MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 12268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020557	CCA	2	6	251693	251698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_020557	A	6	6	251714	251719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_020557	CAAA	2	8	251751	251758	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1004	NC_020557	GT	3	6	251905	251910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020557	AGG	2	6	251929	251934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020557	T	6	6	252809	252814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020557	TTG	2	6	252858	252863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020557	ACAA	2	8	253404	253411	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_020557	A	6	6	253428	253433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020557	TAT	2	6	253437	253442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_020557	GGA	2	6	253444	253449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020557	TTTA	2	8	253859	253866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020557	T	8	8	253916	253923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020557	ACA	2	6	254607	254612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_020557	T	6	6	254627	254632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020557	ATT	2	6	254648	254653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020557	TTTA	2	8	254689	254696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020557	TCGTA	2	10	254707	254716	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1019	NC_020557	A	6	6	254722	254727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020557	GAT	2	6	254755	254760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020557	AAC	2	6	254765	254770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_020557	AT	3	6	254774	254779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_020557	GGA	2	6	254793	254798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_020557	TGA	2	6	254825	254830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020557	TTC	2	6	254844	254849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_020557	A	6	6	254868	254873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_020557	TTTA	2	8	255234	255241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1029	NC_020557	A	6	6	255288	255293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_020557	T	6	6	255294	255299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_020557	ATA	2	6	255332	255337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020557	GAA	2	6	255356	255361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020557	A	6	6	255373	255378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_020557	AGA	2	6	255391	255396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020557	CAG	2	6	255416	255421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_020557	AAT	2	6	255465	255470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_020557	TTA	2	6	255481	255486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_020557	GAA	2	6	255880	255885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020557	TAAA	2	8	255959	255966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_020557	A	6	6	255975	255980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_020557	A	6	6	255987	255992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_020557	A	6	6	256201	256206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_020557	TGA	2	6	256294	256299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_020557	TA	3	6	256329	256334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_020557	AAG	2	6	256436	256441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_020557	TAA	2	6	256451	256456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_020557	TAA	2	6	256473	256478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_020557	TTTC	2	8	256493	256500	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_020557	AAGG	2	8	256552	256559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_020557	GAA	2	6	257094	257099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_020557	TATTT	2	10	257139	257148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_020557	A	7	7	257258	257264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_020557	AGA	2	6	257279	257284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_020557	TCTT	2	8	257363	257370	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_020557	T	7	7	257382	257388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_020557	AAG	2	6	257409	257414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_020557	A	6	6	258167	258172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1060	NC_020557	AATT	2	8	258528	258535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_020557	ATG	2	6	258570	258575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_020557	CTT	2	6	258663	258668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_020557	AGA	2	6	258793	258798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020557	CAA	2	6	258856	258861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_020557	AAG	2	6	258885	258890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_020557	ATT	2	6	258935	258940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_020557	AGTT	2	8	258969	258976	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_020557	A	6	6	259022	259027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_020557	GCTTG	2	10	259061	259070	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1070	NC_020557	ATT	2	6	259178	259183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_020557	ACT	2	6	259203	259208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1073	NC_020557	CAA	2	6	259384	259389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_020557	A	6	6	259388	259393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1076	NC_020557	ATT	2	6	259511	259516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1078	NC_020557	AAGAAA	2	12	259623	259634	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_020557	CTT	2	6	259714	259719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_020557	TCG	2	6	259771	259776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_020557	CAA	2	6	259889	259894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1090	NC_020557	ACGTG	2	10	260062	260071	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1095	NC_020557	GATT	2	8	260233	260240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_020557	GTA	2	6	260270	260275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1100	NC_020557	TGC	2	6	260566	260571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_020557	TCG	2	6	260629	260634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_020557	AAG	2	6	260655	260660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_020557	GTTC	2	8	260699	260706	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_020557	GTT	2	6	260759	260764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_020557	ATC	2	6	260876	260881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1107	NC_020557	GAA	2	6	260972	260977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_020557	AGA	2	6	261121	261126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_020557	TTA	2	6	261131	261136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_020557	GGC	3	9	261197	261205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_020557	CGA	2	6	261247	261252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_020557	ACC	2	6	261256	261261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_020557	GAA	2	6	261374	261379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_020557	GCT	2	6	261488	261493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_020557	GAA	2	6	261542	261547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_020557	GAA	2	6	261566	261571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_020557	GACG	2	8	261608	261615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_020557	TGA	2	6	261685	261690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_020557	CT	3	6	261721	261726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_020557	CAA	2	6	261734	261739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_020557	TGG	2	6	261745	261750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_020557	TGG	2	6	261763	261768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_020557	T	6	6	262146	262151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1126	NC_020557	T	7	7	265897	265903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_020557	AGTGA	2	10	265924	265933	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020557	A	6	6	266472	266477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_020557	AGA	2	6	266480	266485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_020557	CGAA	2	8	266502	266509	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_020557	T	7	7	268004	268010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_020557	TCT	2	6	268012	268017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_020557	ATT	2	6	268024	268029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_020557	ATG	2	6	268051	268056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_020557	AAAT	2	8	268070	268077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_020557	GA	4	8	268100	268107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1413	NC_020557	AC	3	6	311477	311482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1414	NC_020557	CGG	2	6	311515	311520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1415	NC_020557	CGA	2	6	311537	311542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1416	NC_020557	TGA	2	6	311696	311701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_020557	CTTT	2	8	311716	311723	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1418	NC_020557	CG	3	6	311729	311734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1419	NC_020557	A	6	6	311774	311779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_020557	CGG	2	6	311848	311853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1421	NC_020557	GAT	2	6	311879	311884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_020557	ATT	2	6	311890	311895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_020557	T	6	6	311941	311946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1425	NC_020557	CGA	2	6	312003	312008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1427	NC_020557	CTT	2	6	312035	312040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1428	NC_020557	TTA	2	6	312057	312062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_020557	ATG	2	6	312097	312102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1431	NC_020557	G	6	6	312127	312132	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_020557	TGTT	2	8	312181	312188	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_020557	T	7	7	312278	312284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1435	NC_020557	TGC	2	6	312501	312506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1442	NC_020557	TGCGA	2	10	313882	313891	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1444	NC_020557	A	6	6	314009	314014	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_020557	GTT	2	6	314051	314056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1447	NC_020557	CGC	2	6	314101	314106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1448	NC_020557	ACGGG	2	10	314113	314122	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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1452	NC_020557	GT	3	6	314354	314359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_020557	AGA	2	6	314361	314366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_020557	AGAA	2	8	314436	314443	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_020557	CAA	2	6	314462	314467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1457	NC_020557	GAT	2	6	314500	314505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1459	NC_020557	GAAA	2	8	314603	314610	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1460	NC_020557	CAG	2	6	314681	314686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1464	NC_020557	A	7	7	316271	316277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1465	NC_020557	AT	3	6	316345	316350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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