MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei W56

Total Repeats: 9348

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_018641	CAA	2	6	1996850	1996855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_018641	A	7	7	1996854	1996860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_018641	TCC	2	6	1999612	1999617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_018641	TGAT	2	8	1999618	1999625	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_018641	ATT	2	6	1999708	1999713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_018641	AT	3	6	1999717	1999722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_018641	CAT	2	6	1999779	1999784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_018641	A	7	7	1999850	1999856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_018641	TCG	2	6	2001169	2001174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_018641	T	7	7	2001179	2001185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_018641	T	6	6	2001188	2001193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_018641	TTTTC	2	10	2001221	2001230	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6013	NC_018641	ATG	2	6	2001277	2001282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_018641	AAT	2	6	2001318	2001323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_018641	GTT	2	6	2001336	2001341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_018641	T	6	6	2001414	2001419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_018641	AGG	2	6	2001427	2001432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_018641	AC	3	6	2001453	2001458	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6019	NC_018641	TGA	2	6	2001470	2001475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_018641	GT	3	6	2001570	2001575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_018641	TCA	2	6	2001580	2001585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_018641	CCA	2	6	2001660	2001665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6023	NC_018641	CGA	2	6	2001675	2001680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_018641	TGC	2	6	2002752	2002757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_018641	GC	3	6	2002760	2002765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6026	NC_018641	GAG	2	6	2002875	2002880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_018641	ATG	2	6	2002961	2002966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_018641	CATGGT	2	12	2002970	2002981	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6029	NC_018641	AGG	2	6	2003029	2003034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_018641	TCA	2	6	2003843	2003848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_018641	CCT	2	6	2003859	2003864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_018641	TGG	2	6	2003880	2003885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_018641	T	7	7	2003895	2003901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_018641	CTG	2	6	2003914	2003919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_018641	CCA	2	6	2003925	2003930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_018641	ACA	2	6	2003936	2003941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_018641	TTA	2	6	2003962	2003967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_018641	TTC	2	6	2003977	2003982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6039	NC_018641	GT	3	6	2004008	2004013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_018641	T	7	7	2004724	2004730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_018641	TTG	2	6	2004773	2004778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_018641	CGAA	2	8	2005696	2005703	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6043	NC_018641	AGG	2	6	2005773	2005778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_018641	AAC	2	6	2006604	2006609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_018641	A	6	6	2006690	2006695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_018641	GTC	2	6	2007359	2007364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_018641	T	6	6	2007374	2007379	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_018641	TTA	2	6	2007381	2007386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_018641	TGC	2	6	2007401	2007406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_018641	TAA	2	6	2007448	2007453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_018641	GGT	2	6	2007497	2007502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_018641	ATC	2	6	2007550	2007555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_018641	TAT	2	6	2009491	2009496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_018641	A	6	6	2009500	2009505	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_018641	AAC	2	6	2009550	2009555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_018641	CA	3	6	2009577	2009582	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_018641	ACG	2	6	2009583	2009588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_018641	GGCT	2	8	2015624	2015631	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6059	NC_018641	CTC	2	6	2016771	2016776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_018641	CCT	2	6	2017516	2017521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6061	NC_018641	TTG	2	6	2017534	2017539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_018641	TA	3	6	2017546	2017551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_018641	ATC	2	6	2019159	2019164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_018641	AT	3	6	2019196	2019201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_018641	TAC	2	6	2019207	2019212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_018641	CCT	2	6	2019506	2019511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_018641	T	6	6	2019511	2019516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_018641	A	6	6	2019538	2019543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_018641	TTA	2	6	2021332	2021337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_018641	T	6	6	2021383	2021388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_018641	TAC	2	6	2021532	2021537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_018641	TAG	2	6	2021538	2021543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6074	NC_018641	TTA	2	6	2022763	2022768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_018641	TCAA	2	8	2022786	2022793	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6076	NC_018641	T	6	6	2023679	2023684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_018641	CAA	2	6	2023690	2023695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_018641	GTC	2	6	2023721	2023726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_018641	ATC	2	6	2023738	2023743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_018641	ATT	2	6	2023752	2023757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_018641	CAA	2	6	2023769	2023774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6082	NC_018641	