MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9

Total Repeats: 12473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019435	CTA	3	9	1473	1481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019435	TAT	2	6	1486	1491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019435	T	6	6	2764	2769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019435	GGA	2	6	9696	9701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019435	ACT	2	6	10637	10642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019435	ATT	2	6	10687	10692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019435	TAAT	2	8	10726	10733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019435	AAATG	2	10	11880	11889	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019435	CAAA	2	8	11939	11946	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_019435	A	7	7	11944	11950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019435	AAGG	2	8	11972	11979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019435	AAT	2	6	12382	12387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019435	A	6	6	12390	12395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019435	TAA	2	6	12463	12468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019435	TAA	2	6	12476	12481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019435	A	10	10	12517	12526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019435	TGA	2	6	12527	12532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019435	ATT	2	6	12538	12543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019435	TA	3	6	12634	12639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019435	TA	4	8	13732	13739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019435	A	8	8	13744	13751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019435	T	8	8	13774	13781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019435	CTC	2	6	13783	13788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_019435	TAAA	2	8	13793	13800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019435	TAA	2	6	13808	13813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019435	TTA	2	6	13852	13857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019435	GAAAA	2	10	13869	13878	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019435	T	6	6	17987	17992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019435	TAAA	2	8	18140	18147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019435	ATA	2	6	18173	18178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019435	TAT	3	9	18205	18213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019435	CAAA	2	8	18229	18236	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019435	ATC	2	6	18532	18537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019435	TCT	2	6	19291	19296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_019435	ATT	2	6	19300	19305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019435	ACA	2	6	19367	19372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019435	ATT	2	6	19376	19381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019435	GAAT	2	8	19387	19394	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019435	A	6	6	22578	22583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019435	TACT	2	8	22595	22602	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_019435	TTA	2	6	22667	22672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019435	AAG	2	6	22684	22689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019435	TAA	3	9	22707	22715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019435	T	8	8	24840	24847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019435	AAT	2	6	24857	24862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019435	A	6	6	24883	24888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019435	TAT	2	6	24889	24894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019435	GAC	2	6	24924	24929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019435	TTA	2	6	24938	24943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019435	AT	3	6	24952	24957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019435	A	7	7	24991	24997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019435	ATA	2	6	25009	25014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019435	CAA	2	6	25038	25043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019435	CGG	2	6	25086	25091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019435	GGA	2	6	25126	25131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019435	GCGT	2	8	25185	25192	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019435	TCC	2	6	25209	25214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_019435	AGC	2	6	25236	25241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019435	TCG	2	6	25250	25255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019435	CGG	2	6	25352	25357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_019435	CTTAA	2	10	25458	25467	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_019435	AAGTC	2	10	25599	25608	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_019435	GTA	2	6	25690	25695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019435	ATG	2	6	25713	25718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019435	T	8	8	25769	25776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019435	TAA	2	6	25793	25798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019435	TTTA	2	8	25828	25835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019435	G	6	6	25990	25995	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019435	GATT	2	8	27726	27733	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019435	CAAAA	2	10	27759	27768	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_019435	TTG	2	6	29690	29695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019435	AT	3	6	31789	31794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019435	AAT	2	6	31836	31841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019435	ACG	2	6	31877	31882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019435	GAA	2	6	31911	31916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019435	A	7	7	32362	32368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019435	T	6	6	32389	32394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019435	ACC	2	6	32401	32406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_019435	AGA	2	6	32447	32452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019435	TAAA	2	8	32476	32483	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019435	AGTA	2	8	32489	32496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019435	A	8	8	33722	33729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019435	TTA	2	6	33741	33746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019435	T	7	7	33788	33794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019435	CGAA	2	8	33852	33859	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_019435	GGA	2	6	33921	33926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019435	T	7	7	33948	33954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019435	T	6	6	33988	33993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019435	A	6	6	34007	34012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019435	CCA	2	6	34019	34024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_019435	TA	3	6	34039	34044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019435	A	6	6	34047	34052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019435	T	7	7	34099	34105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019435	TAA	2	6	34114	34119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019435	AAT	2	6	34120	34125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019435	GA	3	6	34144	34149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019435	A	6	6	34199	34204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019435	A	7	7	34212	34218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019435	T	8	8	34240	34247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019435	ATG	2	6	34259	34264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019435	T	6	6	34281	34286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019435	A	6	6	34307	34312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019435	AAT	2	6	34352	34357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019435	ACTA	2	8	34400	34407	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_019435	T	6	6	34408	34413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019435	T	6	6	34433	34438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019435	AT	3	6	34439	34444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019435	TAC	2	6	34447	34452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019435	AAGT	2	8	34721	34728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019435	TGAT	2	8	34760	34767	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019435	TAAA	2	8	34771	34778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019435	A	7	7	34776	34782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019435	T	7	7	34804	34810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019435	T	7	7	36449	36455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019435	TAATC	2	10	36486	36495	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_019435	AAT	2	6	36497	36502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019435	TAGA	2	8	36529	36536	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019435	A	6	6	36549	36554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019435	AAAT	2	8	36560	36567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019435	TTA	2	6	36568	36573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019435	GAA	2	6	36594	36599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019435	AAT	2	6	36610	36615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019435	TTA	2	6	36626	36631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019435	GGCT	2	8	37194	37201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_019435	ATA	2	6	37220	37225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019435	TAA	2	6	37258	37263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019435	TAC	2	6	37348	37353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_019435	T	7	7	37522	37528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019435	AGTAA	2	10	37544	37553	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019435	ATA	2	6	37572	37577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019435	TAAAAT	2	12	38816	38827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019435	T	7	7	38859	38865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019435	AG	3	6	39736	39741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019435	A	7	7	39763	39769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019435	ATT	2	6	39780	39785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019435	TTTA	2	8	41311	41318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019435	T	6	6	41350	41355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019435	TAA	2	6	41367	41372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019435	CATT	2	8	41429	41436	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_019435	T	6	6	45179	45184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019435	A	6	6	46403	46408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019435	AATT	2	8	47292	47299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019435	A	6	6	47316	47321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019435	A	7	7	48013	48019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019435	AAC	2	6	48408	48413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019435	TTAT	2	8	49373	49380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019435	AGTTT	2	10	50519	50528	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019435	TAA	2	6	50561	50566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019435	A	7	7	50565	50571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019435	A	7	7	50573	50579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_019435	A	6	6	111661	111666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_019435	T	7	7	111677	111683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_019435	ATC	2	6	116317	116322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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488	NC_019435	ATA	2	6	116446	116451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_019435	T	6	6	116479	116484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_019435	A	6	6	116608	116613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_019435	TTC	2	6	116666	116671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_019435	TAT	2	6	116961	116966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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