MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei W56

Total Repeats: 9348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018641	CCGG	2	8	286296	286303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_018641	ATA	2	6	286393	286398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_018641	CGG	2	6	286422	286427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_018641	TTTA	2	8	287771	287778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_018641	AAG	2	6	287779	287784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_018641	TTGC	2	8	287801	287808	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_018641	T	6	6	287819	287824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_018641	TGCT	2	8	287835	287842	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_018641	GTG	2	6	287843	287848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_018641	ATG	2	6	287853	287858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_018641	GCT	2	6	288562	288567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_018641	CAA	2	6	288619	288624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_018641	AAT	2	6	288681	288686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_018641	TTGAA	2	10	288730	288739	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_018641	TTG	2	6	288763	288768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_018641	TTG	2	6	288785	288790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_018641	AGG	2	6	288808	288813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_018641	GAA	2	6	288824	288829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_018641	TTG	2	6	288859	288864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_018641	CTG	2	6	288867	288872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_018641	AAT	2	6	290540	290545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_018641	TGA	2	6	290634	290639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_018641	GAT	2	6	290657	290662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_018641	AAT	2	6	290705	290710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_018641	ACG	2	6	290811	290816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_018641	AGC	2	6	290821	290826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_018641	ATGA	2	8	290866	290873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_018641	GAT	2	6	290874	290879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_018641	TCA	2	6	290887	290892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_018641	ATC	2	6	291940	291945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_018641	T	6	6	292010	292015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_018641	A	6	6	292046	292051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_018641	ATT	2	6	292087	292092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_018641	T	7	7	292153	292159	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_018641	TGT	2	6	292176	292181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_018641	TAAAAA	2	12	292205	292216	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_018641	TGGT	2	8	292265	292272	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_018641	ATA	2	6	293009	293014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_018641	AGG	2	6	293061	293066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_018641	GAA	2	6	293069	293074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_018641	AGC	2	6	294276	294281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_018641	AGG	2	6	294300	294305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_018641	GT	3	6	295517	295522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_018641	GCA	2	6	295537	295542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_018641	ATGA	2	8	295552	295559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_018641	AGG	2	6	295561	295566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_018641	AAT	2	6	300136	300141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_018641	CTTA	2	8	300144	300151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_018641	TTGA	2	8	300190	300197	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_018641	AATC	2	8	300249	300256	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_018641	TCG	2	6	301575	301580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_018641	T	7	7	301595	301601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_018641	AGA	2	6	301602	301607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_018641	TAT	2	6	303449	303454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_018641	AAT	2	6	303460	303465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_018641	AT	3	6	303468	303473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_018641	CCT	2	6	305482	305487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_018641	GC	3	6	305508	305513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_018641	ACCAG	2	10	305538	305547	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1060	NC_018641	GC	3	6	305650	305655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_018641	CTGCGA	2	12	307867	307878	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_018641	AGCC	2	8	307902	307909	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_018641	TGT	2	6	310935	310940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_018641	AAC	2	6	311031	311036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_018641	TAA	2	6	311095	311100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_018641	AAT	2	6	311105	311110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_018641	GTT	2	6	311120	311125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_018641	TGT	2	6	311150	311155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_018641	GCA	2	6	311167	311172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_018641	CAAA	2	8	311194	311201	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_018641	A	6	6	311199	311204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_018641	GAT	2	6	311215	311220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_018641	TGAT	2	8	311247	311254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_018641	ATTGC	2	10	312559	312568	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1075	NC_018641	AAC	2	6	314288	314293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_018641	CAT	2	6	314313	314318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_018641	T	6	6	314356	314361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_018641	CG	3	6	314373	314378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1079	NC_018641	GCG	2	6	314475	314480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_018641	CCT	2	6	315173	315178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_018641	ATG	2	6	315188	315193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_018641	TAA	2	6	315196	315201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_018641	ATA	2	6	315227	315232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_018641	AT	3	6	315261	315266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_018641	T	6	6	315313	315318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_018641	GGT	2	6	315402	315407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_018641	AG	3	6	315416	315421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_018641	GTG	3	9	315422	315430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_018641	CGG	2	6	315757	315762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_018641	T	6	6	315800	315805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_018641	TAG	2	6	316000	316005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_018641	GAT	2	6	316273	316278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_018641	GAA	2	6	316323	316328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_018641	TTGT	2	8	316351	316358	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_018641	CCA	2	6	316372	316377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_018641	T	6	6	316396	316401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_018641	GTCT	2	8	316454	316461	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_018641	A	6	6	319065	319070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_018641	T	6	6	322663	322668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_018641	T	6	6	322680	322685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_018641	TGT	3	9	322692	322700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_018641	GTTGT	2	10	322755	322764	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_018641	AGG	2	6	322808	322813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_018641	ATGG	2	8	322852	322859	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_018641	GGC	2	6	322884	322889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_018641	TCA	2	6	322922	322927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_018641	ATG	2	6	324473	324478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_018641	CAC	2	6	324485	324490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_018641	TCA	2	6	324509	324514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_018641	AAT	2	6	324564	324569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_018641	CGA	2	6	324581	324586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_018641	GAC	2	6	324600	324605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_018641	A	6	6	324610	324615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_018641	TTC	2	6	324648	324653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_018641	AAT	2	6	324692	324697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_018641	ACC	2	6	325023	325028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_018641	GGT	2	6	325046	325051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_018641	T	7	7	325055	325061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_018641	A	6	6	325065	325070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_018641	ACA	2	6	325131	325136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_018641	TC	3	6	325165	325170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_018641	AC	3	6	325208	325213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_018641	TGA	2	6	325225	325230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_018641	AGA	2	6	325403	325408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_018641	A	7	7	326421	326427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_018641	AGG	2	6	326450	326455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_018641	AG	3	6	326876	326881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_018641	AGTTA	2	10	330549	330558	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_018641	CGAG	2	8	330619	330626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_018641	GGA	2	6	330639	330644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_018641	ACCT	2	8	331610	331617	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_018641	GAA	2	6	334054	334059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_018641	TGG	2	6	334061	334066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_018641	GCAA	2	8	334118	334125	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_018641	ATAA	2	8	334126	334133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_018641	GTGA	2	8	334156	334163	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1267	NC_018641	ATA	2	6	366266	366271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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