MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 10560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_020229	GATT	2	8	3191796	3191803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_020229	GTC	2	6	3191809	3191814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10503	NC_020229	T	6	6	3191816	3191821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_020229	CAC	2	6	3191851	3191856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10505	NC_020229	AGG	2	6	3191889	3191894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_020229	TGG	2	6	3192458	3192463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_020229	TAT	3	9	3192881	3192889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_020229	ACT	2	6	3192893	3192898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10509	NC_020229	AGC	2	6	3193394	3193399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10510	NC_020229	TGC	3	9	3193416	3193424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10511	NC_020229	TTTA	2	8	3193426	3193433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_020229	CATT	2	8	3193447	3193454	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10513	NC_020229	TCC	2	6	3194118	3194123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10514	NC_020229	ATC	2	6	3194131	3194136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10515	NC_020229	ATCC	2	8	3194149	3194156	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10516	NC_020229	TTTA	2	8	3194183	3194190	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_020229	CCA	2	6	3194201	3194206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10518	NC_020229	GTTC	2	8	3194252	3194259	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10519	NC_020229	CGC	2	6	3194266	3194271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10520	NC_020229	CCAAG	2	10	3194358	3194367	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10521	NC_020229	TGA	2	6	3194464	3194469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_020229	TAA	2	6	3194563	3194568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_020229	CAA	2	6	3194579	3194584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10524	NC_020229	TGCT	2	8	3194722	3194729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10525	NC_020229	ATT	2	6	3194839	3194844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_020229	TTCC	2	8	3194861	3194868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10527	NC_020229	AACC	2	8	3195000	3195007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10528	NC_020229	ATT	2	6	3195028	3195033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_020229	TAT	2	6	3195065	3195070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_020229	ATA	2	6	3195079	3195084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_020229	AT	3	6	3195102	3195107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_020229	CT	3	6	3196798	3196803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10533	NC_020229	TTC	2	6	3196825	3196830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10534	NC_020229	CTT	2	6	3196992	3196997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10535	NC_020229	GTTG	2	8	3197001	3197008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_020229	CGT	2	6	3197117	3197122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10537	NC_020229	CAC	2	6	3197125	3197130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10538	NC_020229	A	6	6	3197230	3197235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_020229	ACC	2	6	3197260	3197265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10540	NC_020229	T	6	6	3197424	3197429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_020229	TAA	2	6	3197453	3197458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_020229	TTTAG	2	10	3197465	3197474	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_020229	A	7	7	3197529	3197535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_020229	ATC	2	6	3197540	3197545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10545	NC_020229	AGG	2	6	3197550	3197555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_020229	A	7	7	3199638	3199644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_020229	TCT	2	6	3199658	3199663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10548	NC_020229	T	7	7	3199673	3199679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_020229	GTC	2	6	3200487	3200492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10550	NC_020229	CAATT	2	10	3200535	3200544	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10551	NC_020229	CAA	2	6	3200577	3200582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10552	NC_020229	T	7	7	3200662	3200668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_020229	TGA	2	6	3200720	3200725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_020229	ACAT	2	8	3200781	3200788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10555	NC_020229	TGACC	2	10	3200800	3200809	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10556	NC_020229	GCA	2	6	3202111	3202116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10557	NC_020229	CTAA	2	8	3202118	3202125	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10558	NC_020229	GTT	2	6	3202183	3202188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_020229	CAT	2	6	3202201	3202206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10560	NC_020229	AGTC	2	8	3203947	3203954	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.