MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei W56

Total Repeats: 9348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018641	TTG	2	6	120933	120938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_018641	ATG	2	6	120959	120964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_018641	AAC	2	6	121039	121044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_018641	TA	3	6	122232	122237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_018641	AAT	2	6	122255	122260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_018641	TTG	2	6	124208	124213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_018641	CAA	2	6	124229	124234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_018641	CGT	2	6	124327	124332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_018641	AAC	2	6	124353	124358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_018641	AAT	2	6	124361	124366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_018641	AC	3	6	124372	124377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
512	NC_018641	TA	3	6	124378	124383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_018641	CTG	2	6	124438	124443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_018641	A	7	7	126727	126733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_018641	T	6	6	126751	126756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018641	TCAAA	2	10	126853	126862	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
517	NC_018641	GAA	2	6	128348	128353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_018641	TGA	2	6	128471	128476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_018641	ATTA	2	8	128482	128489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_018641	ATA	2	6	128491	128496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_018641	GTT	2	6	128509	128514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_018641	A	6	6	128516	128521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018641	TTAG	2	8	128532	128539	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
524	NC_018641	TGAC	2	8	129958	129965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
525	NC_018641	TGT	2	6	129985	129990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_018641	ATT	2	6	130852	130857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_018641	CAC	2	6	131024	131029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_018641	TTA	2	6	132532	132537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_018641	GCT	2	6	132541	132546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_018641	AT	3	6	132578	132583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_018641	ATT	2	6	132586	132591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018641	TAA	2	6	132598	132603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_018641	GCT	2	6	132618	132623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_018641	T	6	6	132643	132648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_018641	TTA	2	6	134101	134106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018641	CTG	2	6	134111	134116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_018641	A	6	6	134223	134228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_018641	TGTT	2	8	134235	134242	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
539	NC_018641	CAG	2	6	134246	134251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_018641	CAGA	2	8	134319	134326	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
541	NC_018641	GCT	2	6	134426	134431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_018641	GGC	2	6	134451	134456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_018641	CAA	2	6	135387	135392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_018641	A	6	6	135391	135396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_018641	AAAT	2	8	135428	135435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018641	CAT	2	6	136603	136608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_018641	ATTA	2	8	137775	137782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_018641	TCG	2	6	137829	137834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_018641	AGA	2	6	137891	137896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018641	TTAA	2	8	137915	137922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_018641	AT	3	6	138351	138356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_018641	T	6	6	141237	141242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_018641	GATT	2	8	141251	141258	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
554	NC_018641	AT	3	6	142240	142245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_018641	ACA	2	6	142250	142255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_018641	AT	3	6	142281	142286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_018641	GGT	2	6	142314	142319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_018641	CTT	2	6	144177	144182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_018641	TGT	2	6	144195	144200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_018641	TCA	2	6	144205	144210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_018641	A	7	7	144274	144280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_018641	AAG	2	6	145844	145849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018641	GGC	2	6	145891	145896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_018641	CTT	2	6	145909	145914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_018641	GGC	2	6	146036	146041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_018641	T	6	6	146094	146099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_018641	GCC	2	6	146112	146117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_018641	T	6	6	146145	146150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_018641	GTG	2	6	146214	146219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_018641	GTT	2	6	146229	146234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_018641	GGC	2	6	146252	146257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_018641	TGGGTA	2	12	146258	146269	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_018641	CGA	2	6	146278	146283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_018641	GAT	2	6	147305	147310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018641	TATTTT	2	12	147352	147363	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_018641	TTG	2	6	147369	147374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_018641	GCCT	2	8	147423	147430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
578	NC_018641	TAT	2	6	147431	147436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_018641	GTCAT	2	10	147446	147455	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
580	NC_018641	TTAC	2	8	148461	148468	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
581	NC_018641	AGTA	2	8	148473	148480	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_018641	AAC	2	6	149001	149006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_018641	T	6	6	149053	149058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018641	GTGATG	2	12	149777	149788	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018641	ATT	2	6	149860	149865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_018641	A	6	6	149866	149871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_018641	TG	3	6	149966	149971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_018641	T	6	6	149989	149994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_018641	T	6	6	149996	150001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_018641	A	6	6	150019	150024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_018641	TA	3	6	150046	150051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_018641	AGC	2	6	150088	150093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_018641	T	7	7	150094	150100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_018641	AGC	2	6	153354	153359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_018641	TCA	2	6	153392	153397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_018641	ACA	2	6	153401	153406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_018641	A	6	6	153446	153451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_018641	ACAT	2	8	154256	154263	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
599	NC_018641	GAATAA	2	12	155420	155431	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_018641	GAAT	2	8	155495	155502	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
601	NC_018641	AAG	2	6	155616	155621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_018641	GAGGC	2	10	157454	157463	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
603	NC_018641	CAC	2	6	158455	158460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_018641	A	7	7	158470	158476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_018641	T	6	6	158493	158498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_018641	TCC	2	6	158864	158869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_018641	CAG	2	6	158910	158915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_018641	TTA	2	6	158926	158931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_018641	ATG	2	6	158943	158948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018641	AAT	2	6	158956	158961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_018641	AGG	2	6	160425	160430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_018641	A	6	6	160431	160436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_018641	A	6	6	161650	161655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_018641	TC	3	6	161659	161664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
615	NC_018641	GA	3	6	161673	161678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_018641	CCT	2	6	162563	162568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_018641	CTG	2	6	162699	162704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_018641	AGA	2	6	162729	162734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_018641	GTT	2	6	163516	163521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_018641	A	7	7	163854	163860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_018641	T	7	7	163881	163887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_018641	GAT	2	6	167299	167304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_018641	GAA	2	6	167307	167312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_018641	A	6	6	167338	167343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_018641	GCA	2	6	169002	169007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_018641	A	7	7	169009	169015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_018641	TAAC	2	8	169023	169030	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
628	NC_018641	GCAG	2	8	169058	169065	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
629	NC_018641	AAT	2	6	169103	169108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_018641	CAG	2	6	169111	169116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_018641	TGACAA	2	12	169190	169201	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
632	NC_018641	CCT	2	6	169375	169380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
633	NC_018641	TCA	2	6	169405	169410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_018641	AGC	2	6	169455	169460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_018641	T	6	6	169522	169527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_018641	T	6	6	169573	169578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_018641	T	7	7	172050	172056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_018641	GCG	2	6	172084	172089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_018641	TGA	2	6	172132	172137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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962	NC_018641	A	6	6	278590	278595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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