MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei W56

Total Repeats: 9348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018641	A	6	6	1287782	1287787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_018641	TGT	2	6	1287805	1287810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_018641	TGAC	2	8	1287820	1287827	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4004	NC_018641	CTTT	2	8	1287912	1287919	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4005	NC_018641	AT	3	6	1287992	1287997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_018641	TTG	2	6	1288044	1288049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_018641	CTT	2	6	1289358	1289363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_018641	TAT	2	6	1289385	1289390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_018641	AGC	2	6	1289423	1289428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_018641	GTG	2	6	1289437	1289442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_018641	ATG	2	6	1289446	1289451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_018641	A	6	6	1290015	1290020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_018641	A	6	6	1291718	1291723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_018641	A	7	7	1292877	1292883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_018641	AGCT	2	8	1292902	1292909	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4016	NC_018641	CAGT	2	8	1292913	1292920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4017	NC_018641	AGC	2	6	1294214	1294219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_018641	ATT	2	6	1294443	1294448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_018641	GTG	2	6	1295470	1295475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_018641	ATC	2	6	1295985	1295990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_018641	TGAC	2	8	1296006	1296013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4022	NC_018641	AAT	2	6	1296091	1296096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_018641	CGC	2	6	1296148	1296153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_018641	TTTTG	2	10	1296259	1296268	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_018641	GAT	2	6	1296470	1296475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_018641	TAC	2	6	1296501	1296506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_018641	T	7	7	1296514	1296520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_018641	A	7	7	1296699	1296705	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_018641	CTT	2	6	1296813	1296818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_018641	TA	3	6	1296842	1296847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_018641	ATG	2	6	1296999	1297004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_018641	TAAT	2	8	1297083	1297090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_018641	CCT	2	6	1297623	1297628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4034	NC_018641	T	6	6	1297628	1297633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_018641	ATT	2	6	1297649	1297654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_018641	ATTG	2	8	1297695	1297702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_018641	ATC	2	6	1297808	1297813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_018641	T	6	6	1298005	1298010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_018641	TCT	2	6	1298049	1298054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_018641	CAATT	2	10	1298065	1298074	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4041	NC_018641	AGT	2	6	1298127	1298132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_018641	TGC	2	6	1299382	1299387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_018641	AAT	2	6	1299401	1299406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_018641	GAAAAG	2	12	1299499	1299510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_018641	CTT	2	6	1301706	1301711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_018641	A	7	7	1301760	1301766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_018641	T	6	6	1301789	1301794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_018641	GTT	2	6	1301807	1301812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_018641	GTA	2	6	1301823	1301828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_018641	TTGT	2	8	1301925	1301932	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_018641	T	7	7	1301943	1301949	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_018641	A	6	6	1302487	1302492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_018641	GT	3	6	1302544	1302549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_018641	ATG	3	9	1302591	1302599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_018641	AAT	2	6	1303404	1303409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_018641	T	6	6	1303458	1303463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_018641	AAC	2	6	1303477	1303482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_018641	AGG	2	6	1303532	1303537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_018641	AGG	2	6	1304239	1304244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_018641	A	6	6	1304264	1304269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_018641	AAT	2	6	1307932	1307937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_018641	CGC	2	6	1307979	1307984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_018641	AGC	2	6	1308050	1308055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_018641	AAC	2	6	1308074	1308079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_018641	TGT	2	6	1308103	1308108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_018641	CTAT	2	8	1308179	1308186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4067	NC_018641	GAC	2	6	1308197	1308202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_018641	GTC	2	6	1308226	1308231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_018641	TTTG	2	8	1308233	1308240	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_018641	A	6	6	1309085	1309090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_018641	GAA	2	6	1309121	1309126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_018641	TTG	2	6	1309193	1309198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_018641	AAG	2	6	1309273	1309278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_018641	AG	3	6	1310181	1310186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_018641	A	7	7	1311237	1311243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_018641	GTA	2	6	1311259	1311264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_018641	CTG	2	6	1311311	1311316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_018641	ACA	2	6	1311382	1311387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_018641	GCG	2	6	1311499	1311504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_018641	TTCC	2	8	1311536	1311543	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4081	NC_018641	TTC	2	6	1312927	1312932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_018641	GCAA	2	8	