MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 7962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_020127	TTA	2	6	1385353	1385358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_020127	AGTA	2	8	1385410	1385417	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_020127	AGA	2	6	1385930	1385935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7504	NC_020127	ATG	2	6	1385936	1385941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_020127	AGG	2	6	1387375	1387380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_020127	T	7	7	1388304	1388310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_020127	ATT	2	6	1388318	1388323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_020127	TAA	2	6	1388373	1388378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_020127	TTAAG	2	10	1388411	1388420	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7510	NC_020127	ATA	2	6	1388426	1388431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_020127	CATA	2	8	1388433	1388440	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7512	NC_020127	TAA	2	6	1389199	1389204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_020127	ATCT	2	8	1390073	1390080	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7514	NC_020127	AAT	2	6	1390503	1390508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7515	NC_020127	A	6	6	1391302	1391307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7516	NC_020127	AT	3	6	1392334	1392339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7517	NC_020127	ATAG	2	8	1392341	1392348	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_020127	CT	3	6	1394413	1394418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7519	NC_020127	ATT	2	6	1394443	1394448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7520	NC_020127	GTT	2	6	1394463	1394468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_020127	AAT	2	6	1394548	1394553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_020127	TTA	2	6	1394554	1394559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_020127	TAA	2	6	1394562	1394567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7524	NC_020127	TTTTA	2	10	1394568	1394577	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_020127	GTA	2	6	1394628	1394633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_020127	GTAAT	2	10	1394660	1394669	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7527	NC_020127	AT	3	6	1394668	1394673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_020127	AT	3	6	1394688	1394693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_020127	TA	3	6	1394700	1394705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_020127	TA	3	6	1394709	1394714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_020127	G	6	6	1400114	1400119	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_020127	TGT	2	6	1400537	1400542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_020127	GTAA	2	8	1403589	1403596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_020127	ACT	2	6	1403616	1403621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7535	NC_020127	TAAC	2	8	1403651	1403658	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7536	NC_020127	ATT	2	6	1403664	1403669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7537	NC_020127	TAT	2	6	1403678	1403683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7538	NC_020127	CT	3	6	1403726	1403731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7539	NC_020127	AAG	2	6	1403748	1403753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7540	NC_020127	GTT	2	6	1403764	1403769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_020127	TA	3	6	1403829	1403834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_020127	GGC	2	6	1403885	1403890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7543	NC_020127	TGTA	2	8	1404060	1404067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7544	NC_020127	GAT	2	6	1404133	1404138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_020127	ACTGGA	2	12	1404170	1404181	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7546	NC_020127	GCA	2	6	1404206	1404211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7547	NC_020127	CGC	2	6	1404253	1404258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7548	NC_020127	G	6	6	1404297	1404302	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7549	NC_020127	ATGG	2	8	1404308	1404315	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_020127	CAG	2	6	1404375	1404380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7551	NC_020127	GC	3	6	1404431	1404436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7552	NC_020127	GGT	2	6	1404440	1404445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7553	NC_020127	TA	3	6	1404446	1404451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_020127	GGA	2	6	1404566	1404571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7555	NC_020127	GGC	2	6	1404586	1404591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7556	NC_020127	GAA	2	6	1404826	1404831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_020127	TGC	2	6	1404904	1404909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7558	NC_020127	GTC	2	6	1404916	1404921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7559	NC_020127	AG	3	6	1405007	1405012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_020127	GGA	2	6	1405030	1405035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_020127	GAC	2	6	1405043	1405048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7562	NC_020127	TCA	2	6	1405055	1405060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7563	NC_020127	AC	3	6	1405081	1405086	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7564	NC_020127	TAC	2	6	1405088	1405093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7565	NC_020127	CA	3	6	1405101	1405106	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7566	NC_020127	GCA	2	6	1405111	1405116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7567	NC_020127	A	6	6	1405141	1405146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_020127	AC	3	6	1405250	1405255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7569	NC_020127	CAC	2	6	1405265	1405270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7570	NC_020127	GTC	2	6	1405319	1405324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7571	NC_020127	CCT	2	6	1405393	1405398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7572	NC_020127	GAA	2	6	1405404	1405409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7573	NC_020127	AGA	2	6	1405443	1405448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_020127	GGT	2	6	1405472	1405477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7575	NC_020127	CCA	2	6	1405529	1405534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7576	NC_020127	GT	3	6	1405539	1405544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_020127	AAC	2	6	1405565	1405570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7578	NC_020127	GAA	2	6	1405582	1405587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7579	NC_020127	CCA	2	6	1405674	1405679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7580	NC_020127	GAA	2	6	1405680	1405685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_020127	GA	3	6	1405736	1405741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7582	NC_020127	ATA	2	6	1405815	1405820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7583	NC_020127	CAA	2	6	1405825	1405830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7584	NC_020127	GAA	2	6	1405856	1405861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7585	NC_020127	GGA	2	6	1406021	1406026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7586	NC_020127	GTA	2	6	1406049	1406054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7587	NC_020127	GCGA	2	8	1406058	1406065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7588	NC_020127	GAGAA	2	10	1406143	1406152	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7589	NC_020127	AG	3	6	1406170	1406175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7590	NC_020127	G	6	6	1406256	1406261	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_020127	TCC	2	6	1406266	1406271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7592	NC_020127	CTC	2	6	1406283	1406288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7593	NC_020127	GGA	2	6	1406572	1406577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7594	NC_020127	TCAA	2	8	1406633	1406640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7595	NC_020127	AT	3	6	1406668	1406673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7596	NC_020127	GATT	2	8	1406690	1406697	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7597	NC_020127	CGG	2	6	1406793	1406798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7598	NC_020127	CGT	2	6	1406810	1406815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7599	NC_020127	GGT	2	6	1406875	1406880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7600	NC_020127	TA	3	6	1406888	1406893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7601	NC_020127	AGC	2	6	1406915	1406920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7602	NC_020127	AAAG	2	8	1406929	1406936	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7603	NC_020127	TAAGG	2	10	1407192	1407201	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_020127	AGGC	2	8	1407280	1407287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7605	NC_020127	GGCA	2	8	1407328	1407335	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7606	NC_020127	CCA	2	6	1407339	1407344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7607	NC_020127	AT	3	6	1407422	1407427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7608	NC_020127	GA	3	6	1407486	1407491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7609	NC_020127	GAA	2	6	1407533	1407538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7610	NC_020127	TGG	3	9	1407596	1407604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7611	NC_020127	GAC	2	6	1407646	1407651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7612	NC_020127	AGG	2	6	1407691	1407696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_020127	GCAA	2	8	1407704	1407711	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7614	NC_020127	CGG	2	6	1407737	1407742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7615	NC_020127	ACC	2	6	1408008	1408013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7616	NC_020127	TGG	2	6	1408068	1408073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_020127	CCT	2	6	1408095	1408100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7618	NC_020127	AGAC	2	8	1408187	1408194	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7619	NC_020127	GGT	2	6	1408231	1408236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7620	NC_020127	CGA	2	6	1408315	1408320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7622	NC_020127	CGT	2	6	1408426	1408431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7623	NC_020127	TCT	2	6	1408450	1408455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7624	NC_020127	TGG	2	6	1408519	1408524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7625	NC_020127	TGT	2	6	1408528	1408533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7626	NC_020127	TG	3	6	1408561	1408566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7627	NC_020127	C	6	6	1408622	1408627	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7628	NC_020127	TTC	2	6	1408744	1408749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7629	NC_020127	GGA	2	6	1408782	1408787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7630	NC_020127	GAT	2	6	1408839	1408844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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