MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 12343

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020558	TGT	2	6	900308	900313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_020558	AGT	2	6	900327	900332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_020558	TCT	2	6	900390	900395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_020558	GA	3	6	900434	900439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_020558	AT	3	6	900446	900451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_020558	TTAT	2	8	900467	900474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_020558	A	6	6	900481	900486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_020558	ATTT	2	8	900505	900512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_020558	T	6	6	900510	900515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_020558	ACAT	2	8	900547	900554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_020558	TAT	2	6	900562	900567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_020558	GTT	2	6	900574	900579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_020558	ACT	2	6	900592	900597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_020558	TGT	2	6	900643	900648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_020558	TA	3	6	903396	903401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_020558	T	7	7	903449	903455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_020558	TCA	2	6	903507	903512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_020558	TAA	2	6	903525	903530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_020558	TCT	2	6	903549	903554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_020558	CGAA	2	8	903578	903585	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4521	NC_020558	TTA	2	6	903603	903608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_020558	ATCC	2	8	903638	903645	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4523	NC_020558	ATA	2	6	903648	903653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_020558	CTT	2	6	903661	903666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_020558	CTTC	2	8	903733	903740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4526	NC_020558	TGC	2	6	903782	903787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_020558	AATC	2	8	903790	903797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4528	NC_020558	CTT	2	6	903829	903834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_020558	ACT	2	6	903891	903896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_020558	TCC	2	6	903911	903916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4531	NC_020558	TAT	2	6	904241	904246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_020558	TA	3	6	904248	904253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_020558	AATC	2	8	904301	904308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4534	NC_020558	CTC	2	6	904345	904350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4535	NC_020558	TAT	2	6	904355	904360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_020558	A	7	7	904364	904370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_020558	CAAA	2	8	904382	904389	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4538	NC_020558	AAT	2	6	904404	904409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_020558	ATA	2	6	904449	904454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_020558	CCA	2	6	904505	904510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_020558	AAT	3	9	904790	904798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_020558	TTTC	2	8	904810	904817	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4543	NC_020558	TAA	2	6	904846	904851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_020558	AAT	2	6	904862	904867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_020558	A	6	6	904927	904932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_020558	CCT	2	6	904940	904945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4547	NC_020558	TTTC	2	8	904991	904998	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4548	NC_020558	GTTCTT	2	12	905147	905158	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4549	NC_020558	CT	3	6	905167	905172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4550	NC_020558	CAT	2	6	905231	905236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_020558	CCT	2	6	906548	906553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4552	NC_020558	T	6	6	906569	906574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_020558	AGA	2	6	906590	906595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_020558	AAT	2	6	906598	906603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_020558	TTA	3	9	906698	906706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4558	NC_020558	T	7	7	907253	907259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_020558	T	6	6	907290	907295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_020558	GTT	2	6	907297	907302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_020558	TAT	2	6	907341	907346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_020558	A	6	6	907417	907422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_020558	GAG	2	6	907431	907436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_020558	CCTT	2	8	907820	907827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4565	NC_020558	CTA	2	6	907835	907840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4567	NC_020558	AGG	2	6	907848	907853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_020558	TTA	2	6	908595	908600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_020558	A	6	6	908616	908621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_020558	T	6	6	909159	909164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4572	NC_020558	TTTC	2	8	909187	909194	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4573	NC_020558	T	6	6	909204	909209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_020558	TTA	2	6	909217	909222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4599	NC_020558	GAT	2	6	915367	915372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4601	NC_020558	ACT	2	6	915442	915447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_020558	TTAT	2	8	915474	915481	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_020558	TAA	2	6	915507	915512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_020558	GTT	2	6	915539	915544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4607	NC_020558	TGA	2	6	915604	915609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_020558	AATA	2	8	915629	915636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_020558	GGA	2	6	915640	915645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_020558	A	7	7	915647	915653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_020558	A	6	6	915669	915674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_020558	AAG	2	6	915690	915695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4614	NC_020558	GAA	2	6	915719	915724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4621	NC_020558	AAC	2	6	915993	915998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4622	NC_020558	A	7	7	916080	916086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_020558	A	6	6	916104	916109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_020558	CATGA	2	10	916124	916133	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4625	NC_020558	AAC	2	6	916170	916175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4628	NC_020558	GAT	2	6	916238	916243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4632	NC_020558	A	6	6	916358	916363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_020558	AAG	2	6	916407	916412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_020558	AGA	2	6	916432	916437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4635	NC_020558	A	6	6	916466	916471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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