MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei W56

Total Repeats: 5422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018641	TCA	2	6	17	22	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018641	GGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018641	GTT	3	9	1504	1512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018641	AGG	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018641	CAA	2	6	2753	2758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018641	TGA	2	6	2789	2794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018641	TCC	2	6	3027	3032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_018641	ATA	3	9	3077	3085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018641	ATA	2	6	3112	3117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018641	AGT	2	6	3498	3503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018641	GAC	2	6	3532	3537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018641	TGA	2	6	4959	4964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018641	AGG	2	6	5033	5038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018641	GAG	2	6	7051	7056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018641	TAA	2	6	9693	9698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018641	AGA	2	6	10604	10609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018641	TGC	2	6	10644	10649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018641	AGG	2	6	10668	10673	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018641	CGC	2	6	11124	11129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_018641	AGG	2	6	11226	11231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018641	GGA	2	6	12239	12244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018641	ATT	2	6	12541	12546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018641	AGA	2	6	12611	12616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018641	GAA	2	6	12680	12685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018641	TAG	2	6	12744	12749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018641	TAA	2	6	12825	12830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018641	TGT	2	6	12840	12845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018641	GGA	2	6	12873	12878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018641	ATA	2	6	14605	14610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018641	CAA	2	6	14718	14723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018641	GGT	2	6	14750	14755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018641	AAT	2	6	15065	15070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018641	AGC	2	6	15236	15241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018641	ATT	2	6	15343	15348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018641	GCG	3	9	17860	17868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018641	AAG	2	6	17871	17876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018641	GAA	2	6	18855	18860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018641	CAT	2	6	18944	18949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018641	TTG	2	6	18950	18955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018641	TAA	2	6	19016	19021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018641	AAC	2	6	19078	19083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018641	ATT	2	6	19137	19142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018641	CAA	2	6	20122	20127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018641	AGC	2	6	20202	20207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018641	TTC	2	6	21234	21239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018641	CCT	2	6	21682	21687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_018641	GAT	2	6	21914	21919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018641	CAG	3	9	21920	21928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018641	CCT	2	6	22037	22042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_018641	CTT	2	6	22094	22099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018641	TGA	2	6	23553	23558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018641	GAC	2	6	23585	23590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018641	CCT	2	6	26905	26910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_018641	ATG	2	6	27159	27164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018641	GGA	2	6	27168	27173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018641	ATA	2	6	27755	27760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018641	AGA	2	6	28985	28990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018641	GTT	2	6	29050	29055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018641	CAA	2	6	29873	29878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018641	CAT	2	6	29900	29905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018641	GTC	2	6	29969	29974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018641	GCC	2	6	30017	30022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_018641	TGT	2	6	30050	30055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018641	CTT	2	6	30083	30088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018641	TTG	2	6	30175	30180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018641	TAA	2	6	30197	30202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018641	AAC	2	6	30237	30242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018641	CCT	2	6	30255	30260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_018641	TGG	2	6	32764	32769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018641	GGC	2	6	32801	32806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018641	TTC	2	6	32820	32825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018641	CTT	2	6	32953	32958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_018641	AGT	2	6	33027	33032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018641	ATG	2	6	33048	33053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018641	CAA	2	6	33098	33103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018641	TAC	2	6	33118	33123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018641	GCC	2	6	33145	33150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_018641	CGG	2	6	33251	33256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_018641	CTC	2	6	33378	33383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_018641	GAA	2	6	33542	33547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018641	AAT	2	6	34166	34171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018641	AGC	2	6	35214	35219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018641	TCA	2	6	37552	37557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018641	CAT	2	6	38658	38663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018641	AAG	2	6	40190	40195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018641	TCA	2	6	40238	40243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_018641	AGC	2	6	41016	41021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018641	TAG	2	6	41365	41370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018641	ACA	2	6	41385	41390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018641	TAA	2	6	41394	41399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018641	TAA	2	6	41417	41422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018641	TGG	2	6	41496	41501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018641	ATT	2	6	41507	41512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018641	AAG	2	6	41724	41729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018641	CTT	2	6	41761	41766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018641	TGA	2	6	41812	41817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018641	CAA	2	6	42675	42680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_018641	GGA	2	6	43417	43422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018641	AGA	2	6	43854	43859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018641	GGT	2	6	43869	43874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018641	TGC	3	9	43933	43941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018641	TCT	2	6	43947	43952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018641	ATG	2	6	43970	43975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018641	TAT	2	6	45734	45739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018641	CAA	2	6	45762	45767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018641	AAT	2	6	46258	46263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018641	ACC	2	6	46326	46331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_018641	AAC	2	6	46350	46355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018641	CGT	2	6	46413	46418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018641	GAT	2	6	46439	46444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018641	TGA	2	6	46541	46546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018641	TTA	2	6	47571	47576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018641	CTG	2	6	48539	48544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018641	TAT	2	6	50091	50096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018641	AAT	2	6	50102	50107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018641	AGC	2	6	50147	50152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018641	AGA	2	6	51328	51333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018641	TCA	2	6	51592	51597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018641	AGC	2	6	51715	51720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018641	GCT	2	6	51732	51737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018641	GCT	2	6	52260	52265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018641	ATT	2	6	52266	52271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018641	GGA	2	6	53252	53257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018641	ATT	2	6	55027	55032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018641	CAT	2	6	55155	55160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018641	CTG	2	6	56633	56638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018641	GCT	2	6	56710	56715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018641	TAA	2	6	56716	56721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018641	TTA	2	6	57098	57103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018641	TGT	2	6	61260	61265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018641	AAG	2	6	61286	61291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018641	CCA	2	6	61331	61336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_018641	ACA	2	6	61381	61386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018641	TTG	2	6	61773	61778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018641	GAC	2	6	61837	61842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018641	GCC	2	6	63639	63644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_018641	ATG	2	6	63712	63717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018641	AGC	2	6	63783	63788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018641	AGC	2	6	63847	63852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018641	CAA	2	6	63918	63923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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