MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 12268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020557	AGG	2	6	321945	321950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_020557	T	6	6	322384	322389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020557	TTTA	2	8	322409	322416	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020557	GAT	2	6	322421	322426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020557	TAT	2	6	322461	322466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020557	GATA	2	8	322485	322492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_020557	GAA	2	6	322510	322515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020557	GAT	2	6	322548	322553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020557	AG	3	6	322559	322564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020557	A	6	6	322606	322611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020557	T	7	7	322859	322865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020557	AGT	2	6	322867	322872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_020557	AT	3	6	322873	322878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_020557	TAT	2	6	322911	322916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_020557	AGGG	2	8	322935	322942	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_020557	AGG	2	6	322994	322999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_020557	TTA	2	6	323049	323054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_020557	AGTT	2	8	323062	323069	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_020557	AAT	3	9	323117	323125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_020557	AACT	2	8	323258	323265	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_020557	ACA	2	6	323266	323271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_020557	TAT	2	6	323386	323391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020557	GAT	2	6	323392	323397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_020557	GCA	3	9	323428	323436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_020557	TCA	2	6	323456	323461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_020557	CGG	2	6	323532	323537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_020557	A	6	6	324411	324416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_020557	GCA	2	6	324447	324452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_020557	TAG	2	6	324472	324477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_020557	CGAA	2	8	324487	324494	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1531	NC_020557	ACC	2	6	324599	324604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_020557	GCA	2	6	324654	324659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_020557	AATC	2	8	324680	324687	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_020557	GCG	2	6	324701	324706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_020557	GAT	2	6	324737	324742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_020557	CTA	2	6	324837	324842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_020557	GCA	2	6	324845	324850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_020557	AC	3	6	324864	324869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_020557	CCG	2	6	326188	326193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_020557	TTG	2	6	326198	326203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020557	TGG	2	6	326204	326209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020557	AT	3	6	326221	326226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_020557	ATTA	2	8	327006	327013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_020557	T	6	6	327046	327051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_020557	A	6	6	327095	327100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_020557	A	6	6	327121	327126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020557	ACCT	2	8	327881	327888	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_020557	ATC	2	6	329153	329158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_020557	AAT	2	6	329173	329178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020557	A	6	6	329184	329189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020557	TTA	3	9	329208	329216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020557	ATT	3	9	329260	329268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020557	AAAAT	2	10	329271	329280	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_020557	TAA	2	6	329281	329286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020557	GTA	2	6	329363	329368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020557	ATC	2	6	329969	329974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_020557	GTT	2	6	330029	330034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_020557	GCT	2	6	330063	330068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_020557	ATT	2	6	330091	330096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_020557	CAAA	2	8	330142	330149	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_020557	AT	4	8	330150	330157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_020557	GTT	2	6	330492	330497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020557	TAG	2	6	330539	330544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_020557	CAT	2	6	330546	330551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_020557	ATT	2	6	330563	330568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020557	T	6	6	330567	330572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020557	AGA	2	6	330627	330632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_020557	GAT	3	9	330636	330644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_020557	TCT	2	6	330648	330653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_020557	T	8	8	330653	330660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_020557	A	6	6	330687	330692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020557	T	6	6	330701	330706	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020557	TAT	2	6	330710	330715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_020557	TAA	2	6	330739	330744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_020557	TAA	2	6	330764	330769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_020557	GGT	2	6	330799	330804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_020557	TAG	2	6	330850	330855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_020557	T	6	6	330861	330866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_020557	AAAT	2	8	330871	330878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_020557	ATAGA	2	10	330885	330894	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_020557	TTA	2	6	330926	330931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_020557	TAG	2	6	330977	330982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_020557	AAC	2	6	330993	330998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_020557	CAG	2	6	331013	331018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_020557	GAT	2	6	331075	331080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_020557	AGA	2	6	331089	331094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_020557	AAG	2	6	331100	331105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_020557	AAGC	2	8	331118	331125	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1589	NC_020557	GAA	2	6	331162	331167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_020557	AAAC	2	8	331216	331223	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_020557	CAG	2	6	331244	331249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_020557	GAC	2	6	331276	331281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1594	NC_020557	AAT	2	6	331477	331482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_020557	AT	3	6	331481	331486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_020557	TCCAA	2	10	331540	331549	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1597	NC_020557	GGA	2	6	331572	331577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_020557	AGA	2	6	331623	331628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_020557	GC	3	6	331670	331675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1600	NC_020557	AACTT	2	10	331771	331780	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1601	NC_020557	A	6	6	331803	331808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_020557	CTT	2	6	331829	331834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_020557	CGA	2	6	331862	331867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_020557	ATTG	2	8	331875	331882	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_020557	GTA	2	6	331964	331969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020557	GAAA	2	8	331974	331981	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020557	GAA	2	6	331992	331997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_020557	AAT	2	6	332059	332064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_020557	AAT	2	6	332299	332304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_020557	A	6	6	332326	332331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_020557	AT	3	6	332420	332425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_020557	AAT	2	6	332428	332433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_020557	GAT	2	6	332517	332522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_020557	AAC	2	6	332560	332565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_020557	ATA	2	6	332825	332830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_020557	AAG	2	6	332841	332846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_020557	AAT	2	6	332980	332985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_020557	TGA	2	6	332994	332999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_020557	ACA	2	6	333116	333121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_020557	A	6	6	333180	333185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_020557	ATT	2	6	333190	333195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_020557	TAT	2	6	333275	333280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_020557	ACT	2	6	333333	333338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_020557	CAT	2	6	333344	333349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_020557	TTTA	2	8	333423	333430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_020557	TGCAGA	2	12	333507	333518	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1627	NC_020557	ATC	2	6	333582	333587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_020557	GTG	2	6	333622	333627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_020557	TTC	2	6	333716	333721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_020557	AGA	2	6	333798	333803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_020557	CAG	2	6	333854	333859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_020557	TAAA	2	8	333953	333960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_020557	A	7	7	334015	334021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1635	NC_020557	GAT	2	6	334039	334044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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