MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Leptospirillum ferriphilum ML-04 chromosome

Total Repeats: 5066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018649	TCC	2	6	1838099	1838104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_018649	CTCCGT	2	12	1840590	1840601	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
4003	NC_018649	C	6	6	1840666	1840671	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4004	NC_018649	CAA	2	6	1840687	1840692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_018649	CAG	2	6	1840717	1840722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_018649	CCT	2	6	1840844	1840849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_018649	AT	3	6	1840860	1840865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_018649	A	6	6	1840870	1840875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_018649	A	7	7	1840911	1840917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_018649	TCT	2	6	1840948	1840953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_018649	T	6	6	1840953	1840958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_018649	A	6	6	1841079	1841084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_018649	AAC	2	6	1842009	1842014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_018649	AGG	2	6	1842035	1842040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_018649	CCT	2	6	1847431	1847436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_018649	AGG	2	6	1857144	1857149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_018649	CGTC	2	8	1857170	1857177	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_018649	CTC	2	6	1859056	1859061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_018649	TCCG	2	8	1862121	1862128	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_018649	TGA	2	6	1862357	1862362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_018649	A	6	6	1863072	1863077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_018649	GGC	2	6	1863078	1863083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_018649	T	8	8	1863099	1863106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_018649	TCG	2	6	1863161	1863166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_018649	AAAG	2	8	1863169	1863176	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_018649	AAC	2	6	1863194	1863199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_018649	ATC	2	6	1863203	1863208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_018649	CCT	2	6	1863258	1863263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_018649	ATC	2	6	1863682	1863687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_018649	CTC	2	6	1864270	1864275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_018649	CCG	2	6	1864459	1864464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_018649	CCT	2	6	1864827	1864832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_018649	TGT	2	6	1864852	1864857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_018649	AAT	2	6	1864858	1864863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_018649	CTTC	2	8	1864880	1864887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_018649	ATA	2	6	1864927	1864932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_018649	TGT	2	6	1864947	1864952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_018649	TCTCT	2	10	1864975	1864984	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4040	NC_018649	T	6	6	1865004	1865009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_018649	TTTA	2	8	1865065	1865072	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_018649	CATTA	2	10	1865079	1865088	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4043	NC_018649	TCC	2	6	1865905	1865910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4044	NC_018649	GCCT	2	8	1865918	1865925	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4045	NC_018649	GAG	2	6	1865950	1865955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_018649	CTC	2	6	1865964	1865969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4047	NC_018649	AAG	2	6	1866022	1866027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_018649	CT	3	6	1871629	1871634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4049	NC_018649	GAT	2	6	1874884	1874889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_018649	TTC	2	6	1874946	1874951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_018649	CGG	2	6	1874968	1874973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_018649	TCGT	2	8	1874975	1874982	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4053	NC_018649	CCT	2	6	1876902	1876907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_018649	AAG	2	6	1879590	1879595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_018649	TTC	2	6	1879605	1879610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_018649	GAC	2	6	1880597	1880602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_018649	G	6	6	1880617	1880622	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_018649	GAA	2	6	1882984	1882989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_018649	T	6	6	1883083	1883088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_018649	TCT	2	6	1883379	1883384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_018649	GAA	2	6	1883405	1883410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_018649	CCA	2	6	1886054	1886059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_018649	CCTG	2	8	1889108	1889115	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_018649	GATT	2	8	1889124	1889131	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_018649	GGA	2	6	1889164	1889169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_018649	CTT	2	6	1890985	1890990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_018649	A	6	6	1893425	1893430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_018649	TCT	2	6	1893491	1893496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4070	NC_018649	TCCC	2	8	1893561	1893568	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4071	NC_018649	CCT	2	6	1893589	1893594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4072	NC_018649	TCGG	2	8	1894782	1894789	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4073	NC_018649	CAA	2	6	1895406	1895411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_018649	CCT	2	6	1898001	1898006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4075	NC_018649	ATT	2	6	1898031	1898036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_018649	TAC	2	6	1898044	1898049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4078	NC_018649	TCC	2	6	1899125	1899130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_018649	C	6	6	1899129	1899134	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4080	NC_018649	TTCA	2	8	1899171	1899178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4081	NC_018649	A	6	6	1899178	1899183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_018649	GGA	2	6	1899261	1899266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_018649	GGA	2	6	1901115	1901120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_018649	AGG	2	6	1901161	1901166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_018649	GAG	2	6	1901223	1901228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_018649	CCGA	2	8	1902042	1902049	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4087	NC_018649	CAT	2	6	1902061	1902066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_018649	TTG	2	6	1902085	1902090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_018649	CCG	2	6	1902105	1902110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4090	NC_018649	T	6	6	1906287	1906292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_018649	T	6	6	1906307	1906312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_018649	ACC	2	6	1909468	1909473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4093	NC_018649	GA	3	6	1909495	1909500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_018649	TCC	2	6	1909501	1909506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_018649	GGAAGT	2	12	1909507	1909518	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4097	NC_018649	GGA	2	6	1909577	1909582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_018649	CCCT	2	8	1910547	1910554	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4099	NC_018649	TTA	2	6	1910588	1910593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_018649	ATGTCA	2	12	1910607	1910618	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4101	NC_018649	ACA	2	6	1910633	1910638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_018649	GAT	2	6	1910648	1910653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_018649	CTCCCC	2	12	1912291	1912302	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
4104	NC_018649	AGAA	2	8	1912330	1912337	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_018649	CCA	2	6	1912367	1912372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4106	NC_018649	CA	3	6	1912381	1912386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4107	NC_018649	T	6	6	1912410	1912415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_018649	CTT	2	6	1912454	1912459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_018649	C	6	6	1912501	1912506	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4110	NC_018649	AGGA	2	8	1912555	1912562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_018649	TTCA	2	8	1915515	1915522	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4112	NC_018649	GA	3	6	1915528	1915533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_018649	TC	3	6	1915540	1915545	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4114	NC_018649	TTC	2	6	1915552	1915557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_018649	ATGA	2	8	1915609	1915616	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_018649	GGA	2	6	1915646	1915651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_018649	GGAA	2	8	1916372	1916379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_018649	CT	3	6	1916396	1916401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4119	NC_018649	CTTT	2	8	1928485	1928492	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4120	NC_018649	CCT	2	6	1929547	1929552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4121	NC_018649	GGAT	2	8	1929810	1929817	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_018649	TCC	2	6	1929818	1929823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4123	NC_018649	CCT	2	6	1930165	1930170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4124	NC_018649	T	6	6	1930176	1930181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_018649	TC	4	8	1930201	1930208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4126	NC_018649	CA	3	6	1930233	1930238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4127	NC_018649	CT	3	6	1930266	1930271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4128	NC_018649	CAG	2	6	1930275	1930280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_018649	ATT	2	6	1930490	1930495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_018649	TATCTG	2	12	1930499	1930510	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4131	NC_018649	ATG	2	6	1930524	1930529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_018649	TCC	2	6	1930546	1930551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4133	NC_018649	AGCC	2	8	1930586	1930593	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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