MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 1329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020450	TGTC	2	8	2712	2719	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020450	GATA	2	8	9705	9712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020450	TAAT	2	8	10731	10738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020450	AAGG	2	8	11977	11984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020450	TAGA	2	8	14047	14054	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020450	TAAA	2	8	14108	14115	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020450	TAAA	2	8	19555	19562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020450	CAAA	2	8	19571	19578	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020450	ATTG	2	8	23510	23517	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020450	TACT	2	8	23946	23953	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020450	GCGT	2	8	26534	26541	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020450	TATT	2	8	26903	26910	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020450	TTTA	2	8	27175	27182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020450	TAAA	2	8	31657	31664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020450	AGTA	2	8	31670	31677	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020450	CATT	2	8	33231	33238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020450	TTTG	2	8	33339	33346	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020450	ATTT	2	8	33684	33691	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020450	TAAA	2	8	34269	34276	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020450	AAAT	2	8	36050	36057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020450	AGAA	2	8	41005	41012	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020450	AAAT	2	8	47705	47712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020450	TAAA	2	8	48897	48904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020450	TAAC	2	8	49880	49887	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020450	TTTA	2	8	51546	51553	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020450	TCAT	2	8	55531	55538	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020450	TAAA	2	8	55651	55658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020450	AAAT	2	8	55834	55841	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020450	CTTT	2	8	55908	55915	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020450	TAAA	2	8	55941	55948	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020450	TAGT	2	8	57811	57818	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020450	TTTA	2	8	58978	58985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020450	TAGA	2	8	59714	59721	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020450	AAAT	2	8	59765	59772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020450	TAAA	2	8	71890	71897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020450	AGTT	2	8	79407	79414	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020450	AATT	2	8	85682	85689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020450	TAAA	2	8	85749	85756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020450	GATA	2	8	87034	87041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020450	TTTA	2	8	90028	90035	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020450	GAAA	2	8	91350	91357	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020450	AAAT	2	8	92771	92778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020450	AATA	2	8	92820	92827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020450	ATTA	2	8	97281	97288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020450	AATA	2	8	97375	97382	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020450	TTGA	2	8	104753	104760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020450	TAAT	2	8	106166	106173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020450	TTTA	2	8	107975	107982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020450	TTTA	2	8	108009	108016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020450	TCAA	2	8	108041	108048	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020450	TAAA	2	8	108106	108113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020450	TATT	2	8	109005	109012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020450	ATTG	2	8	110011	110018	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020450	AATT	2	8	112076	112083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020450	ATAA	2	8	115418	115425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020450	TAAT	2	8	115522	115529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020450	ATAA	2	8	121525	121532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020450	AAAC	2	8	122225	122232	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020450	TTAA	2	8	122304	122311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020450	ATTA	2	8	122350	122357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020450	TAAA	2	8	122596	122603	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020450	TCTT	2	8	122825	122832	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020450	AATG	2	8	122862	122869	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020450	TAAA	2	8	122907	122914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020450	TAAA	2	8	128492	128499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020450	TTTG	2	8	128521	128528	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020450	TTTA	2	8	129958	129965	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020450	AGCA	2	8	129998	130005	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020450	TATT	2	8	130084	130091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020450	CTTT	2	8	132082	132089	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020450	TAAT	2	8	133720	133727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020450	TTTG	2	8	136040	136047	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020450	CAAA	2	8	138339	138346	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020450	CATA	2	8	138587	138594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_020450	AAAG	2	8	141283	141290	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020450	TTCG	2	8	142770	142777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020450	TGAT	2	8	142881	142888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020450	AAAC	2	8	145889	145896	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020450	TTTA	2	8	146044	146051	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020450	TTAT	2	8	146272	146279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020450	GTTT	2	8	149608	149615	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020450	GAAA	2	8	149680	149687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020450	TTAT	2	8	151018	151025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020450	ATAA	2	8	157605	157612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020450	AATA	2	8	158894	158901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020450	ATAA	2	8	160987	160994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020450	GGCA	2	8	163222	163229	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020450	GACA	2	8	167030	167037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020450	TAAA	2	8	169199	169206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020450	TGAC	2	8	169214	169221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_020450	TTTA	2	8	169356	169363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020450	TAAA	2	8	169380	169387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020450	ATTA	2	8	170591	170598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020450	TGAA	2	8	171835	171842	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020450	TAAA	2	