MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 18293

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019683	AG	3	6	258702	258707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_019683	TCGAG	2	10	258765	258774	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1003	NC_019683	TAA	2	6	258861	258866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_019683	A	6	6	260169	260174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_019683	CTA	2	6	260175	260180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_019683	AATA	2	8	260221	260228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_019683	GAA	2	6	262413	262418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_019683	TCT	3	9	262453	262461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_019683	GAA	2	6	262755	262760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_019683	GGGTT	2	10	262802	262811	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_019683	TCAC	2	8	262901	262908	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_019683	GAA	2	6	262917	262922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_019683	GTTC	2	8	262923	262930	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_019683	TATT	2	8	262950	262957	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_019683	T	6	6	262962	262967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_019683	TAT	2	6	262989	262994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_019683	GAA	2	6	263037	263042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_019683	T	6	6	263073	263078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_019683	GTT	2	6	263089	263094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_019683	AAC	2	6	263455	263460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_019683	CAA	2	6	264421	264426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_019683	AG	3	6	264442	264447	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_019683	TAA	2	6	264453	264458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_019683	ACA	2	6	264495	264500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_019683	AG	3	6	264571	264576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_019683	T	6	6	266399	266404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_019683	CAT	2	6	266666	266671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_019683	A	7	7	266676	266682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_019683	CAA	2	6	266709	266714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_019683	ATC	2	6	266750	266755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_019683	AGC	2	6	266771	266776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_019683	TTC	2	6	267519	267524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_019683	TCA	2	6	268468	268473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_019683	ATT	2	6	268477	268482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_019683	GAA	2	6	268540	268545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_019683	AGC	2	6	268561	268566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_019683	ACC	2	6	269116	269121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_019683	A	7	7	269123	269129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_019683	TTA	2	6	270462	270467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_019683	ATT	2	6	272255	272260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_019683	ATC	2	6	272306	272311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_019683	A	6	6	272331	272336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_019683	GAA	2	6	272440	272445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_019683	TTGA	2	8	273713	273720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_019683	ATT	2	6	273758	273763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_019683	CAA	2	6	273789	273794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_019683	A	6	6	273793	273798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_019683	A	6	6	273851	273856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_019683	T	6	6	276051	276056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019683	CGC	2	6	276118	276123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_019683	GT	3	6	277458	277463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_019683	AGG	2	6	277522	277527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_019683	AAC	2	6	277629	277634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_019683	TCA	3	9	277651	277659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_019683	AAT	2	6	277673	277678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_019683	CAG	2	6	277726	277731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_019683	ATT	2	6	277742	277747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_019683	TCA	2	6	286883	286888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_019683	AAAAG	2	10	286921	286930	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_019683	AG	4	8	286949	286956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_019683	T	6	6	288792	288797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_019683	TTAA	2	8	288811	288818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_019683	TGA	2	6	288854	288859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_019683	GAT	2	6	292743	292748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_019683	AATAA	2	10	292764	292773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_019683	CG	3	6	292774	292779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_019683	TCA	2	6	294670	294675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_019683	CAA	2	6	294684	294689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_019683	ATT	2	6	297099	297104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_019683	A	6	6	297188	297193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_019683	TG	5	10	298669	298678	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_019683	T	6	6	298690	298695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_019683	ATC	2	6	298756	298761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_019683	ATG	2	6	298771	298776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_019683	TATG	2	8	298784	298791	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_019683	CCA	2	6	298946	298951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_019683	TAT	2	6	298986	298991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_019683	GT	3	6	300762	300767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_019683	T	7	7	302033	302039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_019683	TGTGG	2	10	304219	304228	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_019683	TTTG	2	8	304357	304364	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_019683	CAC	2	6	304419	304424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_019683	GCT	2	6	304453	304458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_019683	TCT	2	6	304475	304480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_019683	AAC	2	6	304489	304494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_019683	GAA	2	6	304509	304514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_019683	TA	3	6	304515	304520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_019683	TTA	2	6	306520	306525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_019683	AGT	2	6	306573	306578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_019683	ACA	2	6	306669	306674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_019683	ATC	2	6	306828	306833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_019683	AGT	2	6	306851	306856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_019683	CAG	2	6	308349	308354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_019683	TTC	2	6	309307	309312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_019683	ATT	2	6	309365	309370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_019683	ATC	2	6	309427	309432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_019683	TGT	2	6	309473	309478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_019683	TTC	2	6	309483	309488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_019683	GAA	2	6	309497	309502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_019683	AG	3	6	309523	309528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_019683	TCA	2	6	309574	309579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_019683	AAG	2	6	309660	309665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_019683	ATC	2	6	312179	312184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_019683	TGT	2	6	312225	312230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_019683	TCT	2	6	313193	313198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_019683	TTTC	2	8	313199	313206	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_019683	CTT	2	6	313260	313265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_019683	GAA	2	6	313270	313275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_019683	TC	4	8	313324	313331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_019683	CAC	2	6	313358	313363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_019683	ATAAA	2	10	313385	313394	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_019683	TGT	2	6	313851	313856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_019683	AT	3	6	313869	313874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_019683	T	7	7	314479	314485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_019683	T	7	7	314538	314544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_019683	ATGTT	2	10	314582	314591	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_019683	TCA	2	6	314595	314600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_019683	T	6	6	314666	314671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_019683	TC	3	6	314684	314689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_019683	ATC	2	6	314767	314772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_019683	TAG	2	6	314792	314797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_019683	TTTA	2	8	314825	314832	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_019683	TA	3	6	314831	314836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_019683	AAATA	2	10	314838	314847	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_019683	TTTA	2	8	314862	314869	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_019683	ATT	2	6	314943	314948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_019683	AAAT	2	8	314955	314962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_019683	TAA	2	6	314990	314995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_019683	TTG	2	6	315942	315947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_019683	A	6	6	315948	315953	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_019683	TTC	2	6	316015	316020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_019683	GAG	2	6	316104	316109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_019683	AGA	2	6	316485	316490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_019683	G	6	6	316510	316515	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_019683	CT	3	6	316523	316528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1136	NC_019683	CAG	3	9	316529	316537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_019683	A	6	6	316570	316575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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