MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 266

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020130	AT	3	6	116	121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020130	TA	4	8	125	132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020130	AT	3	6	435	440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020130	AT	3	6	455	460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020130	TA	3	6	1652	1657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020130	AT	3	6	2016	2021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020130	TA	7	14	2561	2574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020130	TA	3	6	2642	2647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020130	TA	3	6	3654	3659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020130	AT	3	6	3724	3729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020130	AG	3	6	6685	6690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020130	TA	3	6	16383	16388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020130	TA	3	6	22956	22961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020130	TA	3	6	26455	26460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020130	CT	3	6	26523	26528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020130	TA	3	6	26582	26587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020130	AT	3	6	26696	26701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020130	AT	3	6	26791	26796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020130	CT	3	6	26882	26887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020130	TA	3	6	27004	27009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020130	AT	3	6	27715	27720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020130	TA	3	6	28015	28020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020130	AG	3	6	28102	28107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020130	AG	3	6	28368	28373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020130	TA	6	12	29259	29270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020130	TA	3	6	29347	29352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020130	TA	3	6	29526	29531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020130	AG	3	6	29974	29979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020130	TC	3	6	31156	31161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_020130	GA	3	6	32043	32048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020130	TA	3	6	32065	32070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020130	TA	3	6	32115	32120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020130	TA	3	6	32181	32186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020130	TA	3	6	32192	32197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020130	TA	3	6	32215	32220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020130	TA	3	6	32236	32241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020130	GT	3	6	34207	34212	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020130	TA	3	6	35898	35903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020130	TA	3	6	36094	36099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020130	TA	4	8	36188	36195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020130	AC	3	6	36344	36349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020130	CT	3	6	36422	36427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020130	AC	4	8	37368	37375	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020130	TA	7	14	37411	37424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020130	AT	3	6	37567	37572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020130	TA	3	6	41773	41778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020130	TA	3	6	41829	41834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020130	TA	3	6	42794	42799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020130	TC	3	6	42870	42875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020130	AT	3	6	43376	43381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020130	TA	3	6	44307	44312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020130	AT	3	6	46211	46216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020130	TA	3	6	46679	46684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020130	AC	3	6	51755	51760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020130	AT	3	6	51846	51851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020130	TA	3	6	55717	55722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020130	TA	3	6	55827	55832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020130	TA	3	6	58078	58083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020130	GT	3	6	58612	58617	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020130	AT	3	6	58703	58708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020130	TA	3	6	58734	58739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020130	CT	3	6	59429	59434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020130	AC	3	6	60032	60037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020130	AT	3	6	65171	65176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020130	TA	3	6	65225	65230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020130	AT	3	6	67250	67255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020130	AT	4	8	67270	67277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020130	TA	3	6	67283	67288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020130	TA	3	6	67295	67300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020130	TA	4	8	67339	67346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020130	TA	3	6	67468	67473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020130	AT	6	12	69509	69520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020130	AT	6	12	69649	69660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020130	AT	5	10	69671	69680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020130	GT	3	6	69706	69711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020130	AT	3	6	69714	69719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020130	TA	3	6	69826	69831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020130	TA	3	6	70327	70332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020130	AT	3	6	72892	72897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020130	TA	3	6	72899	72904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020130	TA	3	6	72978	72983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020130	AT	3	6	73047	73052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020130	TA	3	6	73075	73080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020130	TA	3	6	73271	73276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020130	TA	3	6	73336	73341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020130	TA	3	6	76118	76123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020130	AT	3	6	76174	76179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020130	TA	3	6	76183	76188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020130	TA	3	6	77493	77498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020130	AT	3	6	80944	80949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020130	TA	3	6	80974	80979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020130	TA	3	6	80993	80998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020130	AT	3	6	81024	81029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020130	TA	3	6	81226	81231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020130	GT	17	34	81524	81557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020130	TA	3	6	81658	81663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020130	GA	4	8	83805	83812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020130	TA	3	6	86440	86445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020130	AT	3	6	86491	86496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020130	AT	3	6	86519	86524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020130	TA	3	6	86556	86561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020130	AT	3	6	88679	88684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020130	TA	3	6	88946	88951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020130	TA	3	6	89003	89008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020130	TA	3	6	89014	89019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020130	AT	3	6	89080	89085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020130	TG	3	6	91337	91342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020130	AT	3	6	91485	91490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020130	AT	3	6	91560	91565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020130	AT	3	6	93694	93699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020130	TA	3	6	93785	93790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020130	AT	3	6	93905	93910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020130	TA	6	12	98036	98047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020130	TA	3	6	98071	98076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020130	TA	3	6	98125	98130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020130	TA	3	6	98288	98293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020130	TA	3	6	98338	98343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020130	TA	3	6	98384	98389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020130	AT	3	6	98432	98437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020130	TA	4	8	98469	98476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020130	TC	3	6	98691	98696	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020130	AT	3	6	98794	98799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020130	TA	3	6	99214	99219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020130	AT	3	6	99322	99327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020130	AT	3	6	99418	99423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020130	AT	3	6	99428	99433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020130	AT	3	6	99445	99450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020130	TA	3	6	101668	101673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020130	TA	3	6	101726	101731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020130	TA	4	8	101763	101770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020130	TA	4	8	101780	101787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020130	TA	7	14	101793	101806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020130	AT	3	6	101816	101821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020130	TA	6	12	101830	101841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020130	TA	4	8	101875	101882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020130	AT	4	8	101955	101962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020130	AT	3	6	101975	101980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020130	AT	3	6	105425	105430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020130	AT	3	6	105657	105662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020130	AT	3	6	107533	107538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020130	AT	3	6	107593	107598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020130	AT	3	6	107601	107606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020130	TA	3	6	107632	107637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020130	TG	3	6	107649	107654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020130	AG	3	6	107673	107678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020130	TA	3	6	107719	107724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020130	TA	3	6	107754	107759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020130	TA	3	6	107864	107869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020130	TA	3	6	107915	107920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020130	AT	3	6	107950	107955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020130	AT	3	6	107958	107963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020130	TA	3	6	108008	108013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020130	TA	3	6	109937	109942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020130	TA	7	14	109985	109998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020130	AT	3	6	110005	110010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020130	TA	3	6	110020	110025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_020130	TA	3	6	110072	110077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_020130	AT	3	6	110164	110169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020130	TA	3	6	110183	110188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_020130	TA	3	6	110202	110207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.