MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019430	AAATG	2	10	5331	5340	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019430	TTTAT	2	10	13819	13828	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019430	CTCTA	2	10	24942	24951	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_019430	ATAAA	2	10	29303	29312	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019430	CCCAA	2	10	29771	29780	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_019430	TAAAT	2	10	37275	37284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019430	CTTTT	2	10	43037	43046	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_019430	TTAAG	2	10	46508	46517	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019430	TTTTA	2	10	46555	46564	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019430	CTTAA	2	10	48086	48095	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_019430	TAATT	2	10	48678	48687	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019430	TAGAG	2	10	49995	50004	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019430	AATTA	2	10	50225	50234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019430	ATTGA	2	10	53762	53771	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019430	TTCAA	2	10	60171	60180	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_019430	TTTTA	2	10	60284	60293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019430	ATAAA	2	10	63869	63878	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019430	AAAAT	2	10	65776	65785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019430	GAACG	2	10	66324	66333	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_019430	AAAAT	2	10	71845	71854	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019430	AGTTG	2	10	73855	73864	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019430	TTTGG	2	10	76782	76791	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019430	TTCCA	2	10	76859	76868	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_019430	TTAAG	2	10	76943	76952	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019430	TTTTA	2	10	76990	76999	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019430	CTTAA	2	10	78521	78530	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.