	2	10	981296	981305	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_020819	TAAGT	2	10	993704	993713	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020819	TGTTT	2	10	1051638	1051647	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020819	CCTAA	2	10	1069562	1069571	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_020819	CAAAA	2	10	1076206	1076215	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_020819	TCTTT	2	10	1082612	1082621	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_020819	TAGTA	2	10	1111997	1112006	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020819	AAACA	2	10	1116804	1116813	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_020819	AGTGA	2	10	1136759	1136768	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020819	TACTT	2	10	1147506	1147515	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_020819	TTAAA	2	10	1151989	1151998	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020819	ATTAA	2	10	1164564	1164573	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020819	AAATA	2	10	1164590	1164599	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020819	GAAGC	2	10	1166984	1166993	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_020819	CTTTA	2	10	1182821	1182830	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_020819	CATTT	2	10	1192780	1192789	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_020819	GAATT	2	10	1207072	1207081	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020819	CCCTG	2	10	1217591	1217600	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_020819	TTCTA	2	10	1237488	1237497	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_020819	GCACT	2	10	1254888	1254897	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_020819	AGTTC	2	10	1277651	1277660	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_020819	CAATT	2	10	1321716	1321725	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_020819	ACTTT	2	10	1328525	1328534	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_020819	TCGCC	2	10	1344114	1344123	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
136	NC_020819	TAAAA	2	10	1345717	1345726	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020819	ACTGG	2	10	1348153	1348162	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_020819	TCAAT	2	10	1350039	1350048	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_020819	TTTTC	2	10	1368717	1368726	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_020819	TTCGT	2	10	1369920	1369929	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_020819	AACGC	2	10	1391393	1391402	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_020819	GCAAT	2	10	1408440	1408449	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_020819	TTCTC	2	10	1420735	1420744	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_020819	AATTA	2	10	1453616	1453625	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020819	GCGTT	2	10	1454425	1454434	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_020819	TACTC	2	10	1467265	1467274	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_020819	ATATA	2	10	1467873	1467882	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020819	ATTAA	2	10	1490583	1490592	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020819	TAACA	2	10	1490593	1490602	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_020819	TTAGC	2	10	1494824	1494833	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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161	NC_020819	CTAAA	2	10	1679941	1679950	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_020819	CACTT	2	10	1690396	1690405	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
163	NC_020819	TTATT	2	10	1701195	1701204	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_020819	AAATA	2	10	1711499	1711508	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_020819	CTAAA	2	10	1717298	1717307	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_020819	TAAAC	2	10	1748408	1748417	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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168	NC_020819	GTTCT	2	10	1761582	1761591	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
169	NC_020819	GTCAG	2	10	1766551	1766560	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
170	NC_020819	TCCCC	2	10	1782271	1782280	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
171	NC_020819	TTTAA	2	10	1788122	1788131	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_020819	CCTTC	2	10	1795443	1795452	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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174	NC_020819	ACGCT	2	10	1806147	1806156	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
175	NC_020819	ACTTA	2	10	1825604	1825613	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
176	NC_020819	TTTAT	2	10	1830022	1830031	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_020819	TTTTA	2	10	1846630	1846639	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_020819	GTAAC	2	10	1880648	1880657	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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184	NC_020819	ATTTT	2	10	1885642	1885651	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_020819	AGTTT	2	10	1925290	1925299	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_020819	AAAAT	2	10	1976299	1976308	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_020819	CTTCT	2	10	1981524	1981533	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
194	NC_020819	TACCT	2	10	1981541	1981550	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
195	NC_020819	CAACT	2	10	1992183	1992192	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
196	NC_020819	ATTTT	2	10	2000314	2000323	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_020819	GTTAA	2	10	2004202	2004211	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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209	NC_020819	TCTCA	2	10	2131629	2131638	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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236	NC_020819	CTCAT	2	10	2377227	2377236	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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239	NC_020819	GCGTA	2	10	2381720	2381729	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
240	NC_020819	GTGTC	2	10	2381738	2381747	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
241	NC_020819	AAATG	2	10	2386593	2386602	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.