MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 10560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020229	TCG	2	6	1525531	1525536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_020229	ATAA	2	8	1525565	1525572	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_020229	TCG	2	6	1525643	1525648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_020229	ATC	2	6	1525664	1525669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_020229	ATT	2	6	1528748	1528753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_020229	GTTG	2	8	1528764	1528771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_020229	AG	3	6	1528798	1528803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_020229	ATA	2	6	1529431	1529436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_020229	T	6	6	1529455	1529460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_020229	ACT	2	6	1529987	1529992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_020229	TTG	2	6	1530231	1530236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_020229	TAA	3	9	1530241	1530249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_020229	TAAA	2	8	1530266	1530273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_020229	TAA	2	6	1530352	1530357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_020229	GGT	2	6	1530360	1530365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_020229	ATAA	2	8	1530521	1530528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_020229	TTA	2	6	1530629	1530634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_020229	TAA	2	6	1533812	1533817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_020229	ATA	2	6	1533863	1533868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_020229	AGGTG	2	10	1533893	1533902	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_020229	ACA	2	6	1534344	1534349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_020229	TTGA	2	8	1534390	1534397	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_020229	ATGA	2	8	1536971	1536978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_020229	A	6	6	1537036	1537041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_020229	CAG	2	6	1537098	1537103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_020229	TTC	2	6	1537183	1537188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_020229	CGAC	2	8	1537207	1537214	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5028	NC_020229	AAC	2	6	1537218	1537223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_020229	GAA	2	6	1537300	1537305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_020229	ATT	2	6	1537307	1537312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_020229	AGT	2	6	1537331	1537336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_020229	TTTA	2	8	1537361	1537368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_020229	GAT	2	6	1537421	1537426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_020229	T	7	7	1537441	1537447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_020229	TTG	2	6	1537451	1537456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_020229	ATA	2	6	1540853	1540858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_020229	TTTGCT	2	12	1541496	1541507	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5038	NC_020229	A	6	6	1541516	1541521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_020229	ACT	2	6	1541537	1541542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_020229	TAA	2	6	1541588	1541593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_020229	AAT	2	6	1542163	1542168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_020229	TCC	2	6	1542169	1542174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_020229	TTC	2	6	1542177	1542182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_020229	G	6	6	1542901	1542906	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_020229	TAA	2	6	1543704	1543709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_020229	TTG	2	6	1543733	1543738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_020229	GTT	2	6	1543769	1543774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_020229	AAT	2	6	1543778	1543783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_020229	ATT	2	6	1545128	1545133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_020229	TGA	2	6	1545217	1545222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_020229	A	6	6	1545246	1545251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_020229	TCA	2	6	1545260	1545265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_020229	ATG	2	6	1545269	1545274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_020229	TGA	2	6	1545302	1545307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_020229	ATT	2	6	1545316	1545321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_020229	GTG	2	6	1545322	1545327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_020229	GAG	2	6	1545396	1545401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_020229	TTA	2	6	1548688	1548693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_020229	CCT	2	6	1549098	1549103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_020229	AGA	2	6	1549121	1549126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_020229	CCT	2	6	1550893	1550898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_020229	CAA	2	6	1551649	1551654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_020229	AGA	2	6	1551685	1551690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_020229	AT	3	6	1551755	1551760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_020229	TGA	2	6	1551763	1551768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_020229	ATCA	2	8	1551789	1551796	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5067	NC_020229	GAT	2	6	1551803	1551808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_020229	AATA	2	8	1551866	1551873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_020229	TAAC	2	8	1551884	1551891	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5070	NC_020229	GAG	2	6	1551894	1551899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_020229	AT	3	6	1552916	1552921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_020229	A	6	6	1552971	1552976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_020229	CA	3	6	1552999	1553004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5074	NC_020229	TTAA	2	8	1553040	1553047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_020229	ACT	2	6	1554002	1554007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_020229	TGCA	2	8	1554030	1554037	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5077	NC_020229	CAAA	2	8	1554137	1554144	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5078	NC_020229	A	7	7	1554142	1554148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_020229	CTT	2	6	1554995	1555000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_020229	TATT	2	8	1555001	1555008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_020229	TTGA	2	8	1555060	1555067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_020229	CCAA	2	8	1555110	1555117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5083	NC_020229	GCTAT	2	10	1555136	1555145	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5084	NC_020229	ATA	2	6	1557197	1557202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_020229	TAAA	2	8	1557212	1557219	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_020229	GAG	2	6	1557226	1557231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_020229	CAA	2	6	1558033	1558038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_020229	CGC	2	6	1558042	1558047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_020229	T	6	6	1558793	1558798	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_020229	TTTA	2	8	1559263	1559270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_020229	TAAT	2	8	1559314	1559321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_020229	TAA	2	6	1559348	1559353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_020229	GAT	2	6	1560054	1560059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_020229	TGAT	2	8	1562888	1562895	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_020229	ATT	2	6	1562914	1562919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_020229	A	6	6	1564242	1564247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_020229	CAG	2	6	1564255	1564260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_020229	T	6	6	1564267	1564272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_020229	GTCT	2	8	1564274	1564281	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5100	NC_020229	GA	3	6	1564332	1564337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_020229	ATT	2	6	1564344	1564349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_020229	ACA	2	6	1564355	1564360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_020229	ATAA	2	8	1564412	1564419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_020229	GT	3	6	1564470	1564475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_020229	AGT	2	6	1564518	1564523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_020229	AAT	2	6	1566954	1566959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_020229	TCA	2	6	1566960	1566965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_020229	CAT	2	6	1566981	1566986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_020229	TTA	2	6	1567002	1567007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_020229	TGAAA	2	10	1567034	1567043	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_020229	TTG	2	6	1567094	1567099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_020229	TA	3	6	1567118	1567123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_020229	GGAA	2	8	1567125	1567132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_020229	TAA	2	6	1567145	1567150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_020229	TTG	2	6	1567157	1567162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_020229	GAT	2	6	1567166	1567171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_020229	TAAAA	2	10	1572392	1572401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_020229	T	6	6	1572432	1572437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5119	NC_020229	TTG	2	6	1572448	1572453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_020229	GTA	2	6	1572501	1572506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_020229	TAT	2	6	1572579	1572584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_020229	ATT	2	6	1572593	1572598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_020229	ACAG	2	8	1572640	1572647	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5124	NC_020229	GGT	2	6	1573011	1573016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_020229	ATA	2	6	1573984	1573989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_020229	CTT	2	6	1574027	1574032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_020229	TATG	2	8	1574044	1574051	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_020229	CGC	2	6	1574053	1574058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_020229	A	6	6	1574067	1574072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_020229	TAT	2	6	1574116	1574121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5132	NC_020229	CTT	2	6	1574248	1574253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5260	NC_020229	CGCAA	2	10	1618666	1618675	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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