MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 7962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020127	AT	3	6	65186	65191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020127	TAA	2	6	65204	65209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020127	TA	3	6	65234	65239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_020127	GTAG	2	8	65266	65273	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020127	TA	4	8	65306	65313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020127	T	6	6	65318	65323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_020127	AT	3	6	65328	65333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_020127	CAGT	2	8	65398	65405	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
509	NC_020127	TTG	2	6	65443	65448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_020127	A	6	6	65450	65455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020127	TAA	2	6	65496	65501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_020127	AGTA	2	8	65548	65555	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
513	NC_020127	CTC	2	6	65586	65591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_020127	AGA	2	6	65656	65661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_020127	ATG	2	6	65733	65738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020127	AGT	2	6	65745	65750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_020127	AT	3	6	65755	65760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020127	AT	4	8	65762	65769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020127	TAAA	2	8	65807	65814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020127	A	7	7	73647	73653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_020127	TGA	2	6	73656	73661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_020127	GAAA	2	8	73668	73675	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020127	TTA	2	6	73712	73717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020127	AT	3	6	73770	73775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_020127	AAG	3	9	73793	73801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_020127	A	6	6	73815	73820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_020127	AGT	2	6	73861	73866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020127	TAAA	2	8	73942	73949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_020127	TATG	2	8	73961	73968	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020127	T	6	6	74007	74012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_020127	T	6	6	74018	74023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020127	TAAC	2	8	74076	74083	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
533	NC_020127	GTTA	2	8	74104	74111	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_020127	TTA	2	6	74172	74177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020127	TAT	2	6	74183	74188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_020127	T	7	7	74188	74194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_020127	GTA	2	6	74202	74207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020127	T	7	7	74581	74587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_020127	ATC	2	6	74590	74595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_020127	T	8	8	74597	74604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020127	CAATT	2	10	74640	74649	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
542	NC_020127	TAG	3	9	74674	74682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020127	AT	3	6	74705	74710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020127	TAACTA	2	12	74724	74735	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
545	NC_020127	TTAT	2	8	74746	74753	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020127	T	7	7	74810	74816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020127	ATATA	2	10	74831	74840	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020127	GTTAT	2	10	74849	74858	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
549	NC_020127	TAC	2	6	74876	74881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_020127	TAT	2	6	74882	74887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_020127	TTAT	2	8	75780	75787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020127	TAA	2	6	75834	75839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020127	GTA	2	6	75857	75862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_020127	TAG	2	6	75867	75872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_020127	CTA	2	6	75879	75884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_020127	T	6	6	75894	75899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_020127	TAA	2	6	75901	75906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020127	TAA	3	9	77607	77615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_020127	TATGA	2	10	77620	77629	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
560	NC_020127	AG	3	6	77630	77635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020127	AGTT	2	8	77655	77662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
562	NC_020127	A	6	6	77668	77673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020127	ATT	3	9	80101	80109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_020127	AAAT	2	8	80112	80119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_020127	TA	3	6	80154	80159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020127	TAA	2	6	80181	80186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020127	ATA	2	6	80201	80206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020127	TTA	2	6	80212	80217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_020127	AT	3	6	80220	80225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_020127	TTA	2	6	80287	80292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_020127	ATT	2	6	80299	80304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_020127	T	7	7	80312	80318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_020127	ATA	2	6	80319	80324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020127	AGA	2	6	80340	80345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020127	TAT	2	6	80357	80362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_020127	TAA	2	6	80364	80369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_020127	ATA	2	6	80379	80384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_020127	T	6	6	80397	80402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_020127	ATA	2	6	80947	80952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_020127	TAT	2	6	80973	80978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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583	NC_020127	AT	3	6	81061	81066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_020127	TTA	2	6	81071	81076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020127	T	8	8	81080	81087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020127	CTT	2	6	81089	81094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_020127	ATCTT	2	10	81098	81107	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
588	NC_020127	T	7	7	81135	81141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020127	TAAT	2	8	81194	81201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020127	TATT	2	8	81221	81228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_020127	TAAT	2	8	81230	81237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_020127	ATA	2	6	81246	81251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020127	AAT	2	6	81252	81257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020127	ATA	2	6	81283	81288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_020127	TA	4	8	81298	81305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_020127	TTA	2	6	81318	81323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_020127	ATAATT	2	12	81324	81335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_020127	T	6	6	81351	81356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_020127	TTA	2	6	81390	81395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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601	NC_020127	TA	3	6	81422	81427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_020127	ATCTA	2	10	81428	81437	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
603	NC_020127	TAATT	2	10	81441	81450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020127	AAT	2	6	81463	81468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_020127	A	6	6	81482	81487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020127	GAT	2	6	81503	81508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_020127	AT	4	8	81563	81570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020127	TTG	2	6	81578	81583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_020127	TA	3	6	81584	81589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_020127	T	6	6	81592	81597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020127	GAAA	2	8	81598	81605	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020127	TTAC	2	8	81616	81623	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
613	NC_020127	AAT	2	6	81627	81632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020127	AAT	2	6	82486	82491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020127	TA	3	6	82542	82547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020127	CAAT	2	8	82885	82892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
617	NC_020127	AAT	2	6	82928	82933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020127	TAT	3	9	82936	82944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020127	TTA	2	6	82997	83002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020127	TACA	2	8	83010	83017	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_020127	ATT	2	6	83031	83036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020127	TAA	2	6	83037	83042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020127	T	6	6	83044	83049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020127	ATT	2	6	83050	83055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020127	TTATT	2	10	83088	83097	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020127	AGTT	2	8	83106	83113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
627	NC_020127	TAC	2	6	83132	83137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_020127	ATT	2	6	83166	83171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020127	A	6	6	83174	83179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_020127	TTA	2	6	83206	83211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_020127	TA	4	8	83214	83221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_020127	TTA	2	6	83227	83232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_020127	TA	3	6	83231	83236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_020127	TTATT	2	10	83245	83254	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_020127	GTAT	2	8	83315	83322	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
636	NC_020127	TA	3	6	83331	83336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_020127	A	6	6	83357	83362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_020127	AGC	2	6	84096	84101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_020127	TCA	2	6	84119	84124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_020127	T	6	6	84128	84133	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_020127	T	6	6	84166	84171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_020127	AAT	2	6	84183	84188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_020127	T	6	6	84205	84210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_020127	TATT	2	8	84212	84219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
645	NC_020127	ACTTT	2	10	84230	84239	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
646	NC_020127	ATTT	2	8	84241	84248	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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