MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343 plasmid 3

Total Repeats: 1614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020130	A	7	7	59441	59447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020130	TCC	2	6	59511	59516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_020130	TAC	2	6	59561	59566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_020130	GTT	2	6	59575	59580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020130	TTC	2	6	59585	59590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_020130	TATT	2	8	59627	59634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020130	TTC	2	6	59657	59662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_020130	AAG	2	6	59669	59674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020130	ATA	2	6	59731	59736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020130	T	6	6	59827	59832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020130	AGA	2	6	59846	59851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020130	TCAC	2	8	59877	59884	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_020130	GTT	2	6	59901	59906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_020130	CCT	2	6	59979	59984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_020130	A	6	6	59989	59994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020130	AGG	2	6	60007	60012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020130	GGA	2	6	60018	60023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020130	AC	3	6	60032	60037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
519	NC_020130	AGC	2	6	60044	60049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_020130	CTT	2	6	60060	60065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_020130	TAT	2	6	60106	60111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020130	ATA	2	6	60181	60186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020130	TAAAA	2	10	60193	60202	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020130	TTA	2	6	60216	60221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_020130	A	8	8	60221	60228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_020130	CTTT	2	8	60252	60259	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
527	NC_020130	CTAA	2	8	60269	60276	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
528	NC_020130	AAT	2	6	60280	60285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020130	TAAA	2	8	62852	62859	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020130	TATAT	2	10	62882	62891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020130	A	7	7	62898	62904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020130	A	6	6	62918	62923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020130	TTA	2	6	62952	62957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020130	ATT	2	6	62996	63001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020130	ATAA	2	8	63006	63013	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020130	A	7	7	63024	63030	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020130	AT	3	6	65171	65176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020130	TA	3	6	65225	65230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020130	ATA	3	9	65228	65236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_020130	AT	3	6	67250	67255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020130	AT	4	8	67270	67277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020130	TA	3	6	67283	67288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020130	TA	3	6	67295	67300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020130	T	6	6	67302	67307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020130	ATT	2	6	67309	67314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020130	TA	4	8	67339	67346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020130	ATG	2	6	67376	67381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020130	TA	3	6	67468	67473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020130	TGT	2	6	69326	69331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020130	TCA	2	6	69347	69352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_020130	ATA	2	6	69384	69389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020130	TTA	2	6	69399	69404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020130	TAA	2	6	69409	69414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020130	T	7	7	69427	69433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020130	T	6	6	69442	69447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_020130	A	8	8	69454	69461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020130	ACA	2	6	69464	69469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_020130	ATA	2	6	69482	69487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020130	CTAA	2	8	69499	69506	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
560	NC_020130	AT	6	12	69509	69520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020130	TAT	2	6	69526	69531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020130	TTA	2	6	69614	69619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020130	ATT	2	6	69623	69628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020130	AT	6	12	69649	69660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020130	AT	5	10	69671	69680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020130	GT	3	6	69706	69711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020130	AT	3	6	69714	69719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020130	ATA	2	6	69736	69741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020130	TAA	2	6	69786	69791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020130	TTA	2	6	69796	69801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020130	TA	3	6	69826	69831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020130	T	7	7	69847	69853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020130	A	7	7	69869	69875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020130	TAT	2	6	69876	69881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020130	TAT	2	6	69908	69913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_020130	GTAT	2	8	69914	69921	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020130	TATAT	2	10	69931	69940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_020130	TTTATA	2	12	69943	69954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_020130	A	6	6	69962	69967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_020130	TAC	2	6	69976	69981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_020130	TAT	2	6	70026	70031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_020130	AGT	2	6	70032	70037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_020130	AAG	2	6	70109	70114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020130	AGAT	2	8	70153	70160	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020130	A	8	8	70185	70192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020130	A	6	6	70198	70203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_020130	ATACA	2	10	70207	70216	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
588	NC_020130	TAA	2	6	70236	70241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020130	ATTT	2	8	70266	70273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_020130	TAT	2	6	70340	70345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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594	NC_020130	AAC	2	6	70390	70395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_020130	T	6	6	72819	72824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_020130	A	7	7	72830	72836	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020130	TTA	2	6	72845	72850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020130	T	6	6	72875	72880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_020130	AT	3	6	72892	72897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_020130	TA	3	6	72899	72904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_020130	AATTA	2	10	72927	72936	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020130	ATA	2	6	72958	72963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_020130	A	7	7	72969	72975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020130	TA	3	6	72978	72983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020130	ATT	2	6	72989	72994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020130	ACCA	2	8	73023	73030	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_020130	AT	3	6	73047	73052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020130	TA	3	6	73075	73080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020130	A	6	6	73080	73085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020130	TAT	2	6	73092	73097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020130	TAA	2	6	73125	73130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020130	CTA	2	6	73132	73137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_020130	A	6	6	73194	73199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020130	ATA	2	6	73259	73264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020130	TA	3	6	73271	73276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020130	A	6	6	73291	73296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020130	ATTTT	2	10	73322	73331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020130	TA	3	6	73336	73341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020130	T	6	6	73373	73378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020130	TAA	2	6	73397	73402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020130	TAGAT	2	10	75970	75979	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020130	ATAG	2	8	76018	76025	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020130	T	6	6	76030	76035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020130	ATA	2	6	76068	76073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020130	AAT	2	6	76087	76092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020130	AAT	2	6	76101	76106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020130	ACT	2	6	76112	76117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_020130	TA	3	6	76118	76123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020130	TAC	2	6	76129	76134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_020130	TAG	3	9	76139	76147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_020130	A	6	6	76160	76165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020130	AT	3	6	76174	76179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020130	TA	3	6	76183	76188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020130	A	9	9	76193	76201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_020130	ATTA	2	8	76219	76226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020130	GAA	2	6	76268	76273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020130	A	7	7	76302	76308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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640	NC_020130	T	6	6	76371	76376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_020130	GTT	2	6	76388	76393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
642	NC_020130	AAT	2	6	76418	76423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_020130	TAT	2	6	76428	76433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_020130	CTAT	2	8	76443	76450	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
645	NC_020130	ATG	3	9	76577	76585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
646	NC_020130	CTT	2	6	76621	76626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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