MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 12268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020557	AT	3	6	806196	806201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_020557	TC	3	6	806260	806265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4003	NC_020557	TGTT	2	8	806285	806292	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_020557	AGCG	2	8	806304	806311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4005	NC_020557	CAG	2	6	806329	806334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_020557	AAAC	2	8	806340	806347	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4007	NC_020557	AAAG	2	8	806356	806363	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_020557	A	6	6	807469	807474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_020557	ATG	2	6	807507	807512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_020557	TAC	2	6	808079	808084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_020557	TCT	2	6	808100	808105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_020557	CAT	2	6	808115	808120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_020557	GCA	2	6	808162	808167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_020557	ATG	2	6	808174	808179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_020557	ATT	2	6	808183	808188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_020557	AGT	2	6	808191	808196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_020557	AAAT	2	8	808213	808220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_020557	T	6	6	808264	808269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_020557	AT	3	6	808319	808324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_020557	A	6	6	808357	808362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_020557	A	6	6	808365	808370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_020557	A	7	7	808408	808414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_020557	T	6	6	808462	808467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_020557	T	7	7	808504	808510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_020557	A	6	6	808530	808535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_020557	TTAT	2	8	808546	808553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_020557	AT	3	6	808648	808653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_020557	GA	3	6	808660	808665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_020557	T	6	6	808668	808673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_020557	GAT	2	6	810654	810659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_020557	CAG	2	6	810718	810723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_020557	TAA	2	6	810746	810751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_020557	TACAA	2	10	811016	811025	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4034	NC_020557	A	6	6	813925	813930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_020557	GTAAAT	2	12	814085	814096	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_020557	GTAC	2	8	814104	814111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4037	NC_020557	CAG	2	6	814146	814151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_020557	AAG	2	6	814160	814165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_020557	A	6	6	814271	814276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_020557	CAA	2	6	814296	814301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_020557	A	6	6	814314	814319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_020557	AGT	2	6	814330	814335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_020557	GAA	2	6	814364	814369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_020557	CAAA	2	8	814397	814404	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4045	NC_020557	TGCT	2	8	814430	814437	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4046	NC_020557	GCTT	2	8	814446	814453	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4047	NC_020557	GGT	2	6	814459	814464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_020557	GAAA	2	8	814476	814483	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_020557	AAG	2	6	814525	814530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_020557	AAAT	2	8	814534	814541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_020557	T	6	6	814567	814572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_020557	T	6	6	814600	814605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_020557	ACC	2	6	814640	814645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4057	NC_020557	AAT	2	6	814837	814842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_020557	AGAAA	2	10	814843	814852	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_020557	AT	3	6	814872	814877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_020557	AAAC	2	8	814913	814920	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4061	NC_020557	AAAG	2	8	814950	814957	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_020557	TGAAAT	2	12	815205	815216	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_020557	AAAT	2	8	815247	815254	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_020557	ATA	2	6	815280	815285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_020557	CAG	2	6	815375	815380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4067	NC_020557	ATA	2	6	815471	815476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_020557	GAA	2	6	815488	815493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_020557	GAG	2	6	816604	816609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_020557	ATAGA	2	10	816669	816678	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4072	NC_020557	CTT	2	6	817825	817830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_020557	TGT	2	6	817836	817841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_020557	ATCTT	2	10	817849	817858	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4077	NC_020557	GGA	2	6	817961	817966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_020557	TCC	2	6	822034	822039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_020557	TA	3	6	822063	822068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_020557	A	6	6	822075	822080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_020557	A	7	7	822109	822115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4089	NC_020557	T	6	6	822193	822198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_020557	ATA	2	6	822240	822245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_020557	TAA	2	6	822335	822340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_020557	ATA	2	6	822375	822380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_020557	A	6	6	822427	822432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4095	NC_020557	A	7	7	822465	822471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_020557	T	6	6	822489	822494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_020557	AG	3	6	822541	822546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4100	NC_020557	TGT	2	6	822899	822904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_020557	ATG	2	6	822905	822910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_020557	AGA	2	6	822931	822936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_020557	AAATAG	2	12	822937	822948	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_020557	GTTA	2	8	823777	823784	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_020557	GAA	2	6	823802	823807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_020557	AAG	2	6	823816	823821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_020557	T	7	7	823939	823945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_020557	CAAT	2	8	824034	824041	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4109	NC_020557	GAA	2	6	824081	824086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_020557	GC	3	6	824096	824101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_020557	AGA	2	6	824141	824146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_020557	AAC	2	6	824161	824166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_020557	TG	3	6	824182	824187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_020557	A	6	6	824197	824202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_020557	GAA	2	6	824211	824216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_020557	GATG	2	8	824227	824234	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_020557	T	6	6	824239	824244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_020557	CTT	2	6	824250	824255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_020557	ATG	2	6	824284	824289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4121	NC_020557	GAG	2	6	824350	824355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_020557	AGG	2	6	824689	824694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_020557	A	6	6	825075	825080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_020557	T	7	7	825085	825091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_020557	T	6	6	825099	825104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_020557	AAT	2	6	825152	825157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_020557	CAG	2	6	825366	825371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_020557	GTT	2	6	825451	825456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_020557	CTG	2	6	825482	825487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_020557	TAA	2	6	827662	827667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_020557	AGG	2	6	827675	827680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_020557	TATT	2	8	829445	829452	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_020557	TAT	2	6	829454	829459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_020557	ATT	2	6	829543	829548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_020557	AATGT	2	10	829560	829569	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_020557	GTAATC	2	12	829576	829587	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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