MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 1082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020127	AGAT	2	8	40	47	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020127	TAAT	2	8	233	240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020127	TAAA	2	8	248	255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020127	TAAT	2	8	2949	2956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020127	TTAT	2	8	4981	4988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020127	CTTA	2	8	5021	5028	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020127	ATTT	2	8	5060	5067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020127	TATT	2	8	5429	5436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020127	TTAT	2	8	7293	7300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020127	ATAC	2	8	7522	7529	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020127	TAAA	2	8	7570	7577	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020127	TTAT	2	8	7657	7664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020127	TCAA	2	8	8077	8084	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020127	TTCT	2	8	8108	8115	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020127	ATTA	2	8	8175	8182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020127	AAGA	2	8	8262	8269	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020127	TTTG	2	8	8777	8784	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020127	TTTG	2	8	8865	8872	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020127	CATT	2	8	8926	8933	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020127	TAAC	2	8	13595	13602	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020127	TCTA	2	8	13837	13844	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020127	ATTT	2	8	13867	13874	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020127	TAGT	2	8	14001	14008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020127	TTTG	2	8	14031	14038	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020127	AGAA	2	8	16827	16834	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020127	TATT	2	8	17470	17477	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020127	CTAT	2	8	17492	17499	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020127	AAAG	2	8	17531	17538	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020127	TAAA	2	8	17575	17582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020127	TAGA	2	8	19293	19300	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020127	TTTA	2	8	20883	20890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020127	TATG	2	8	20953	20960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020127	TAAC	2	8	25091	25098	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_020127	AAAT	2	8	34502	34509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020127	TAGA	2	8	34586	34593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020127	TAGT	2	8	35882	35889	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020127	AGTA	2	8	38017	38024	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020127	GTTT	2	8	38257	38264	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020127	AATA	3	12	40876	40887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020127	AATT	2	8	40963	40970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020127	TAGA	2	8	42680	42687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020127	ATAA	2	8	44279	44286	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020127	TTGT	2	8	45267	45274	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020127	AATA	2	8	45833	45840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020127	AGTT	2	8	47567	47574	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020127	TAAA	2	8	47628	47635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020127	TAAT	3	12	47636	47647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020127	TACA	2	8	49819	49826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020127	ACAA	2	8	53300	53307	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020127	TAGC	2	8	53693	53700	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_020127	TAGT	2	8	53852	53859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020127	TAAC	2	8	55860	55867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020127	TATT	2	8	55981	55988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020127	ATAG	2	8	56159	56166	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020127	ATAG	2	8	56194	56201	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020127	AAGA	2	8	56448	56455	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020127	TTAA	2	8	56461	56468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020127	TAAA	2	8	56518	56525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020127	ATAA	2	8	56585	56592	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020127	TTAA	2	8	56713	56720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020127	ATTA	2	8	59430	59437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020127	ACTT	2	8	59609	59616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020127	TTAA	2	8	59642	59649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020127	TTAT	2	8	59704	59711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020127	TTTA	2	8	60966	60973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020127	TAAC	2	8	64393	64400	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020127	TTAA	2	8	64411	64418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020127	GTAG	2	8	65266	65273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020127	CAGT	2	8	65398	65405	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_020127	AGTA	2	8	65548	65555	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020127	TAAA	2	8	65807	65814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020127	GAAA	2	8	73668	73675	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020127	TAAA	2	8	73942	73949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020127	TATG	2	8	73961	73968	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020127	TAAC	2	8	74076	74083	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020127	GTTA	2	8	74104	74111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020127	TTAT	2	8	74746	74753	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020127	TTAT	2	8	75780	75787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020127	AGTT	2	8	77655	77662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020127	AAAT	2	8	80112	80119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020127	TAAT	2	8	81194	81201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020127	TATT	2	8	81221	81228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020127	TAAT	2	8	81230	81237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020127	GAAA	2	8	81598	81605	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020127	TTAC	2	8	81616	81623	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_020127	CAAT	2	8	82885	82892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_020127	TACA	2	8	83010	83017	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020127	AGTT	2	8	83106	83113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020127	GTAT	2	8	83315	83322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020127	TATT	2	8	84212	84219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020127	ATTT	2	8	84241	84248	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020127	TATT	2	8	84338	84345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020127	TATT	2	8	85527	85534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020127	