MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 7962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020127	T	6	6	194292	194297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_020127	GAA	2	6	194300	194305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020127	T	7	7	195564	195570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020127	A	7	7	197879	197885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020127	GAA	2	6	197889	197894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020127	TTC	2	6	197916	197921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_020127	A	6	6	199186	199191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_020127	GTT	2	6	199197	199202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_020127	TAAT	2	8	199217	199224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020127	GA	3	6	200522	200527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020127	ACACA	2	10	200535	200544	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1512	NC_020127	TCC	2	6	200809	200814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1513	NC_020127	T	6	6	200862	200867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_020127	TAA	2	6	200874	200879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_020127	CTT	2	6	201660	201665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_020127	CAA	2	6	201699	201704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_020127	T	6	6	201709	201714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_020127	T	6	6	201716	201721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_020127	T	6	6	201731	201736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_020127	TTA	2	6	202760	202765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_020127	TAT	2	6	202772	202777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_020127	TTA	2	6	204084	204089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_020127	CAG	2	6	204661	204666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_020127	TGT	2	6	204675	204680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_020127	GTG	2	6	204686	204691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_020127	TTGT	2	8	204698	204705	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_020127	AT	3	6	204717	204722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_020127	GA	3	6	204727	204732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_020127	TAA	2	6	205862	205867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_020127	ATTT	2	8	205876	205883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_020127	TTG	2	6	205905	205910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_020127	ATT	2	6	205911	205916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_020127	ACT	2	6	205948	205953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_020127	AGT	2	6	206502	206507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_020127	TAC	2	6	206521	206526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_020127	T	7	7	206542	206548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_020127	AAAATA	2	12	206550	206561	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_020127	GTG	2	6	206574	206579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_020127	AGCA	2	8	206686	206693	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_020127	T	6	6	206694	206699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_020127	TTA	2	6	206705	206710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_020127	CAT	2	6	206718	206723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_020127	TAAT	2	8	206803	206810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_020127	TAA	2	6	207455	207460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_020127	T	6	6	207473	207478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_020127	TAT	2	6	207486	207491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_020127	TA	3	6	210805	210810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_020127	T	6	6	210839	210844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_020127	TAAA	2	8	210858	210865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_020127	A	7	7	210863	210869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020127	GTGA	2	8	210870	210877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020127	TTG	2	6	210906	210911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_020127	ATT	2	6	210928	210933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_020127	T	6	6	210932	210937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_020127	ATA	2	6	210940	210945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_020127	T	6	6	211020	211025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_020127	T	8	8	211028	211035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_020127	T	6	6	211038	211043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_020127	A	6	6	211058	211063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_020127	TGA	2	6	211078	211083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1562	NC_020127	ATGTT	2	10	211152	211161	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_020127	ATT	2	6	211174	211179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_020127	A	6	6	211226	211231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_020127	T	6	6	211285	211290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_020127	TCAT	2	8	211309	211316	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_020127	TAC	2	6	211341	211346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_020127	T	6	6	211361	211366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_020127	ATA	2	6	211370	211375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_020127	CT	3	6	211390	211395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_020127	TTA	2	6	211400	211405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_020127	T	6	6	211420	211425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020127	TAAATT	2	12	211435	211446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_020127	TGA	2	6	211452	211457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_020127	T	6	6	211515	211520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_020127	ATT	2	6	211523	211528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_020127	AGT	2	6	211531	211536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_020127	AGTTAT	2	12	211543	211554	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_020127	T	6	6	211554	211559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_020127	TTA	2	6	211583	211588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_020127	ATA	2	6	213261	213266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_020127	ATCA	2	8	213272	213279	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1583	NC_020127	ATTT	2	8	213286	213293	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_020127	ATT	3	9	213300	213308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_020127	TAT	2	6	213309	213314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_020127	TTA	3	9	213315	213323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_020127	TA	3	6	213327	213332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_020127	GTA	2	6	213345	213350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_020127	ATA	2	6	213351	213356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_020127	ATG	2	6	216179	216184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_020127	TAT	2	6	216197	216202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_020127	GTA	2	6	216245	216250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_020127	TAAA	2	8	216284	216291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_020127	A	7	7	216289	216295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_020127	GA	3	6	216296	216301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_020127	AGT	2	6	216346	216351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1600	NC_020127	TAG	2	6	216373	216378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1602	NC_020127	T	6	6	216410	216415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_020127	AG	3	6	216442	216447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_020127	TAT	2	6	216502	216507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_020127	A	7	7	216526	216532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_020127	AT	3	6	216537	216542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_020127	ACTA	2	8	216546	216553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_020127	AAAG	2	8	216578	216585	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_020127	TTAT	2	8	218030	218037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_020127	TAT	3	9	218052	218060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_020127	AGA	2	6	218127	218132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_020127	TA	3	6	218190	218195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_020127	TTA	2	6	218209	218214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_020127	AATAA	2	10	218245	218254	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_020127	AGA	2	6	218259	218264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_020127	AAGT	2	8	218290	218297	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_020127	TTA	2	6	218310	218315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_020127	T	7	7	218349	218355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_020127	T	7	7	218405	218411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_020127	T	6	6	218423	218428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_020127	T	6	6	218433	218438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_020127	GTT	2	6	218443	218448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_020127	TTA	2	6	218466	218471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_020127	AGTT	2	8	218473	218480	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_020127	ATTA	2	8	218481	218488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_020127	TAT	2	6	218490	218495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_020127	T	12	12	218498	218509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_020127	ATT	2	6	218583	218588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_020127	TCA	2	6	218600	218605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_020127	TAT	2	6	218611	218616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_020127	ATT	2	6	218633	218638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_020127	CT	3	6	218645	218650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_020127	TTAT	2	8	218672	218679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_020127	A	7	7	218709	218715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_020127	CAT	2	6	220881	220886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_020127	T	9	9	220950	220958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_020127	GAG	2	6	220959	220964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1639	NC_020127	ATG	2	6	221109	221114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1641	NC_020127	GGT	2	6	222902	222907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1642	NC_020127	GA	3	6	222929	222934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1661	NC_020127	TA	4	8	223879	223886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1682	NC_020127	TGGA	2	8	225583	225590	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1774	NC_020127	ATA	2	6	246933	246938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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