MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020521	CATAAA	2	12	40819	40830	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020521	TCAGTA	2	12	69929	69940	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_020521	AAAATG	2	12	71757	71768	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020521	TTTAAA	2	12	100771	100782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020521	AAAAAT	2	12	101450	101461	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020521	TATAAT	2	12	108897	108908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020521	ACCTTG	2	12	134226	134237	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020521	GGATAG	2	12	148865	148876	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020521	ACCTTG	2	12	205041	205052	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020521	AAATGA	2	12	222611	222622	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020521	AAAAAT	2	12	256253	256264	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020521	CATTTG	2	12	297245	297256	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020521	TGAAAT	2	12	299115	299126	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020521	TCAGAA	2	12	341944	341955	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_020521	TGATTT	2	12	350766	350777	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020521	TTATTC	2	12	434903	434914	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020521	GATCAC	2	12	496142	496153	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020521	TATAAA	2	12	499568	499579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020521	CCATAT	2	12	499656	499667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020521	TGTTTC	2	12	507901	507912	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020521	TCTATG	2	12	539675	539686	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020521	AATTCA	2	12	551833	551844	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020521	CCTGAC	2	12	586906	586917	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020521	TAAAAA	2	12	597871	597882	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020521	TTTATG	2	12	602494	602505	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020521	ATTTGT	2	12	634846	634857	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020521	AGACTA	2	12	660439	660450	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020521	AAAACA	2	12	694316	694327	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020521	GAAATA	2	12	695809	695820	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020521	ATAAGA	2	12	727149	727160	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020521	AAAAAG	2	12	764902	764913	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020521	ATCTAG	2	12	826389	826400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020521	TCATTT	2	12	838189	838200	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020521	ACAAGG	2	12	871301	871312	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020521	TAAAAT	2	12	899381	899392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020521	TATTCT	2	12	966434	966445	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020521	GCCTTG	2	12	973073	973084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020521	CAAAGT	2	12	975144	975155	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020521	TAAATT	2	12	997982	997993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020521	TTTCTT	2	12	1039792	1039803	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020521	ATAATT	2	12	1044795	1044806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020521	ATTACA	2	12	1241623	1241634	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020521	TTTTAT	2	12	1259495	1259506	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020521	GGGCTG	2	12	1263638	1263649	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_020521	ATGCAA	2	12	1263823	1263834	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_020521	ATTTTA	2	12	1291935	1291946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020521	AGGTCC	2	12	1372642	1372653	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020521	AGTAAA	2	12	1374333	1374344	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020521	CTAAAT	2	12	1394756	1394767	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020521	AAAAAG	2	12	1398406	1398417	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020521	ATTTTT	2	12	1440226	1440237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020521	GTTGAT	2	12	1599857	1599868	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020521	AAGTCT	2	12	1615316	1615327	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020521	ATTTTT	2	12	1632605	1632616	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020521	ATTTTT	2	12	1699735	1699746	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020521	TATGGA	2	12	1703535	1703546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020521	TAATTT	2	12	1776275	1776286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020521	ATATTT	2	12	1801913	1801924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020521	CAATAT	2	12	1815121	1815132	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_020521	GCATTA	2	12	1834950	1834961	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_020521	TATCAA	2	12	1872518	1872529	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020521	ACCGGA	2	12	1915747	1915758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020521	CTGCTT	2	12	1924913	1924924	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020521	ATGATT	2	12	1935054	1935065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020521	TGCAAG	2	12	1952556	1952567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020521	TAAAAA	2	12	1955253	1955264	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020521	TTTTTA	2	12	1959050	1959061	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020521	TTTTAA	2	12	1962980	1962991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020521	ATTTTT	2	12	1967213	1967224	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020521	CAAATA	2	12	1971458	1971469	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_020521	CAATTT	2	12	1999082	1999093	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_020521	AATGAT	2	12	2008516	2008527	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020521	ATCATT	2	12	2009722	2009733	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_020521	CTATTT	2	12	2042485	2042496	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_020521	TTTTTC	2	12	2053583	2053594	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_020521	ATTGCA	2	12	2069126	2069137	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_020521	AATAAA	2	12	2092361	2092372	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020521	TTAAAA	2	12	2138135	2138146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020521	AAAACA	2	12	2195195	2195206	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_020521	TGAAAT	2	12	2236973	2236984	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020521	AAGAAT	2	12	2268493	2268504	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020521	CAAGAA	2	12	2294171	2294182	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_020521	TTTATA	2	12	2352297	2352308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020521	TGCAAG	2	12	2354014	2354025	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020521	TAAAAT	2	12	2358013	2358024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020521	AAAATG	2	12	2359817	2359828	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020521	CAAAAA	2	12	2369597	2369608	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_020521	TTTTAA	2	12	2381356	2381367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020521	TTGCTC	2	12	2404452	2404463	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020521	CATTTC	2	12	2434383	2434394	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020521	GCACTT	2	12	2434534	2434545	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020521	AACGAA	2	12	2435777	2435788	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020521	CTCTTT	2	12	2452914	2452925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020521	CAAGGC	2	12	2523714	2523725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020521	GTTATT	2	12	2531423	2531434	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020521	TAAAAA	2	12	2534444	2534455	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020521	CCATTT	2	12	2572797	2572808	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020521	TTTTTA	2	12	2641587	2641598	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020521	AAAACC	2	12	2731880	2731891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020521	ATAAAT	2	12	2808148	2808159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020521	ATTTTA	2	12	2810644	2810655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020521	ATTTCA	2	12	2819050	2819061	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_020521	CAAATG	2	12	2820920	2820931	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_020521	TAACCA	2	12	2833068	2833079	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020521	ATTTAA	2	12	2835379	2835390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020521	TTGATT	2	12	2841510	2841521	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020521	TGAAAA	2	12	2871742	2871753	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020521	ATCATT	2	12	2894038	2894049	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_020521	AATTTT	2	12	2901900	2901911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020521	ATTTAA	2	12	2917155	2917166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020521	TTAAAA	2	12	3018819	3018830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020521	AATTAA	2	12	3061474	3061485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020521	TTTAAA	2	12	3063421	3063432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020521	ATTTCA	2	12	3067411	3067422	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_020521	CAAATG	2	12	3069281	3069292	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_020521	GCAAAT	3	18	3114405	3114422	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_020521	GATTTT	2	12	3115053	3115064	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020521	CATGGA	2	12	3116912	3116923	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_020521	CCAAGG	2	12	3120726	3120737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020521	ATTTTA	2	12	3138259	3138270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020521	AATAGT	2	12	3206872	3206883	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020521	ATGTTG	2	12	3248053	3248064	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020521	AAAACC	2	12	3292463	3292474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_020521	TAATAT	2	12	3300202	3300213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020521	AAAACT	2	12	3310045	3310056	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_020521	AATAAG	2	12	3346450	3346461	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020521	AATCAA	2	12	3347464	3347475	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_020521	TAAAAA	2	12	3372167	3372178	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020521	AAAGAA	2	12	3383724	3383735	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020521	ATAAAC	2	12	3402515	3402526	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_020521	CACGGA	2	12	3403773	3403784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_020521	ATTCGA	2	12	3423115	3423126	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_020521	TTGCAT	2	12	3429966	3429977	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.