MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 plasmid

Total Repeats: 166

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020522	GCTA	2	8	7	14	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020522	TGC	2	6	19	24	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020522	AAG	2	6	29	34	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020522	CTAA	2	8	2436	2443	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020522	AGG	2	6	2492	2497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020522	TGG	2	6	2510	2515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020522	AGA	2	6	2531	2536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020522	TTA	2	6	2550	2555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020522	T	8	8	2573	2580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020522	T	7	7	2617	2623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020522	ATT	2	6	4181	4186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020522	AAT	2	6	4296	4301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020522	AAT	2	6	4431	4436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020522	ATT	2	6	4949	4954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020522	TCT	2	6	4958	4963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020522	ATT	2	6	4985	4990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020522	TAT	2	6	5018	5023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020522	AAG	2	6	5057	5062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020522	ATA	2	6	5093	5098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020522	T	8	8	6239	6246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020522	A	7	7	6283	6289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020522	AAGC	2	8	6298	6305	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_020522	CAA	2	6	6306	6311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020522	CAC	2	6	6322	6327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_020522	ATA	2	6	7803	7808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020522	TAG	2	6	8677	8682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020522	AAT	2	6	8683	8688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020522	ATT	2	6	9412	9417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020522	TA	3	6	9474	9479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020522	ATA	2	6	9490	9495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020522	GTTTG	2	10	10259	10268	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020522	TTCTT	2	10	10709	10718	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020522	GTG	2	6	10732	10737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020522	ACA	2	6	10763	10768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020522	TAA	2	6	11069	11074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020522	ATT	2	6	11076	11081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020522	ATA	3	9	11139	11147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020522	AT	3	6	11157	11162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020522	AG	3	6	11193	11198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020522	CTT	2	6	11212	11217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020522	ATTT	2	8	11223	11230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020522	GAT	2	6	11270	11275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020522	TTAATT	2	12	11306	11317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020522	TG	3	6	11327	11332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020522	TGT	2	6	11335	11340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020522	T	6	6	11354	11359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020522	AC	3	6	11380	11385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020522	CTT	2	6	11805	11810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020522	AAAT	2	8	13501	13508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020522	A	6	6	13518	13523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020522	A	6	6	16449	16454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020522	TGAT	2	8	16482	16489	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020522	GTT	2	6	16508	16513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020522	A	6	6	16585	16590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020522	CT	3	6	16603	16608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020522	TAT	2	6	19077	19082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020522	ATT	2	6	19117	19122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020522	TAC	2	6	19177	19182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020522	A	6	6	19204	19209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020522	TTG	2	6	22084	22089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020522	TTTA	2	8	22104	22111	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020522	TC	3	6	23525	23530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020522	AAT	2	6	38428	38433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020522	TTCA	2	8	39410	39417	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020522	T	6	6	39430	39435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020522	GCA	2	6	40460	40465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020522	ATTTA	2	10	41534	41543	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020522	TTTTA	2	10	41547	41556	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020522	GTAAA	2	10	41574	41583	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020522	TA	4	8	41595	41602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020522	TA	3	6	42523	42528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020522	TCT	3	9	44772	44780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020522	TCC	2	6	44982	44987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_020522	TAA	2	6	46268	46273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020522	GCTAG	2	10	46321	46330	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_020522	TTA	2	6	46347	46352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020522	TTA	2	6	46371	46376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020522	TAT	2	6	46390	46395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020522	TATTGA	2	12	46406	46417	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020522	ATTG	2	8	46429	46436	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020522	T	7	7	46448	46454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020522	ATT	2	6	46497	46502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020522	T	6	6	46532	46537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020522	AATT	2	8	46562	46569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020522	CTC	2	6	46594	46599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_020522	TATAAA	2	12	46603	46614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020522	TGAT	2	8	46647	46654	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020522	T	6	6	46740	46745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020522	TTA	2	6	46794	46799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020522	T	7	7	46801	46807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020522	A	6	6	46882	46887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020522	ATT	2	6	46889	46894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020522	TA	3	6	46983	46988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020522	ATT	2	6	46999	47004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020522	CAA	2	6	47027	47032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020522	TAT	2	6	47041	47046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020522	TGC	2	6	47115	47120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020522	TGATT	2	10	47142	47151	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020522	TGATT	2	10	47164	47173	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020522	TGATT	2	10	47186	47195	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020522	TGATT	2	10	47208	47217	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020522	TGATT	2	10	47230	47239	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020522	TGATT	2	10	47252	47261	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020522	TAA	2	6	47287	47292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020522	CAT	3	9	47347	47355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020522	TAA	2	6	47358	47363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020522	ATTG	2	8	47396	47403	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020522	TTA	2	6	47424	47429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020522	CAAT	2	8	48409	48416	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020522	AAAT	2	8	48417	48424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020522	T	6	6	48487	48492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020522	ATT	2	6	48550	48555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020522	AGA	2	6	48559	48564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020522	TAA	2	6	48574	48579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020522	A	9	9	48586	48594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020522	AT	3	6	49642	49647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020522	AT	3	6	49736	49741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020522	AATA	2	8	49742	49749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020522	T	7	7	49759	49765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020522	AAT	2	6	49972	49977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020522	TCA	2	6	49993	49998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020522	TTA	2	6	50036	50041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020522	ACT	2	6	50051	50056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020522	GCTC	2	8	50066	50073	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020522	TAA	2	6	50090	50095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020522	TTATTT	2	12	50105	50116	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020522	T	6	6	50114	50119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020522	TGA	2	6	50129	50134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020522	AAATCT	2	12	50147	50158	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_020522	ATTGA	2	10	50293	50302	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020522	AAT	2	6	50370	50375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020522	A	6	6	50377	50382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020522	ATGA	2	8	50423	50430	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020522	TTG	2	6	50496	50501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020522	A	6	6	50715	50720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020522	GAA	2	6	50743	50748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020522	CAC	2	6	52323	52328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_020522	AAC	2	6	53925	53930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_020522	TCC	2	6	54762	54767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_020522	AGA	4	12	54821	54832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020522	ATC	2	6	54978	54983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_020522	A	8	8	54997	55004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020522	TTG	2	6	55073	55078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020522	A	6	6	55227	55232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020522	AAT	2	6	55251	55256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020522	A	9	9	55325	55333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020522	GAA	2	6	55357	55362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020522	T	8	8	56585	56592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020522	ATT	2	6	56596	56601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020522	AAT	2	6	60099	60104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020522	T	7	7	60126	60132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020522	TAA	2	6	60227	60232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020522	TA	3	6	60352	60357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020522	AGG	2	6	60371	60376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020522	T	6	6	68841	68846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020522	ATT	2	6	71080	71085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_020522	AT	3	6	71191	71196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_020522	TAA	2	6	71197	71202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020522	ACT	2	6	73119	73124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_020522	AT	3	6	73187	73192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_020522	A	6	6	73207	73212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_020522	ATT	2	6	73223	73228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_020522	TTA	2	6	73249	73254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_020522	GCTA	2	8	73260	73267	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
165	NC_020522	TGC	2	6	73272	73277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_020522	ATT	2	6	73460	73465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.