MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Leptospirillum ferriphilum ML-04 chromosome

Total Repeats: 5066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_018649	C	6	6	2117510	2117515	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4502	NC_018649	GATG	2	8	2117816	2117823	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_018649	TCC	2	6	2118852	2118857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4504	NC_018649	TGG	3	9	2118957	2118965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_018649	GAT	2	6	2119002	2119007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_018649	TCC	2	6	2120099	2120104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_018649	CACC	2	8	2120132	2120139	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4508	NC_018649	AAGG	2	8	2120164	2120171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_018649	GGGA	2	8	2120172	2120179	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_018649	GAC	2	6	2120231	2120236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_018649	CTGT	2	8	2120275	2120282	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4512	NC_018649	AGA	2	6	2120756	2120761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_018649	TGCG	2	8	2120787	2120794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4514	NC_018649	AG	3	6	2121218	2121223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_018649	GAG	3	9	2121221	2121229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_018649	T	7	7	2122242	2122248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_018649	A	7	7	2122329	2122335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_018649	GAT	2	6	2124055	2124060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_018649	CCGTC	2	10	2125454	2125463	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4520	NC_018649	AGA	2	6	2125510	2125515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_018649	T	7	7	2125568	2125574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_018649	ACA	2	6	2125644	2125649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_018649	TTC	2	6	2125659	2125664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_018649	TCC	2	6	2126685	2126690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4525	NC_018649	GTC	2	6	2126693	2126698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_018649	GAA	2	6	2126714	2126719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_018649	CTT	2	6	2126772	2126777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_018649	CT	3	6	2126784	2126789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_018649	ACG	2	6	2126820	2126825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_018649	TTCC	2	8	2126828	2126835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4531	NC_018649	TCC	2	6	2128312	2128317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_018649	TCC	2	6	2131589	2131594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4533	NC_018649	TCC	2	6	2132767	2132772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_018649	TTC	2	6	2132804	2132809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_018649	AG	3	6	2132829	2132834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_018649	GAT	2	6	2132855	2132860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_018649	TCCCC	2	10	2132895	2132904	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
4538	NC_018649	C	6	6	2132901	2132906	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4539	NC_018649	CCTG	2	8	2134598	2134605	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4540	NC_018649	CT	3	6	2134733	2134738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4541	NC_018649	CGAT	2	8	2134762	2134769	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4542	NC_018649	GAGC	2	8	2134772	2134779	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4543	NC_018649	GAT	2	6	2134830	2134835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_018649	TGTT	2	8	2134937	2134944	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_018649	ATG	2	6	2134963	2134968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_018649	ATGAT	2	10	2135336	2135345	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4547	NC_018649	ACG	2	6	2135375	2135380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_018649	ACA	2	6	2137378	2137383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_018649	AC	3	6	2137416	2137421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4550	NC_018649	CTGA	2	8	2137521	2137528	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4551	NC_018649	CTC	2	6	2141578	2141583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4552	NC_018649	GTC	2	6	2141651	2141656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_018649	A	7	7	2141687	2141693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_018649	GGCG	2	8	2147554	2147561	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4555	NC_018649	AGG	2	6	2147569	2147574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_018649	GAC	2	6	2147639	2147644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_018649	ATTC	2	8	2147708	2147715	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4558	NC_018649	TC	3	6	2147714	2147719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4559	NC_018649	AACA	2	8	2147723	2147730	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4560	NC_018649	T	6	6	2147735	2147740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_018649	GAT	2	6	2150519	2150524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_018649	GA	3	6	2158599	2158604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_018649	GGAA	2	8	2158627	2158634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_018649	GAT	2	6	2158670	2158675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_018649	GGA	2	6	2158678	2158683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_018649	T	6	6	2158769	2158774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_018649	TAT	2	6	2158776	2158781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_018649	GA	3	6	2160486	2160491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_018649	TC	3	6	2160530	2160535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4570	NC_018649	ATG	2	6	2160540	2160545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_018649	C	6	6	2160570	2160575	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4572	NC_018649	TGA	2	6	2160626	2160631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_018649	TCA	2	6	2162944	2162949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_018649	TC	3	6	2164881	2164886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_018649	GCC	2	6	2165474	