MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9

Total Repeats: 12473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_019435	CAC	2	6	239702	239707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1002	NC_019435	ATG	2	6	239731	239736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_019435	TAC	2	6	239751	239756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_019435	CGA	2	6	239803	239808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_019435	TTA	2	6	239810	239815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_019435	TAT	2	6	239862	239867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_019435	TGG	2	6	239894	239899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_019435	TACTCT	2	12	239906	239917	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_019435	TCA	2	6	239933	239938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_019435	TAG	2	6	239947	239952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_019435	CTA	2	6	239965	239970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_019435	TTA	2	6	239995	240000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_019435	AAG	2	6	240006	240011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_019435	GTA	2	6	240048	240053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_019435	TGG	2	6	240068	240073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_019435	GAAG	2	8	240080	240087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_019435	TTTGG	2	10	240098	240107	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_019435	GAA	2	6	240146	240151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_019435	TTG	2	6	240168	240173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_019435	GAAAGG	2	12	240205	240216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_019435	GAT	2	6	240221	240226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_019435	TCT	2	6	240239	240244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_019435	TAC	2	6	240301	240306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_019435	GCT	2	6	240338	240343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_019435	T	6	6	240392	240397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_019435	TATT	2	8	240424	240431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_019435	T	6	6	241637	241642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_019435	TGA	2	6	241665	241670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_019435	AAG	2	6	241697	241702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_019435	TAAT	2	8	241769	241776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_019435	TTA	2	6	241841	241846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_019435	A	6	6	241897	241902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_019435	AAAT	2	8	241913	241920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_019435	TAG	2	6	242012	242017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_019435	AGA	2	6	242097	242102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_019435	A	6	6	242107	242112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_019435	A	6	6	242150	242155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_019435	GCA	2	6	242254	242259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_019435	TGA	2	6	242331	242336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_019435	A	8	8	242340	242347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_019435	AGA	2	6	242376	242381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_019435	AT	3	6	242406	242411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_019435	TAAAAA	2	12	242440	242451	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_019435	A	7	7	242447	242453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_019435	ATT	2	6	242518	242523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_019435	TGAAT	2	10	242554	242563	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_019435	CAA	2	6	242586	242591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_019435	TAA	2	6	243826	243831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_019435	TGAT	2	8	244960	244967	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_019435	TGC	2	6	244988	244993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_019435	AAAG	2	8	245428	245435	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_019435	TTTTA	2	10	245475	245484	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_019435	AGG	2	6	245509	245514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_019435	A	6	6	248205	248210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_019435	TTA	2	6	249647	249652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_019435	ATTT	2	8	249689	249696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_019435	TAT	3	9	249713	249721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_019435	AAAG	2	8	249727	249734	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_019435	AAT	2	6	249751	249756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_019435	TTGAT	2	10	249778	249787	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_019435	AGA	2	6	249831	249836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_019435	GAA	2	6	249850	249855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_019435	ATA	2	6	249908	249913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_019435	TTTG	2	8	249954	249961	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_019435	TTA	2	6	249993	249998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_019435	AAG	2	6	250101	250106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_019435	AAAAT	2	10	250132	250141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_019435	T	6	6	250148	250153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_019435	A	8	8	250172	250179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_019435	ATT	2	6	250254	250259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_019435	AGG	2	6	250261	250266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_019435	CGT	2	6	250274	250279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_019435	GAA	2	6	250376	250381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_019435	TCATG	2	10	250426	250435	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1076	NC_019435	AAT	2	6	251746	251751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_019435	TGAC	2	8	251763	251770	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_019435	GGA	2	6	251808	251813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_019435	GCTAT	2	10	251846	251855	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1080	NC_019435	T	6	6	253055	253060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_019435	ATT	2	6	253130	253135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_019435	T	7	7	253140	253146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_019435	TATTT	2	10	253184	253193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_019435	TTA	2	6	253194	253199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1087	NC_019435	TTA	2	6	253220	253225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_019435	A	6	6	253225	253230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_019435	AGG	2	6	253245	253250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_019435	ATT	2	6	253265	253270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_019435	ATG	2	6	253338	253343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_019435	CAG	2	6	253419	253424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_019435	TCA	2	6	253430	253435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_019435	TAT	2	6	253451	253456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_019435	TCTA	2	8	253533	253540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_019435	TTG	2	6	253557	253562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_019435	TTG	2	6	253725	253730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_019435	TGT	2	6	253774	253779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_019435	ATT	2	6	253817	253822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_019435	TG	3	6	253876	253881	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_019435	GGC	2	6	253885	253890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_019435	ATG	2	6	253913	253918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_019435	GAA	2	6	253964	253969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_019435	TTA	2	6	254014	254019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_019435	TGA	2	6	254074	254079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_019435	TAA	2	6	254092	254097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_019435	CCT	2	6	254185	254190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_019435	AAAAT	2	10	254211	254220	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_019435	CTAA	2	8	254294	254301	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_019435	GAA	3	9	254303	254311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_019435	A	6	6	254310	254315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_019435	AAT	2	6	254333	254338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_019435	TCTT	2	8	254401	254408	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_019435	AAG	2	6	254483	254488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_019435	T	7	7	254515	254521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_019435	GAA	2	6	254555	254560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_019435	TGGG	2	8	254597	254604	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_019435	TTC	2	6	254611	254616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_019435	TTA	2	6	254653	254658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_019435	AGAAA	2	10	254683	254692	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_019435	AAC	2	6	254715	254720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_019435	A	7	7	254802	254808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_019435	TGATTG	2	12	254841	254852	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_019435	CTT	2	6	254906	254911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_019435	AGC	2	6	254965	254970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_019435	ATT	2	6	254990	254995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_019435	ACGA	2	8	255024	255031	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_019435	ATT	2	6	255114	255119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_019435	A	7	7	255168	255174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_019435	CCA	2	6	255277	255282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_019435	T	7	7	257508	257514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_019435	TAAT	2	8	257530	257537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1276	NC_019435	A	6	6	282016	282021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1277	NC_019435	TCA	2	6	282039	282044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1279	NC_019435	TCA	2	6	282185	282190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1280	NC_019435	TCA	2	6	282226	282231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1281	NC_019435	GCTT	2	8	282259	282266	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1287	NC_019435	CAA	2	6	282539	282544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1291	NC_019435	TTC	2	6	282709	282714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1292	NC_019435	CGT	2	6	282798	282803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1307	NC_019435	ATC	2	6	283594	283599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1309	NC_019435	ATT	2	6	283691	283696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1310	NC_019435	ATT	2	6	283721	283726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1337	NC_019435	A	6	6	286415	286420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1338	NC_019435	T	7	7	287533	287539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1401	NC_019435	TCG	2	6	298875	298880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1403	NC_019435	CTTT	2	8	301170	301177	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1404	NC_019435	ATT	2	6	301227	301232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1407	NC_019435	T	6	6	301307	301312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1408	NC_019435	AGCC	2	8	301362	301369	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1409	NC_019435	AGT	2	6	301411	301416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_019435	AAAT	2	8	301456	301463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1411	NC_019435	A	7	7	301470	301476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_019435	GAA	2	6	301491	301496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1414	NC_019435	TAT	2	6	302320	302325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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