MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS7

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019431	AAGT	2	8	1522	1529	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019431	AATT	2	8	1537	1544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019431	ATAA	2	8	1670	1677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019431	TGGT	2	8	2974	2981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019431	ATAA	2	8	3125	3132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019431	TTTA	2	8	4664	4671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019431	TGAT	2	8	4789	4796	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019431	TCCT	2	8	6601	6608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_019431	GAAT	2	8	6699	6706	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019431	TTAT	2	8	7773	7780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019431	ATTA	2	8	8720	8727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019431	TAGA	2	8	11661	11668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019431	GTTG	2	8	11835	11842	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019431	AAGC	2	8	11874	11881	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_019431	TAAA	2	8	12296	12303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019431	ACCA	2	8	12304	12311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019431	TCAA	2	8	12453	12460	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_019431	TGAT	2	8	12485	12492	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019431	AGAT	2	8	12644	12651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019431	CAAA	2	8	12675	12682	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019431	AAGA	2	8	13505	13512	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019431	CAAT	2	8	14679	14686	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_019431	ATCA	2	8	15019	15026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_019431	ATAA	2	8	16125	16132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019431	TTTA	2	8	16219	16226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019431	TAAT	2	8	19712	19719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019431	ATAA	2	8	20838	20845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019431	TTTA	2	8	20866	20873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019431	TTAT	3	12	20923	20934	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019431	AAAT	2	8	21607	21614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019431	TGAT	2	8	21834	21841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019431	AACA	2	8	24726	24733	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_019431	ATTT	2	8	24778	24785	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019431	CAAT	2	8	26388	26395	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_019431	TAGG	2	8	26427	26434	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019431	GAAA	2	8	26544	26551	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019431	AGTC	2	8	26958	26965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_019431	AGTA	2	8	27100	27107	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019431	AAAG	2	8	32360	32367	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019431	AATA	2	8	32536	32543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019431	ATTT	2	8	32634	32641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019431	CAAA	2	8	32800	32807	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_019431	AACT	2	8	32809	32816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_019431	ATCT	2	8	32930	32937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_019431	AAAT	2	8	33050	33057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019431	GTTT	2	8	33361	33368	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019431	TTGG	2	8	34900	34907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019431	AGGA	2	8	35396	35403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019431	AAGT	2	8	37189	37196	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019431	GCTT	2	8	37395	37402	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_019431	ATAA	2	8	38674	38681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019431	TAAA	2	8	38985	38992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019431	TAAA	2	8	39090	39097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019431	GTAA	2	8	39229	39236	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019431	TTTG	2	8	42940	42947	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019431	ATGA	2	8	43032	43039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019431	AAAG	2	8	43509	43516	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019431	AAGA	2	8	43547	43554	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019431	AATG	2	8	43749	43756	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019431	CTTT	2	8	43781	43788	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_019431	GAAA	2	8	43864	43871	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019431	CTTC	2	8	44042	44049	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_019431	TCTT	2	8	44279	44286	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_019431	TGAC	2	8	44590	44597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019431	TTCT	2	8	46561	46568	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_019431	GAAA	2	8	46958	46965	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019431	TAAA	2	8	47003	47010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019431	AATT	2	8	47461	47468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019431	TAAT	2	8	47491	47498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019431	ATTC	2	8	48219	48226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_019431	GTCC	2	8	48576	48583	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_019431	AAAC	2	8	48659	48666	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_019431	AAAG	2	8	48912	48919	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019431	TAGA	2	8	50473	50480	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019431	AATT	2	8	52015	52022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019431	AAGC	2	8	52097	52104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_019431	AGCA	2	8	52110	52117	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_019431	GAAA	2	8	52409	52416	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019431	GTTA	2	8	52555	52562	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019431	TCTT	2	8	52964	52971	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.