MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Liberibacter crescens BT-1 chromosome

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019907	AGAAAA	2	12	12466	12477	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019907	ATAATT	2	12	38178	38189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019907	GTAGAA	2	12	38218	38229	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019907	TATTTT	2	12	49418	49429	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019907	TATATT	2	12	52276	52287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019907	AAATTA	2	12	73555	73566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019907	GGAATC	2	12	79225	79236	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_019907	ATAGAA	2	12	85525	85536	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019907	ATTTTT	2	12	90336	90347	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019907	ATCTTT	2	12	97138	97149	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_019907	TGTTTT	2	12	163918	163929	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019907	TGTTTT	2	12	165359	165370	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019907	ATTTTT	2	12	199752	199763	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019907	ACAGAA	2	12	215470	215481	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_019907	TTTTTA	2	12	215495	215506	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019907	CAAAAT	2	12	246066	246077	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_019907	AGTAAA	2	12	249892	249903	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019907	ATTGGC	2	12	255936	255947	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_019907	ATTTTT	2	12	342293	342304	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019907	TTCAAG	2	12	353261	353272	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019907	TATTTT	2	12	373866	373877	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019907	TTTATT	2	12	397123	397134	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019907	GATTTA	2	12	415256	415267	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019907	GGAGAA	2	12	486988	486999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019907	GTTATT	2	12	489623	489634	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019907	TAGTGT	2	12	494042	494053	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019907	AGGAAT	2	12	501419	501430	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019907	TTATTT	2	12	510256	510267	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019907	ATAAAA	2	12	532017	532028	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019907	TGGGGT	2	12	534760	534771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019907	ATTACA	2	12	583395	583406	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_019907	TATAAA	2	12	588951	588962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019907	TAGAAA	2	12	604827	604838	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019907	TAGAAA	2	12	605328	605339	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019907	ACTTTA	2	12	606845	606856	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_019907	ATTTTA	2	12	647536	647547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019907	GTTACT	2	12	651995	652006	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_019907	ACTCAA	2	12	679480	679491	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019907	TAATAT	2	12	682919	682930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019907	TATTTA	2	12	684838	684849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019907	TTTATA	2	12	689846	689857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019907	TATGTG	2	12	694175	694186	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019907	AAATTA	2	12	704008	704019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019907	AATTTT	2	12	717620	717631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019907	AATTTT	2	12	735459	735470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019907	GACGTT	2	12	750299	750310	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_019907	TCAGGA	2	12	755103	755114	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_019907	GACAAA	2	12	762815	762826	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_019907	ATTGAT	2	12	767043	767054	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019907	AAGAAA	2	12	769971	769982	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019907	ATTGAT	2	12	779672	779683	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019907	GGAAAG	2	12	815735	815746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019907	TTCTTT	2	12	820541	820552	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_019907	ACAATT	2	12	822705	822716	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019907	TATCAC	2	12	823576	823587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019907	ATTTTA	2	12	823605	823616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019907	AATATA	2	12	834570	834581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019907	TGTTCT	2	12	865812	865823	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_019907	TACTGC	2	12	865910	865921	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019907	ATTTTT	2	12	902742	902753	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019907	CTTTTT	2	12	910517	910528	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_019907	AAAGAA	2	12	941623	941634	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019907	AATTTA	2	12	1002781	1002792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019907	TAATTT	2	12	1008677	1008688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019907	TAAAAT	2	12	1025965	1025976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019907	ATTTTT	2	12	1066240	1066251	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019907	TAAAAA	2	12	1088930	1088941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019907	ACTGAA	2	12	1106916	1106927	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_019907	TTAAAA	2	12	1112019	1112030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019907	TAAATT	2	12	1116932	1116943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019907	AAAAAC	2	12	1116971	1116982	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_019907	ATAAAA	2	12	1127081	1127092	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019907	AAAAAG	2	12	1154181	1154192	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019907	CATATA	2	12	1165684	1165695	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_019907	ATTATA	2	12	1171407	1171418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019907	TATTCT	2	12	1191548	1191559	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_019907	TTAATA	2	12	1213897	1213908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019907	ATATTA	2	12	1226840	1226851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019907	CAGGAA	2	12	1233295	1233306	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_019907	TTTTGA	2	12	1236425	1236436	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019907	ATATGA	2	12	1249042	1249053	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019907	CTATTA	2	12	1254651	1254662	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_019907	TACAAA	2	12	1264640	1264651	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_019907	TAAAAA	2	12	1287231	1287242	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019907	TTTTAA	2	12	1291542	1291553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019907	ATTTTT	2	12	1301336	1301347	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019907	AAGTTG	2	12	1311424	1311435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019907	CAAAAA	2	12	1327567	1327578	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019907	GTATTA	2	12	1403265	1403276	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019907	AAATAT	2	12	1407114	1407125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019907	TTTATT	2	12	1410731	1410742	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019907	CTCAAT	2	12	1450064	1450075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019907	AATTAA	2	12	1476252	1476263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.