MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 plasmid pKLC4

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018699	TAT	2	6	12	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018699	ATC	2	6	49	54	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018699	TTC	2	6	79	84	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018699	AAT	2	6	113	118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018699	CTT	2	6	141	146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018699	ATC	2	6	232	237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018699	ATA	2	6	289	294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018699	CTTT	2	8	387	394	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018699	CTT	2	6	423	428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018699	CT	3	6	585	590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_018699	TCTT	2	8	3671	3678	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018699	T	7	7	6493	6499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018699	TTTATT	2	12	7125	7136	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018699	TGT	2	6	7151	7156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018699	TCA	2	6	7204	7209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018699	TCATT	2	10	7237	7246	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_018699	TTC	2	6	7249	7254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018699	TCA	2	6	7326	7331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018699	AAAT	3	12	7350	7361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018699	AAT	2	6	7671	7676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018699	TCC	2	6	8832	8837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_018699	ATT	2	6	8881	8886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018699	TTA	2	6	8908	8913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018699	AAAATA	2	12	10048	10059	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018699	ATT	2	6	10065	10070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018699	T	6	6	10154	10159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018699	TAA	2	6	10173	10178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018699	AAAT	2	8	10291	10298	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018699	T	7	7	10396	10402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018699	GTT	2	6	10426	10431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018699	CTC	2	6	10847	10852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_018699	T	6	6	10870	10875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018699	CCT	2	6	12330	12335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_018699	TATCA	2	10	12353	12362	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018699	AT	3	6	12380	12385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018699	A	6	6	12417	12422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018699	TAA	2	6	12440	12445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018699	TGA	2	6	12452	12457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018699	CTA	2	6	12473	12478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018699	ATG	2	6	12502	12507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018699	TTTGA	2	10	12514	12523	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018699	TAACAT	2	12	12560	12571	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018699	CCT	2	6	12578	12583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_018699	TAT	2	6	12595	12600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018699	ATA	2	6	12613	12618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018699	ATT	2	6	13194	13199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018699	A	6	6	13242	13247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018699	TA	3	6	13251	13256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018699	A	7	7	13307	13313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018699	TTA	2	6	13351	13356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018699	ATT	2	6	13365	13370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018699	ATA	2	6	13377	13382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018699	AAGAA	2	10	13383	13392	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018699	A	7	7	14407	14413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018699	TCT	2	6	14865	14870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018699	TA	3	6	14892	14897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018699	TTA	2	6	14927	14932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018699	TTAGAA	2	12	14940	14951	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018699	ATA	2	6	15013	15018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018699	ATG	2	6	16281	16286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018699	TCA	2	6	16339	16344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018699	GCA	2	6	18805	18810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018699	TCC	2	6	19278	19283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_018699	TTA	2	6	19325	19330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018699	AAT	2	6	19349	19354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018699	CATTA	2	10	19378	19387	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_018699	A	7	7	19387	19393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018699	ATA	2	6	19401	19406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018699	CTG	2	6	19506	19511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_018699	GAG	2	6	19540	19545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018699	AAG	2	6	19853	19858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018699	TA	3	6	19869	19874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018699	ATAA	2	8	19878	19885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018699	TA	3	6	19991	19996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018699	CTC	2	6	25146	25151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_018699	CTG	2	6	25569	25574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018699	AAG	2	6	25578	25583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018699	A	6	6	25627	25632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018699	TACT	2	8	25640	25647	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018699	TA	4	8	25648	25655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018699	ATA	3	9	25653	25661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018699	GAA	2	6	25719	25724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018699	A	6	6	25726	25731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018699	GTG	2	6	26182	26187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018699	ATTTTA	2	12	26371	26382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018699	CAAG	2	8	26431	26438	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018699	CTTTT	2	10	26444	26453	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_018699	TAT	2	6	26455	26460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018699	ATC	2	6	26461	26466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018699	ATT	2	6	26468	26473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018699	CTTTT	2	10	28121	28130	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_018699	T	6	6	28143	28148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018699	TTTCT	2	10	28153	28162	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_018699	AAT	2	6	28183	28188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018699	TCC	2	6	31259	31264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_018699	TCC	2	6	31671	31676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_018699	CTC	2	6	34660	34665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_018699	T	6	6	35835	35840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018699	CTT	2	6	35856	35861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018699	ATC	2	6	35943	35948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018699	TTG	2	6	35953	35958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018699	CTT	2	6	35970	35975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018699	ATC	2	6	35982	35987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018699	AAT	2	6	36029	36034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018699	TTTG	2	8	36064	36071	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018699	TG	3	6	36088	36093	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018699	AAT	2	6	36127	36132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018699	CAT	2	6	36179	36184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018699	CAC	2	6	36236	36241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_018699	ATC	2	6	36273	36278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018699	T	6	6	36291	36296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018699	CTT	2	6	36335	36340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018699	AGGT	2	8	36358	36365	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018699	T	6	6	36372	36377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018699	CTT	2	6	36416	36421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018699	ATC	2	6	36432	36437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018699	GCTGT	2	10	36454	36463	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_018699	T	8	8	36513	36520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018699	CAG	2	6	36575	36580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.