8	175314	175321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020450	TCTG	2	8	184651	184658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020450	AAAT	2	8	188167	188174	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020450	CAGA	2	8	189792	189799	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_020450	TCTA	2	8	196104	196111	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_020450	AGGA	2	8	196122	196129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020450	TCTT	2	8	196181	196188	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020450	TTAT	2	8	196250	196257	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020450	AAAT	2	8	198288	198295	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020450	TAAC	2	8	198355	198362	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_020450	AAGA	2	8	202146	202153	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020450	TTAT	2	8	205986	205993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020450	TAAA	2	8	208627	208634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020450	ATTA	2	8	214023	214030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020450	AAAG	2	8	218636	218643	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020450	ATCC	2	8	221428	221435	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_020450	AAAG	2	8	222984	222991	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020450	ATTA	2	8	226225	226232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020450	AGCG	2	8	229855	229862	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_020450	TAAT	2	8	230865	230872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020450	AAAT	2	8	230878	230885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020450	TGAA	2	8	231422	231429	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020450	TGAT	2	8	235221	235228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020450	AGTA	2	8	237179	237186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020450	TAAT	2	8	247787	247794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020450	TCAA	2	8	248967	248974	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020450	TGGG	2	8	249285	249292	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020450	ATAA	2	8	252794	252801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020450	TTTA	2	8	261978	261985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020450	CAGT	2	8	263916	263923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_020450	TAAG	2	8	271439	271446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020450	GAAT	2	8	271467	271474	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020450	TGTC	2	8	272416	272423	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_020450	AAAT	2	8	274582	274589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020450	ATTA	2	8	274652	274659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020450	TTTA	2	8	278755	278762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020450	CAGG	2	8	283468	283475	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020450	TCAT	2	8	283494	283501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020450	CAAA	2	8	283675	283682	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020450	AATT	2	8	283698	283705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020450	TGAA	2	8	285514	285521	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020450	ATAA	2	8	285572	285579	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020450	ACTA	2	8	286216	286223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_020450	ATTT	2	8	291577	291584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020450	TTTA	2	8	292727	292734	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020450	TTAA	2	8	292787	292794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020450	TATT	2	8	298870	298877	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020450	CTGA	2	8	302188	302195	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_020450	ATTT	2	8	302221	302228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020450	ATTT	2	8	302950	302957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020450	AGTA	2	8	303135	303142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020450	TTTA	2	8	303379	303386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020450	AAAT	2	8	303501	303508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020450	ATTT	2	8	306384	306391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020450	TTAA	2	8	312903	312910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020450	TCAA	2	8	312995	313002	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_020450	AATT	2	8	315418	315425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020450	TACT	2	8	315540	315547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_020450	ATAA	2	8	319524	319531	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020450	CATA	2	8	319563	319570	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_020450	TAAA	2	8	320442	320449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020450	GAAC	2	8	320514	320521	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_020450	TGAA	2	8	321268	321275	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_020450	TTTA	2	8	325954	325961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020450	TTCT	2	8	331093	331100	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
160	NC_020450	TAAA	2	8	331150	331157	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_020450	AAAT	2	8	337195	337202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_020450	AAAG	2	8	343812	343819	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
163	NC_020450	TAGA	2	8	344778	344785	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
164	NC_020450	AATA	2	8	344830	344837	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_020450	AATT	2	8	355558	355565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_020450	TTAC	2	8	357334	357341	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
168	NC_020450	TGAC	2	8	360880	360887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
169	NC_020450	TAAT	2	8	361770	361777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_020450	ATTT	2	8	361803	361810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_020450	AGCA	2	8	363087	363094	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
172	NC_020450	ATTT	2	8	364291	364298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_020450	AATT	2	8	365267	365274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_020450	AAAT	2	8	366321	366328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_020450	TAAA	2	8	366501	366508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_020450	TCAT	2	8	366537	366544	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
177	NC_020450	TTAT	2	8	367918	367925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_020450	AGCT	2	8	372859	372866	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_020450	AAAT	2	8	384892	384899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_020450	TATT	2	8	387183	387190	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_020450	TTGA	2	8	388965	388972	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
184	NC_020450	TGAT	2	8	391021	391028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_020450	ATGA	2	8	396354	396361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
188	NC_020450	GAAA	2	8	400870	400877	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_020450	ATTT	2	8	409377	409384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_020450	TATT	2	8	428688	428695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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233	NC_020450	ATTA	2	8	488319	488326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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