MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 7962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_020127	GGCAG	2	10	1163559	1163568	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6502	NC_020127	ATA	2	6	1163644	1163649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_020127	A	6	6	1165061	1165066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_020127	AT	3	6	1165087	1165092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_020127	TGG	2	6	1165302	1165307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_020127	ACG	2	6	1165338	1165343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_020127	CTG	2	6	1165422	1165427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_020127	GCT	2	6	1165439	1165444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_020127	A	6	6	1165510	1165515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_020127	CTA	2	6	1165532	1165537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_020127	AAT	2	6	1165565	1165570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_020127	T	6	6	1168341	1168346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_020127	AT	3	6	1168390	1168395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_020127	A	6	6	1168411	1168416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_020127	TTG	2	6	1168440	1168445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_020127	A	6	6	1168446	1168451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_020127	AGC	2	6	1168460	1168465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_020127	TAT	2	6	1169753	1169758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_020127	TAT	3	9	1169763	1169771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_020127	TTA	2	6	1169797	1169802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_020127	TAAA	2	8	1169814	1169821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_020127	TTCT	2	8	1169822	1169829	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6523	NC_020127	T	6	6	1169857	1169862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_020127	T	7	7	1169890	1169896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_020127	ATT	2	6	1169897	1169902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_020127	TAA	2	6	1171310	1171315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_020127	ATT	2	6	1171350	1171355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_020127	TTA	2	6	1171367	1171372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_020127	CTA	2	6	1174648	1174653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_020127	CAT	2	6	1174656	1174661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_020127	AAG	2	6	1174675	1174680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_020127	AT	3	6	1174725	1174730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_020127	TAATT	2	10	1175243	1175252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_020127	ATT	3	9	1175250	1175258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_020127	T	7	7	1175277	1175283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_020127	GAAT	2	8	1175337	1175344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_020127	AT	3	6	1175343	1175348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_020127	GA	3	6	1175379	1175384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_020127	ATTAA	2	10	1175393	1175402	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_020127	ATT	2	6	1175437	1175442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_020127	TTTG	2	8	1175451	1175458	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_020127	ACTAT	2	10	1176350	1176359	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6543	NC_020127	TAA	2	6	1176361	1176366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_020127	TA	4	8	1176372	1176379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_020127	AAT	2	6	1176386	1176391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_020127	GTTA	2	8	1176452	1176459	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_020127	TGT	2	6	1176483	1176488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_020127	GGA	2	6	1176489	1176494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_020127	TTTGT	2	10	1176882	1176891	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_020127	ATT	3	9	1176906	1176914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_020127	TAC	2	6	1176926	1176931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6553	NC_020127	A	6	6	1176976	1176981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_020127	GA	3	6	1177485	1177490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_020127	ATA	2	6	1180723	1180728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_020127	AGT	2	6	1180762	1180767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_020127	AGA	2	6	1180837	1180842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_020127	AAG	2	6	1180852	1180857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_020127	T	7	7	1180898	1180904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_020127	ATGG	2	8	1180910	1180917	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_020127	T	8	8	1181215	1181222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_020127	ATG	2	6	1181258	1181263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_020127	T	6	6	1181285	1181290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_020127	AAT	2	6	1181317	1181322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_020127	ATA	3	9	1181323	1181331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_020127	TTAA	2	8	1181347	1181354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_020127	T	8	8	1181358	1181365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_020127	TA	3	6	1181373	1181378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_020127	T	6	6	1181379	1181384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_020127	TA	3	6	1181421	1181426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_020127	ATT	2	6	1181434	1181439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_020127	TA	3	6	1181443	1181448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_020127	TTTA	2	8	1181451	1181458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_020127	A	6	6	1181463	1181468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_020127	TAAC	2	8	1181490	1181497	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6576	NC_020127	TAAA	3	12	1181503	1181514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_020127	AT	3	6	1181525	1181530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6579	NC_020127	TTA	2	6	1181553	1181558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_020127	TAGT	2	8	1181578	1181585	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_020127	TA	3	6	1181623	1181628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_020127	TATTT	2	10	1181643	1181652	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_020127	AT	3	6	1181653	1181658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_020127	ATT	2	6	1181672	1181677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_020127	TA	3	6	1181685	1181690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_020127	ATA	2	6	1181765	1181770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6588	NC_020127	TAA	2	6	1183777	1183782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_020127	TATC	2	8	1183806	1183813	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6590	NC_020127	TAATA	2	10	1183828	1183837	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_020127	TA	3	6	1183844	1183849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_020127	T	6	6	1183861	1183866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_020127	ATG	2	6	1183916	1183921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6596	NC_020127	ACC	2	6	1185691	1185696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6601	NC_020127	ATA	2	6	1187153	1187158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_020127	TAT	2	6	1187175	1187180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6603	NC_020127	ATATA	2	10	1187186	1187195	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_020127	ATG	2	6	1188330	1188335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_020127	TTA	2	6	1188336	1188341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_020127	CTTT	2	8	1188350	1188357	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6607	NC_020127	T	6	6	1188368	1188373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_020127	AT	3	6	1188439	1188444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_020127	AT	3	6	1188446	1188451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_020127	T	7	7	1188470	1188476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_020127	AAT	2	6	1188517	1188522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_020127	AT	3	6	1188544	1188549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_020127	A	6	6	1188550	1188555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_020127	TTA	2	6	1188571	1188576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_020127	TTA	2	6	1188578	1188583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_020127	ATA	2	6	1188615	1188620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_020127	AG	3	6	1188673	1188678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_020127	TA	3	6	1188712	1188717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_020127	AGC	2	6	1188766	1188771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_020127	TGA	2	6	1188776	1188781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_020127	GAA	2	6	1188801	1188806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6624	NC_020127	TAGT	2	8	1188962	1188969	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_020127	ATTA	2	8	1188990	1188997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6626	NC_020127	TAT	2	6	1189000	1189005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_020127	T	7	7	1189609	1189615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_020127	AAAC	2	8	1189653	1189660	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6629	NC_020127	T	8	8	1190413	1190420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_020127	ATC	2	6	1191138	1191143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6632	NC_020127	TAT	2	6	1193835	1193840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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