AGTA	2	8	85728	85735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020127	GTTA	2	8	85796	85803	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020127	TAAC	2	8	86257	86264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020127	TGTT	2	8	90572	90579	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020127	TTAT	2	8	91493	91500	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020127	AATA	2	8	91513	91520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020127	ATTC	2	8	91768	91775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020127	TCAA	2	8	91996	92003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020127	TTAT	2	8	92222	92229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020127	GAAG	2	8	92288	92295	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020127	TATT	2	8	92423	92430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020127	GTTT	2	8	95430	95437	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020127	TCTA	2	8	96185	96192	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020127	ATCC	2	8	96252	96259	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_020127	GATA	2	8	96568	96575	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020127	TCTA	2	8	96612	96619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020127	TAAA	2	8	96643	96650	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020127	ATGA	2	8	97117	97124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020127	ATTA	2	8	97238	97245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020127	GAAA	2	8	97366	97373	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020127	AGAA	2	8	100070	100077	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020127	CTAT	2	8	103311	103318	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_020127	TTAT	2	8	103327	103334	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020127	TATC	2	8	105026	105033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_020127	GTAT	2	8	105068	105075	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020127	TCTA	2	8	108512	108519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_020127	TAAA	2	8	108591	108598	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020127	AGAT	2	8	108846	108853	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020127	ATGG	2	8	108930	108937	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020127	AGCC	2	8	109056	109063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020127	TGTT	2	8	109710	109717	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020127	CTTT	2	8	110030	110037	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020127	GGGA	2	8	110162	110169	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020127	ATAA	2	8	110226	110233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020127	GCTG	2	8	110293	110300	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_020127	TCCC	2	8	110355	110362	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_020127	ATAA	2	8	111387	111394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020127	ATTT	2	8	111553	111560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020127	TAAA	2	8	112201	112208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020127	TAGT	2	8	112230	112237	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020127	ACTA	2	8	112500	112507	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_020127	TTAA	2	8	112519	112526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020127	TAAT	2	8	114918	114925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020127	AGAA	2	8	116520	116527	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020127	TATT	2	8	119011	119018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020127	ATAG	2	8	123561	123568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020127	ATTA	2	8	123606	123613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020127	GTTA	2	8	123837	123844	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020127	AAAT	2	8	123883	123890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020127	TTTA	2	8	124140	124147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020127	GAAT	2	8	124229	124236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020127	TAAT	2	8	124293	124300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020127	TTAA	2	8	124309	124316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020127	AGAT	2	8	125300	125307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020127	TATT	2	8	127601	127608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020127	ATTT	2	8	133168	133175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020127	TCTA	2	8	133183	133190	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_020127	TAAA	3	12	134251	134262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020127	GTAT	2	8	138369	138376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020127	AGGT	2	8	138377	138384	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020127	ATAA	2	8	138487	138494	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020127	ATGA	2	8	138650	138657	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_020127	TAAG	2	8	608654	608661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
453	NC_020127	TAAC	2	8	612125	612132	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
454	NC_020127	AAAT	2	8	612140	612147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_020127	CCTA	2	8	614485	614492	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
456	NC_020127	TAAC	2	8	614551	614558	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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461	NC_020127	TATC	2	8	616759	616766	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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465	NC_020127	TATC	2	8	624178	624185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
466	NC_020127	AAAT	2	8	624195	624202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_020127	TAAT	2	8	624292	624299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_020127	CATG	2	8	624504	624511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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470	NC_020127	AATG	2	8	627593	627600	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
471	NC_020127	ACTC	2	8	628773	628780	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
472	NC_020127	TGTA	2	8	628812	628819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
473	NC_020127	TAGT	3	12	628921	628932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_020127	AATT	2	8	638634	638641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_020127	ACTA	2	8	651231	651238	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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480	NC_020127	GTAT	2	8	653797	653804	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
481	NC_020127	ATAC	2	8	664397	664404	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
482	NC_020127	TAAC	2	8	665183	665190	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
483	NC_020127	ATAA	2	8	665600	665607	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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489	NC_020127	AATC	2	8	673701	673708	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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498	NC_020127	CTAA	2	8	685083	685090	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
499	NC_020127	ATTG	2	8	685187	685194	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_020127	TTAG	2	8	686436	686443	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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