MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8

Total Repeats: 307

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019430	AAT	2	6	1167	1172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019430	TGG	2	6	1256	1261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019430	CAA	2	6	2055	2060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_019430	TAA	2	6	2093	2098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019430	TCG	2	6	5134	5139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019430	CAA	2	6	5250	5255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019430	ATA	2	6	5348	5353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019430	GTG	2	6	5419	5424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019430	ATA	2	6	7495	7500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019430	TGG	2	6	7540	7545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019430	GTA	2	6	8216	8221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019430	AAT	2	6	8234	8239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019430	ATT	2	6	8254	8259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019430	ATA	2	6	8433	8438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019430	ACG	2	6	8515	8520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_019430	GAA	2	6	8604	8609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019430	GTT	2	6	8695	8700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019430	TTG	2	6	8759	8764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019430	ATT	2	6	9685	9690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019430	ATC	2	6	9779	9784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019430	TTC	2	6	9923	9928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019430	AAT	2	6	10243	10248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019430	CGG	2	6	10328	10333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_019430	ATA	2	6	10342	10347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019430	TAT	2	6	10563	10568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019430	ATT	2	6	10740	10745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019430	AAT	2	6	11876	11881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019430	TAA	3	9	11891	11899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019430	ATT	2	6	11918	11923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019430	ATC	2	6	12012	12017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019430	TTC	2	6	12156	12161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_019430	AAT	2	6	12476	12481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019430	CGG	2	6	12561	12566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_019430	TAT	2	6	12796	12801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019430	GAC	2	6	12945	12950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_019430	ACA	2	6	12995	13000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019430	ATA	2	6	13013	13018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019430	CTG	2	6	13041	13046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019430	CAA	2	6	13120	13125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_019430	AAG	2	6	13156	13161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019430	TAT	2	6	13170	13175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019430	TGA	2	6	13297	13302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019430	ATG	2	6	13342	13347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019430	TAT	2	6	13376	13381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019430	GAG	2	6	13396	13401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019430	TGT	2	6	13415	13420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019430	TAA	2	6	13531	13536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019430	GGT	2	6	13572	13577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019430	ATT	2	6	13585	13590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019430	TGA	2	6	13678	13683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019430	TAA	2	6	13703	13708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019430	CTT	2	6	13834	13839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019430	GCA	2	6	13894	13899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019430	AAT	2	6	13977	13982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019430	ATA	2	6	14088	14093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019430	ACA	2	6	14177	14182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019430	TTA	2	6	14196	14201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019430	ATT	2	6	14356	14361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019430	AAT	2	6	14439	14444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019430	TCC	2	6	14515	14520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_019430	ATC	2	6	14594	14599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_019430	CAT	2	6	14607	14612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019430	GAA	2	6	14687	14692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019430	AAT	2	6	15692	15697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019430	TAC	2	6	15821	15826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019430	TAA	2	6	15880	15885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019430	ATT	2	6	15927	15932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019430	CAA	2	6	19487	19492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019430	TCC	2	6	19495	19500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_019430	CCT	2	6	22407	22412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019430	TCA	2	6	22478	22483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019430	ATT	2	6	22588	22593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019430	TCA	2	6	22751	22756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019430	CGA	2	6	22888	22893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019430	ACT	2	6	23668	23673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019430	AAT	2	6	23678	23683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019430	ATT	2	6	23773	23778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019430	CTA	2	6	23823	23828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019430	AGT	2	6	23937	23942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019430	TAA	2	6	24738	24743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019430	ACG	2	6	24904	24909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019430	CAA	2	6	24919	24924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_019430	GAA	2	6	25020	25025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019430	TTA	2	6	25162	25167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019430	TCA	2	6	25279	25284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_019430	TCT	2	6	25285	25290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019430	CTA	2	6	25385	25390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_019430	TCA	2	6	25415	25420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019430	AAT	2	6	27286	27291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019430	TTA	2	6	27311	27316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019430	CTT	2	6	27340	27345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019430	GGA	2	6	27374	27379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019430	TTA	2	6	27411	27416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019430	ATA	2	6	27427	27432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019430	TCA	3	9	27479	27487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_019430	CAA	2	6	27547	27552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_019430	AAT	2	6	27606	27611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019430	CGA	2	6	27620	27625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_019430	CAA	2	6	27648	27653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019430	GTC	2	6	27711	27716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019430	TCT	2	6	27734	27739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019430	AAT	2	6	27822	27827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019430	AAG	2	6	28592	28597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019430	CAT	2	6	29436	29441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019430	TAC	2	6	29472	29477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019430	TAA	2	6	29488	29493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019430	TTC	2	6	29498	29503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019430	ATC	2	6	29519	29524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019430	AAT	2	6	29671	29676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019430	TTA	2	6	29788	29793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019430	ACT	2	6	29812	29817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019430	ATT	2	6	29826	29831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019430	ACT	2	6	30695	30700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019430	CTT	2	6	30813	30818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019430	AAT	2	6	30913	30918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019430	TCT	2	6	30963	30968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019430	ACA	2	6	31057	31062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019430	TTC	2	6	31142	31147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019430	CAT	2	6	31165	31170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019430	CTA	2	6	31337	31342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019430	TCA	2	6	31346	31351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_019430	ATT	2	6	31382	31387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019430	TTC	2	6	31418	31423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019430	ATA	2	6	31490	31495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019430	ATA	2	6	31517	31522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019430	ATT	2	6	31546	31551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019430	ATA	2	6	31574	31579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019430	ACG	2	6	31732	31737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019430	AAT	2	6	31772	31777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019430	TAT	2	6	31800	31805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019430	AGG	2	6	31810	31815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019430	TAA	2	6	32003	32008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019430	AAT	2	6	32186	32191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019430	ATT	2	6	32251	32256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019430	TAA	2	6	33233	33238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019430	TAC	2	6	33258	33263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_019430	TAT	2	6	33267	33272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019430	TCC	2	6	33274	33279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_019430	TGT	2	6	33285	33290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019430	AAG	2	6	33368	33373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019430	TTA	2	6	33381	33386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_019430	TAA	2	6	75485	75490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_019430	CAA	2	6	75512	75517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_019430	TAT	2	6	75654	75659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_019430	GTT	2	6	75722	75727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
285	NC_019430	TTA	2	6	75808	75813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_019430	ATA	2	6	75820	75825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_019430	AAG	2	6	75879	75884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
288	NC_019430	ATC	2	6	75904	75909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_019430	AAT	2	6	75931	75936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.