MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8

Total Repeats: 610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019430	AAT	2	6	1167	1172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019430	CAAA	2	8	1179	1186	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_019430	A	6	6	1239	1244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019430	TGG	2	6	1256	1261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019430	CAA	2	6	2055	2060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_019430	TAA	2	6	2093	2098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019430	TA	3	6	2138	2143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019430	A	6	6	2194	2199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019430	A	6	6	2216	2221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019430	AAAG	2	8	2224	2231	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019430	CT	3	6	5012	5017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_019430	T	6	6	5021	5026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019430	T	6	6	5049	5054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019430	TCG	2	6	5134	5139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_019430	T	8	8	5231	5238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019430	CAA	2	6	5250	5255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_019430	A	7	7	5254	5260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019430	AT	3	6	5293	5298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019430	ATTC	2	8	5317	5324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_019430	AAATG	2	10	5331	5340	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019430	ATA	2	6	5348	5353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019430	T	8	8	5374	5381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019430	A	6	6	5413	5418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019430	GTG	2	6	5419	5424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019430	AAGG	2	8	5444	5451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019430	ATA	2	6	7495	7500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019430	TGG	2	6	7540	7545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019430	CT	3	6	7578	7583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_019430	GTA	2	6	8216	8221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019430	AAT	2	6	8234	8239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019430	T	6	6	8246	8251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019430	ATT	2	6	8254	8259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019430	CT	3	6	8288	8293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_019430	T	6	6	8297	8302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019430	T	6	6	8325	8330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019430	ATA	2	6	8433	8438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019430	ACG	2	6	8515	8520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019430	AAAT	2	8	8521	8528	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019430	GAA	2	6	8604	8609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019430	GTT	2	6	8695	8700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019430	TTG	2	6	8759	8764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019430	ATT	2	6	9685	9690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019430	ATC	2	6	9779	9784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_019430	A	6	6	9848	9853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019430	TTC	2	6	9923	9928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_019430	TGAC	2	8	9979	9986	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_019430	AAT	2	6	10243	10248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019430	CGG	2	6	10328	10333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019430	ATA	2	6	10342	10347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019430	TAAA	2	8	10534	10541	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019430	TAT	2	6	10563	10568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019430	TTAT	2	8	10628	10635	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019430	TTTA	2	8	10665	10672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019430	A	7	7	10676	10682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019430	T	7	7	10718	10724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019430	T	6	6	10731	10736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019430	ATT	2	6	10740	10745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019430	ATTT	2	8	10856	10863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019430	T	6	6	11856	11861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019430	AAT	2	6	11876	11881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019430	TAA	3	9	11891	11899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019430	ATT	2	6	11918	11923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019430	ATC	2	6	12012	12017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019430	A	6	6	12081	12086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019430	TTC	2	6	12156	12161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019430	TGAC	2	8	12212	12219	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_019430	AAT	2	6	12476	12481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019430	CGG	2	6	12561	12566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019430	TAAA	2	8	12767	12774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019430	TAT	2	6	12796	12801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019430	TTAT	2	8	12861	12868	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019430	AT	3	6	12903	12908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019430	T	7	7	12918	12924	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019430	GAC	2	6	12945	12950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019430	ACA	2	6	12995	13000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_019430	ATA	2	6	13013	13018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019430	CTG	2	6	13041	13046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_019430	CAA	2	6	13120	13125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019430	A	6	6	13140	13145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019430	AAG	2	6	13156	13161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019430	TAT	2	6	13170	13175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019430	A	6	6	13207	13212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019430	TGA	2	6	13297	13302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019430	ATG	2	6	13342	13347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019430	TAT	2	6	13376	13381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019430	GAG	2	6	13396	13401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019430	TGT	2	6	13415	13420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019430	T	7	7	13520	13526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019430	TAA	2	6	13531	13536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019430	GGT	2	6	13572	13577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019430	ATT	2	6	13585	13590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019430	T	6	6	13628	13633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019430	TGA	2	6	13678	13683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019430	TAA	2	6	13703	13708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019430	A	6	6	13707	13712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019430	ATGT	2	8	13748	13755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019430	T	6	6	13806	13811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019430	TTTAT	2	10	13819	13828	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019430	CTT	2	6	13834	13839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_019430	T	8	8	13838	13845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019430	A	6	6	13863	13868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019430	GCA	2	6	13894	13899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019430	AT	3	6	13912	13917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019430	AAT	2	6	13977	13982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019430	A	7	7	13987	13993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019430	ATA	2	6	14088	14093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019430	T	7	7	14099	14105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019430	ACA	2	6	14177	14182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019430	TTA	2	6	14196	14201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019430	T	6	6	14245	14250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019430	TCAG	2	8	14268	14275	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019430	ATTT	2	8	14332	14339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019430	ATT	2	6	14356	14361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019430	AAT	2	6	14439	14444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019430	TCC	2	6	14515	14520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_019430	ATC	2	6	14594	14599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019430	T	6	6	14600	14605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019430	CAT	2	6	14607	14612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_019430	A	6	6	14651	14656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019430	GAA	2	6	14687	14692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019430	TTTA	2	8	14729	14736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019430	CTTT	2	8	15667	15674	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_019430	AAT	2	6	15692	15697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019430	TAC	2	6	15821	15826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_019430	TAA	2	6	15880	15885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019430	TA	3	6	15886	15891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019430	ATT	2	6	15927	15932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019430	A	7	7	17372	17378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019430	CAA	2	6	19487	19492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019430	TCC	2	6	19495	19500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_019430	CCT	2	6	22407	22412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_019430	GTAGAA	2	12	22435	22446	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019430	TCA	2	6	22478	22483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019430	CAAA	2	8	22512	22519	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019430	T	6	6	22539	22544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019430	T	8	8	22546	22553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019430	T	7	7	22559	22565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019430	A	6	6	22566	22571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019430	ATT	2	6	22588	22593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019430	TCA	2	6	22751	22756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019430	GTTT	2	8	22763	22770	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019430	TTGT	2	8	22781	22788	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019430	A	7	7	22843	22849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019430	GAAA	2	8	22859	22866	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019430	A	6	6	22882	22887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019430	CGA	2	6	22888	22893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_019430	A	6	6	22898	22903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019430	ACT	2	6	23668	23673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_019430	AAT	2	6	23678	23683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019430	A	7	7	23691	23697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019430	T	7	7	23728	23734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_019430	A	6	6	23788	23793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019430	CTA	2	6	23823	23828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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171	NC_019430	TCA	2	6	25415	25420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_019430	CTT	2	6	27340	27345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_019430	A	6	6	27683	27688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_019430	GTC	2	6	27711	27716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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189	NC_019430	AAT	2	6	27822	27827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_019430	AT	3	6	27899	27904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_019430	TA	3	6	28691	28696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_019430	T	7	7	28733	28739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_019430	T	6	6	29359	29364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_019430	T	6	6	29425	29430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_019430	TATT	2	8	41306	41313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_019430	TAT	2	6	41701	41706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_019430	AT	3	6	42307	42312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_019430	A	7	7	42888	42894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_019430	TA	4	8	42895	42902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_019430	AGA	2	6	42972	42977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_019430	A	6	6	43013	43018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_019430	CTTTT	2	10	43037	43046	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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