2165479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4576	NC_018649	TCC	2	6	2166218	2166223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4577	NC_018649	G	7	7	2166236	2166242	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_018649	CGG	2	6	2166286	2166291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_018649	TGAT	2	8	2166326	2166333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_018649	ATA	2	6	2166840	2166845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_018649	ACA	2	6	2166853	2166858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_018649	T	6	6	2166870	2166875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_018649	CTT	2	6	2169873	2169878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_018649	CTT	2	6	2169884	2169889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_018649	GA	3	6	2169896	2169901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_018649	TCT	2	6	2170038	2170043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_018649	CCGG	2	8	2170090	2170097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4588	NC_018649	AGG	2	6	2170103	2170108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_018649	GCC	2	6	2175699	2175704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4590	NC_018649	AGG	2	6	2175732	2175737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_018649	GCC	2	6	2175789	2175794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4592	NC_018649	CAT	2	6	2175797	2175802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_018649	AAG	2	6	2175815	2175820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_018649	GACA	2	8	2175839	2175846	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4595	NC_018649	TCC	2	6	2179235	2179240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4596	NC_018649	CTT	2	6	2179301	2179306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_018649	AGA	2	6	2179321	2179326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_018649	A	6	6	2179355	2179360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_018649	TTC	2	6	2179381	2179386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_018649	TCT	2	6	2181728	2181733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_018649	TTTGGG	2	12	2181751	2181762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_018649	CCT	2	6	2182604	2182609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4603	NC_018649	CCT	2	6	2183484	2183489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4604	NC_018649	GCT	2	6	2186679	2186684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_018649	TC	3	6	2187055	2187060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4606	NC_018649	GA	3	6	2187141	2187146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_018649	TCC	2	6	2188037	2188042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4608	NC_018649	CTC	2	6	2192366	2192371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4609	NC_018649	ATT	2	6	2192429	2192434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_018649	T	6	6	2192433	2192438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_018649	GGGT	2	8	2195652	2195659	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_018649	T	6	6	2196911	2196916	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_018649	ATC	2	6	2196924	2196929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_018649	CTCGC	2	10	2196950	2196959	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4615	NC_018649	GAA	2	6	2196967	2196972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_018649	T	6	6	2196984	2196989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_018649	CTT	2	6	2196992	2196997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_018649	G	7	7	2196999	2197005	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_018649	GGC	2	6	2197029	2197034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_018649	AGAAAA	2	12	2197045	2197056	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_018649	A	7	7	2197081	2197087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_018649	C	8	8	2198460	2198467	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4623	NC_018649	CTTC	2	8	2204340	2204347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4624	NC_018649	ACA	2	6	2204353	2204358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_018649	TCC	2	6	2204676	2204681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4626	NC_018649	CCT	2	6	2204828	2204833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4627	NC_018649	TTC	2	6	2204865	2204870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_018649	ATG	2	6	2204903	2204908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_018649	CAT	2	6	2204910	2204915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_018649	CGGA	2	8	2204921	2204928	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4631	NC_018649	AGA	2	6	2210226	2210231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_018649	TCAA	2	8	2213243	2213250	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4633	NC_018649	CTGA	2	8	2213253	2213260	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4634	NC_018649	ATT	2	6	2213834	2213839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4635	NC_018649	TCCATT	2	12	2218151	2218162	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4636	NC_018649	TCG	2	6	2218220	2218225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4639	NC_018649	TCC	2	6	2218346	2218351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4646	NC_018649	TCTG	2	8	2218532	2218539	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4665	NC_018649	ATGAC	2	10	2221732	2221741	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4669	NC_018649	GAAA	2	8	2221809	2221816	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4674	NC_018649	GAAT	2	8	2223479	2223486	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4750	NC_018649	CTT	2	6	2285047	2285052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4753	NC_018649	CAA	2	6	2285112	2285117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4756	NC_018649	CCG	2	6	2285291	2285296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4759	NC_018649	GGCC	2	8	2285393	2285400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4760	NC_018649	AAGA	2	8	2285413	2285420	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4761	NC_018649	CCT	2	6	2285705	2285710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4762	NC_018649	CTAC	2	8	2285741	2285748	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4763	NC_018649	ACTTG	2	10	2285759	2285768	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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