MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 1697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020229	CCAT	2	8	96	103	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020229	ATTT	2	8	5591	5598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020229	TAAC	2	8	6690	6697	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020229	TAGT	2	8	8736	8743	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020229	ACTA	2	8	8746	8753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020229	AAGT	2	8	8823	8830	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020229	CTTG	2	8	9310	9317	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020229	ATTA	2	8	9364	9371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020229	ATGG	2	8	13807	13814	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020229	TAAC	2	8	15041	15048	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020229	ACCA	2	8	15713	15720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020229	TAAT	2	8	16827	16834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020229	TTAA	2	8	16854	16861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020229	GCCC	2	8	17033	17040	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_020229	GCTC	2	8	17886	17893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020229	AGAA	2	8	18646	18653	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020229	AATT	2	8	19922	19929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020229	AAGT	2	8	22127	22134	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020229	ATTA	2	8	23305	23312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020229	TACA	2	8	23873	23880	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020229	CGAT	2	8	25576	25583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020229	ATAA	2	8	25684	25691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020229	AGTT	2	8	28233	28240	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020229	TTAA	2	8	28284	28291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020229	CCCG	2	8	31487	31494	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_020229	TGCC	2	8	31626	31633	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020229	AGCA	2	8	31672	31679	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020229	ACCA	2	8	32138	32145	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_020229	TAAC	2	8	32861	32868	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020229	AAGT	2	8	41043	41050	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020229	GGAG	2	8	41139	41146	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020229	GTTG	2	8	41428	41435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020229	TCCA	2	8	41761	41768	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_020229	TTTA	2	8	41821	41828	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020229	AGCA	2	8	42802	42809	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020229	ATTT	2	8	44321	44328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020229	CAAG	2	8	52109	52116	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020229	TTAT	2	8	52200	52207	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020229	CAAT	2	8	52218	52225	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_020229	TTAA	2	8	53920	53927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020229	AGTT	2	8	53993	54000	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020229	TACC	2	8	56173	56180	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020229	TAAA	2	8	59590	59597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020229	CACC	2	8	61921	61928	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_020229	CTTG	2	8	63025	63032	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020229	AGCA	2	8	65930	65937	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020229	ACGA	2	8	66401	66408	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020229	GCTG	2	8	66454	66461	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020229	TTAA	2	8	68660	68667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020229	TACT	2	8	69775	69782	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020229	TTGA	2	8	71678	71685	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020229	ATTC	2	8	74814	74821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020229	CGGT	2	8	75276	75283	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020229	TTGA	2	8	75463	75470	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020229	AACT	2	8	75626	75633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020229	CCTT	2	8	81184	81191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020229	TATG	2	8	81214	81221	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020229	AAGC	2	8	84128	84135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020229	GCTT	2	8	84159	84166	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_020229	CCTT	2	8	87084	87091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020229	TATT	2	8	87264	87271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020229	CAAA	2	8	87380	87387	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020229	TTTA	2	8	90106	90113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020229	CTAA	2	8	90128	90135	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020229	TCAA	2	8	90528	90535	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020229	AATG	2	8	91973	91980	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020229	CATT	2	8	96601	96608	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020229	CGTT	2	8	97014	97021	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020229	TGTT	2	8	99569	99576	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020229	TAAA	2	8	99678	99685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020229	TAAA	2	8	101709	101716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020229	TTTA	2	8	105964	105971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020229	ATGA	2	8	106020	106027	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020229	ACCA	2	8	108382	108389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020229	ATTA	3	12	108435	108446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020229	TTAA	2	8	109504	109511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020229	TTTA	2	8	113575	113582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020229	ATTT	2	8	123341	123348	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020229	ATTT	2	8	123458	123465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020229	CTTT	2	8	123560	123567	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_020229	TTTC	2	8	128504	128511	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_020229	TGTT	2	8	130218	130225	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020229	TTAA	2	8	134334	134341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020229	AAAG	2	8	134343	134350	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020229	AATT	2	8	134397	134404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020229	CATG	2	8	136155	136162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_020229	ATTT	2	8	136179	136186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020229	TTGA	2	8	137414	137421	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020229	TAAC	2	8	140853	140860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_020229	ACTC	2	8	140900	140907	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020229	ATGA	2	8	140993	141000	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020229	TAAA	2	8	149997	150004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020229	ATCA	2	8	150038	150045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_020229	ATTA	2	8	150058	150065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020229	AATC	2	8	151720	151727	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_020229	CAAA	2	8	156276	156283	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020229	TTTA	2	8	156373	156380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020229	ATTA	2	8	159929	159936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020229	TAAA	2	8	163935	163942	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020229	GCCA	2	8	164146	164153	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020229	TAGA	2	8	177786	177793	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020229	TCTT	2	8	178700	178707	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_020229	ATAA	2	8	178792	178799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020229	CTTT	2	8	188159	188166	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_020229	TAAA	2	8	188168	188175	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020229	CATC	2	8	193280	193287	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020229	AATT	2	8	194026	194033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020229	ACCG	2	8	196987	196994	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_020229	GAAC	2	8	197055	197062	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020229	ATAC	2	8	199917	199924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_020229	ATTA	2	8	199948	199955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020229	TTAT	2	8	200239	200246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020229	TTTA	2	8	203030	203037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020229	TGTT	2	8	203056	203063	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020229	TAAA	2	8	206553	206560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020229	TCAA	2	8	207152	207159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_020229	CATT	2	8	209204	209211	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_020229	ACTA	2	8	209301	209308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020229	AAAC	2	8	218385	218392	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_020229	AAGG	2	8	222672	222679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020229	CATT	2	8	223308	223315	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020229	TAAC	2	8	224648	224655	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_020229	TTAA	2	8	224665	224672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020229	GTAC	2	8	224731	224738	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_020229	CTAA	2	8	224864	224871	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020229	TAAT	2	8	224914	224921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020229	AGCT	2	8	225550	225557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_020229	GCTG	2	8	228554	228561	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020229	TCAT	2	8	229302	229309	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_020229	ACTA	2	8	229323	229330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_020229	TCTT	2	8	229347	229354	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020229	ATTA	2	8	231271	231278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020229	TTAA	2	8	233309	233316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020229	TTAC	2	8	236854	236861	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_020229	AACC	2	8	238170	238177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020229	CCGT	2	8	238289	238296	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020229	ACTG	2	8	241788	241795	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_020229	TTTG	2	8	243769	243776	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020229	ATTT	2	8	243837	243844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020229	AATT	2	8	244024	244031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020229	AATA	2	8	246858	246865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020229	TAAA	2	8	246874	246881	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020229	CGCT	2	8	247099	247106	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_020229	AATG	2	8	247114	247121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020229	ATTG	2	8	253851	253858	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020229	TTTA	2	8	255258	255265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020229	GAGT	2	8	257410	257417	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020229	TTGG	2	8	259412	259419	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020229	TAAA	2	8	259481	259488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020229	TCAG	2	8	264914	264921	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_020229	TAAG	2	8	265140	265147	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_020229	AAGG	2	8	273297	273304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_020229	ATTA	2	8	865685	865692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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