MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes La111 complete genome

Total Repeats: 12268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020557	AACA	2	8	1036258	1036265	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_020557	TCC	2	6	1037157	1037162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_020557	CATT	2	8	1037177	1037184	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5004	NC_020557	TCA	2	6	1037225	1037230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_020557	T	6	6	1037285	1037290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_020557	T	8	8	1037294	1037301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_020557	GGAG	2	8	1037328	1037335	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_020557	T	6	6	1040244	1040249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_020557	AGG	2	6	1040322	1040327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_020557	GA	3	6	1042210	1042215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_020557	A	8	8	1045488	1045495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_020557	TTA	2	6	1047642	1047647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_020557	GAAA	2	8	1049415	1049422	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_020557	TAA	2	6	1049475	1049480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_020557	GAT	2	6	1049491	1049496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_020557	GAG	2	6	1051045	1051050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_020557	AGG	2	6	1052042	1052047	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_020557	CAT	2	6	1053137	1053142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_020557	T	7	7	1053166	1053172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_020557	TTAAT	2	10	1053184	1053193	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_020557	TA	3	6	1053228	1053233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_020557	A	6	6	1053255	1053260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_020557	AGA	2	6	1053271	1053276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_020557	AAC	2	6	1055758	1055763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_020557	T	7	7	1055794	1055800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_020557	TGA	2	6	1055824	1055829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_020557	TTGT	2	8	1055830	1055837	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_020557	TCGG	2	8	1055922	1055929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5029	NC_020557	AGA	2	6	1055992	1055997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_020557	TAT	2	6	1056029	1056034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_020557	GGT	2	6	1056077	1056082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_020557	CGC	2	6	1056168	1056173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5033	NC_020557	GT	3	6	1056187	1056192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_020557	GAA	2	6	1056225	1056230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_020557	ATT	2	6	1056255	1056260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_020557	T	6	6	1056259	1056264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_020557	AGG	2	6	1056266	1056271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_020557	GTT	2	6	1056483	1056488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_020557	GAG	2	6	1056516	1056521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_020557	CTG	2	6	1056523	1056528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_020557	GAA	2	6	1056582	1056587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_020557	GAA	2	6	1056653	1056658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_020557	A	6	6	1056753	1056758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_020557	CTTG	2	8	1056761	1056768	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5045	NC_020557	GGC	2	6	1056777	1056782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_020557	TGT	2	6	1056794	1056799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_020557	GT	3	6	1056802	1056807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_020557	CTT	2	6	1056861	1056866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_020557	CAT	2	6	1056923	1056928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_020557	A	6	6	1056942	1056947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_020557	ATC	2	6	1056999	1057004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_020557	CGA	2	6	1057028	1057033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_020557	CAA	2	6	1057040	1057045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_020557	CAT	2	6	1057087	1057092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_020557	CAC	2	6	1057130	1057135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_020557	GGC	2	6	1057142	1057147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5057	NC_020557	AGA	2	6	1057153	1057158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_020557	GTC	2	6	1057645	1057650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_020557	ACG	2	6	1057715	1057720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_020557	ATA	2	6	1058331	1058336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_020557	A	7	7	1058361	1058367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_020557	AGA	2	6	1058419	1058424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_020557	CTT	2	6	1058425	1058430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_020557	AAT	2	6	1058435	1058440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_020557	A	7	7	1058456	1058462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_020557	GTT	2	6	1058678	1058683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_020557	TAT	2	6	1058701	1058706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_020557	ATA	2	6	1058728	1058733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_020557	ATT	2	6	1058754	1058759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_020557	TGG	2	6	1058806	1058811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_020557	TAACT	2	10	1058876	1058885	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5072	NC_020557	TGT	2	6	1058908	1058913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_020557	TTA	2	6	1058963	1058968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_020557	AAT	2	6	1059060	1059065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_020557	ACCA	2	8	1059069	1059076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5076	NC_020557	CTTA	2	8	1059089	1059096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5077	NC_020557	ATT	2	6	1059131	1059136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_020557	AAG	2	6	1059159	1059164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_020557	TAT	2	6	1059233	1059238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_020557	A	6	6	1059239	1059244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_020557	A	7	7	1059255	1059261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_020557	TATG	2	8	1059428	1059435	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_020557	GTTA	2	8	1059458	1059465	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_020557	T	6	6	1059481	1059486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_020557	TGA	2	6	1059496	1059501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_020557	CGA	2	6	1059539	1059544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_020557	AAT	2	6	1059760	1059765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_020557	AAT	2	6	1059774	1059779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_020557	A	7	7	1059784	1059790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_020557	T	6	6	1059826	1059831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_020557	TTATGG	2	12	1059882	1059893	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_020557	GTT	2	6	1059905	1059910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_020557	GAAG	2	8	1059915	1059922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_020557	AAG	2	6	1059992	1059997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_020557	AGT	2	6	1060033	1060038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_020557	GAG	2	6	1060082	1060087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_020557	AATA	2	8	1060170	1060177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_020557	GAAA	2	8	1060299	1060306	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_020557	ATG	2	6	1060316	1060321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_020557	TGA	2	6	1060353	1060358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_020557	GAGGCA	2	12	1060363	1060374	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5102	NC_020557	A	7	7	1060392	1060398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_020557	AAT	2	6	1060408	1060413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_020557	AGA	2	6	1060467	1060472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_020557	TGA	2	6	1060482	1060487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_020557	ACGG	2	8	1060543	1060550	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_020557	TTA	2	6	1060597	1060602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_020557	GAA	2	6	1060612	1060617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_020557	TAAA	2	8	1060624	1060631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_020557	A	7	7	1060629	1060635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_020557	TCT	2	6	1061554	1061559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_020557	ATT	2	6	1062660	1062665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_020557	T	6	6	1062691	1062696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_020557	AT	3	6	1062742	1062747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_020557	CCT	2	6	1063750	1063755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5116	NC_020557	TTTAGT	2	12	1063761	1063772	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_020557	A	6	6	1063803	1063808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_020557	ATA	2	6	1063852	1063857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_020557	AGT	2	6	1063899	1063904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_020557	A	6	6	1063923	1063928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_020557	AAAG	2	8	1063931	1063938	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_020557	TCT	2	6	1067697	1067702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_020557	CCT	2	6	1067703	1067708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5124	NC_020557	AGG	2	6	1067751	1067756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_020557	ACA	2	6	1068113	1068118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_020557	AAAGC	2	10	1068483	1068492	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5127	NC_020557	T	6	6	1068532	1068537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_020557	GTT	2	6	1068580	1068585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_020557	A	6	6	1068604	1068609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_020557	TTAAT	2	10	1068637	1068646	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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