MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc carnosum JB16 plasmid pKLC2

Total Repeats: 116

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018698	CTT	2	6	29	34	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018698	TTA	4	12	347	358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018698	AAG	2	6	408	413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018698	GAA	2	6	470	475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018698	GAA	2	6	495	500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018698	GTC	2	6	539	544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018698	CTA	2	6	740	745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018698	AGT	2	6	792	797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018698	ACA	2	6	951	956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_018698	TGT	2	6	966	971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018698	ATA	2	6	972	977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018698	TGG	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018698	ATA	2	6	1074	1079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018698	CAA	2	6	1097	1102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018698	GCA	2	6	2681	2686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018698	AGC	2	6	2758	2763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_018698	GGT	2	6	2769	2774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018698	AGT	2	6	2840	2845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018698	TCT	2	6	2922	2927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018698	CAT	2	6	2938	2943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_018698	TCC	2	6	3468	3473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_018698	AAT	2	6	3526	3531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018698	AAT	2	6	3572	3577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018698	CAC	2	6	3589	3594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_018698	TAT	2	6	6182	6187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018698	ATC	2	6	6370	6375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018698	CTT	2	6	6387	6392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018698	ATT	2	6	6526	6531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018698	ATT	2	6	6554	6559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018698	ACA	2	6	8181	8186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018698	AAT	2	6	9191	9196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018698	ATC	2	6	9205	9210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018698	TAC	2	6	9250	9255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018698	GTT	2	6	9791	9796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018698	TAA	2	6	9804	9809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018698	TAG	2	6	9899	9904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018698	ACT	2	6	9909	9914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018698	AAC	2	6	9926	9931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018698	CAA	2	6	10006	10011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_018698	CCA	2	6	10038	10043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018698	TTA	2	6	10115	10120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018698	AGT	2	6	10137	10142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018698	TAT	2	6	10890	10895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018698	CTT	2	6	10947	10952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018698	CTA	2	6	12148	12153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018698	GAG	2	6	12169	12174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018698	AAT	2	6	12192	12197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018698	CCT	2	6	12841	12846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_018698	CCT	2	6	13442	13447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_018698	TAA	2	6	13458	13463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018698	TTA	2	6	13464	13469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018698	TGA	2	6	13837	13842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018698	GGT	2	6	13898	13903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018698	GTT	2	6	14530	14535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018698	ATA	2	6	14551	14556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018698	ATG	2	6	16252	16257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018698	AAT	2	6	16321	16326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018698	TAT	2	6	16374	16379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018698	ACA	2	6	17080	17085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018698	TGA	2	6	17329	17334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018698	CAG	2	6	17457	17462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018698	ATT	2	6	17611	17616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018698	CTG	2	6	17657	17662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018698	AGA	2	6	17682	17687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018698	AAT	2	6	17716	17721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018698	GTG	2	6	18301	18306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018698	ATT	2	6	18398	18403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018698	GTT	2	6	18573	18578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018698	TTG	2	6	18822	18827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018698	AAT	2	6	18884	18889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018698	CGC	2	6	18899	18904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_018698	TCA	2	6	18981	18986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018698	TCC	2	6	19724	19729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_018698	TAG	2	6	22720	22725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018698	ATG	2	6	22777	22782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018698	ATA	2	6	22808	22813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018698	ATC	2	6	22839	22844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_018698	ATT	2	6	22856	22861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018698	CGA	2	6	22979	22984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018698	TTG	2	6	23208	23213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018698	AAT	2	6	23222	23227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018698	TCT	2	6	23230	23235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018698	TCA	2	6	23281	23286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018698	CAA	2	6	23403	23408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018698	TGG	2	6	23488	23493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018698	ATT	2	6	23596	23601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018698	TTA	2	6	23606	23611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018698	ACA	2	6	23641	23646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018698	TAA	2	6	23892	23897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018698	TGA	2	6	23929	23934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018698	ATA	2	6	23947	23952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018698	ATT	2	6	23962	23967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018698	TCA	2	6	24049	24054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018698	ATT	2	6	24055	24060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018698	ATA	2	6	24155	24160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018698	ATT	2	6	24607	24612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018698	ATT	2	6	24653	24658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018698	GTT	2	6	25650	25655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018698	AAT	2	6	27141	27146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018698	AAT	2	6	27182	27187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018698	AAT	2	6	27222	27227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018698	ATT	2	6	27259	27264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018698	CAA	2	6	27266	27271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018698	ATT	2	6	27325	27330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018698	CCG	2	6	27617	27622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_018698	GAG	2	6	27805	27810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018698	GCT	2	6	28259	28264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018698	ATA	2	6	28406	28411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018698	CTT	2	6	29008	29013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018698	TCA	2	6	29017	29022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018698	TAA	2	6	29089	29094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018698	CAA	2	6	29111	29116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018698	TAA	2	6	29158	29163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018698	TAT	2	6	29240	29245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018698	CAG	2	6	29492	29497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_018698	TTA	2	6	29553	29558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.