1312967	1312974	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4083	NC_018641	CGG	2	6	1312977	1312982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_018641	GTG	2	6	1312985	1312990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_018641	A	6	6	1313001	1313006	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_018641	GGC	2	6	1313042	1313047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_018641	AGG	2	6	1313728	1313733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_018641	CTA	2	6	1315689	1315694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_018641	CGG	2	6	1316743	1316748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_018641	CGT	2	6	1316802	1316807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_018641	GAT	2	6	1316825	1316830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_018641	GAT	2	6	1316900	1316905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_018641	T	7	7	1316947	1316953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_018641	TGG	2	6	1316980	1316985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_018641	AGG	2	6	1316996	1317001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_018641	CAAA	2	8	1318252	1318259	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4097	NC_018641	CTT	2	6	1318285	1318290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_018641	GAC	2	6	1318342	1318347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_018641	TA	3	6	1318357	1318362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_018641	GAA	2	6	1318377	1318382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_018641	AGG	2	6	1318390	1318395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_018641	TTC	2	6	1319072	1319077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_018641	GGT	2	6	1319105	1319110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_018641	GCC	2	6	1319116	1319121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_018641	TGA	2	6	1319139	1319144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_018641	GGC	2	6	1319157	1319162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_018641	AAC	2	6	1319245	1319250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_018641	CAT	3	9	1319276	1319284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_018641	TGA	2	6	1319287	1319292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_018641	AGG	2	6	1319320	1319325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_018641	AGG	2	6	1320052	1320057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_018641	TCA	2	6	1320286	1320291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_018641	AAG	2	6	1320295	1320300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_018641	AGTA	2	8	1321337	1321344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_018641	AC	3	6	1323856	1323861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_018641	TCA	2	6	1323873	1323878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_018641	TCA	2	6	1323942	1323947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_018641	TCA	2	6	1323996	1324001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_018641	CGCT	2	8	1324007	1324014	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4120	NC_018641	ACA	2	6	1324125	1324130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_018641	GGA	2	6	1324131	1324136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_018641	TC	3	6	1326069	1326074	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_018641	TGC	2	6	1326106	1326111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_018641	TGA	2	6	1326113	1326118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_018641	GGT	2	6	1326170	1326175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_018641	TAGT	2	8	1326623	1326630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_018641	GAG	2	6	1326639	1326644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_018641	AT	3	6	1326647	1326652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_018641	GAGC	2	8	1327647	1327654	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4130	NC_018641	AAC	2	6	1328356	1328361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_018641	GC	3	6	1328369	1328374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4132	NC_018641	ATC	2	6	1328431	1328436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_018641	GAC	2	6	1328565	1328570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4135	NC_018641	A	6	6	1331478	1331483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_018641	ATTG	2	8	1331514	1331521	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_018641	TGAG	2	8	1331531	1331538	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_018641	TGA	2	6	1331567	1331572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4140	NC_018641	T	7	7	1331781	1331787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_018641	TCT	2	6	1331791	1331796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4143	NC_018641	AGG	2	6	1331965	1331970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4145	NC_018641	TA	3	6	1332828	1332833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4146	NC_018641	AG	3	6	1332882	1332887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4159	NC_018641	CA	3	6	1333688	1333693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4162	NC_018641	GAA	2	6	1341324	1341329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4163	NC_018641	T	7	7	1341386	1341392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4164	NC_018641	CAA	2	6	1341447	1341452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4241	NC_018641	ATA	2	6	1365552	1365557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4242	NC_018641	AAG	2	6	1365572	1365577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4244	NC_018641	GGT	2	6	1367006	1367011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4246	NC_018641	GCTT	2	8	1367382	1367389	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4248	NC_018641	TGAG	2	8	1368181	1368188	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4250	NC_018641	CAA	2	6	1368923	1368928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4251	NC_018641	GCCT	2	8	1368952	1368959	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4252	NC_018641	ATT	3	9	1368970	1368978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_018641	ATG	2	6	1369012	1369017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_018641	GTT	2	6	1369044	1369049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_018641	T	6	6	1369048	1369053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4256	NC_018641	CTT	2	6	1369082	1369087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4257	NC_018641	T	7	7	1369092	1369098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_018641	GGA	2	6	1369145	1369150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_018641	ACAGA	2	10	1370558	1370567	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4261	NC_018641	TGT	2	6	1370674	1370679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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