AGG	2	6	2023867	2023872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_018641	A	7	7	2027054	2027060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_018641	CTGAT	2	10	2027070	2027079	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6085	NC_018641	T	6	6	2027093	2027098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_018641	AAC	2	6	2028580	2028585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_018641	AGC	2	6	2028624	2028629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_018641	TCCA	2	8	2028645	2028652	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6089	NC_018641	CGATA	2	10	2028659	2028668	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6090	NC_018641	GGA	2	6	2028684	2028689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_018641	AACT	2	8	2029443	2029450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6092	NC_018641	AAGG	2	8	2029535	2029542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_018641	CCT	2	6	2030090	2030095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6094	NC_018641	CAT	2	6	2030596	2030601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6096	NC_018641	AGG	2	6	2031693	2031698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6098	NC_018641	A	6	6	2036492	2036497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_018641	CCT	2	6	2036498	2036503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_018641	TTC	2	6	2036505	2036510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_018641	GTC	2	6	2036556	2036561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_018641	T	6	6	2037726	2037731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_018641	TGC	2	6	2038827	2038832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6104	NC_018641	ACCA	2	8	2038866	2038873	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6105	NC_018641	TCAAG	2	10	2040651	2040660	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6106	NC_018641	CAAAC	2	10	2040674	2040683	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6107	NC_018641	CTG	2	6	2040703	2040708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_018641	TG	3	6	2040707	2040712	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_018641	CAG	3	9	2040718	2040726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_018641	GACATG	2	12	2040733	2040744	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6111	NC_018641	TCA	2	6	2040761	2040766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_018641	GAA	2	6	2040781	2040786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_018641	A	7	7	2040807	2040813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_018641	A	6	6	2040836	2040841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_018641	CAT	2	6	2040859	2040864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_018641	TCA	2	6	2040867	2040872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_018641	CAA	2	6	2040878	2040883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_018641	A	6	6	2040928	2040933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_018641	TGT	2	6	2041989	2041994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_018641	TTCC	2	8	2042044	2042051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_018641	CAA	2	6	2042082	2042087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_018641	A	6	6	2042086	2042091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_018641	GT	3	6	2042467	2042472	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_018641	CAG	2	6	2043762	2043767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_018641	TGG	2	6	2045813	2045818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_018641	CAT	2	6	2045836	2045841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_018641	TTA	2	6	2046070	2046075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_018641	GAC	2	6	2046090	2046095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_018641	AATT	2	8	2046108	2046115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_018641	TCA	2	6	2046120	2046125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_018641	CATTT	2	10	2046145	2046154	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6132	NC_018641	ATC	2	6	2046170	2046175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6133	NC_018641	TTAC	2	8	2046609	2046616	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6134	NC_018641	CATT	2	8	2046670	2046677	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6135	NC_018641	T	6	6	2046993	2046998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_018641	ACC	2	6	2047046	2047051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6139	NC_018641	TAT	2	6	2050764	2050769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6140	NC_018641	TTA	2	6	2050776	2050781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6141	NC_018641	TATT	2	8	2050792	2050799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6142	NC_018641	T	6	6	2050832	2050837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6143	NC_018641	TAACCT	2	12	2050934	2050945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6145	NC_018641	T	6	6	2051880	2051885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6149	NC_018641	CTTTCA	2	12	2053996	2054007	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6151	NC_018641	A	6	6	2054015	2054020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6152	NC_018641	GA	4	8	2055751	2055758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6153	NC_018641	TTA	2	6	2055774	2055779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6162	NC_018641	TCG	2	6	2055980	2055985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6167	NC_018641	TCG	2	6	2056239	2056244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6170	NC_018641	AT	4	8	2056341	2056348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6172	NC_018641	CTT	2	6	2056865	2056870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6248	NC_018641	TC	3	6	2074225	2074230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6249	NC_018641	T	7	7	2074309	2074315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6250	NC_018641	GCA	2	6	2074319	2074324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6251	NC_018641	GAG	2	6	2074431	2074436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6252	NC_018641	T	6	6	2075119	2075124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6253	NC_018641	TTTCA	2	10	2075134	2075143	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6254	NC_018641	TA	3	6	2075162	2075167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6255	NC_018641	CGAG	2	8	2075257	2075264	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6256	NC_018641	GA	3	6	2075314	2075319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6257	NC_018641	CT	3	6	2075322	2075327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6258	NC_018641	ATG	2	6	2075363	2075368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_018641	T	6	6	2075384	2075389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6260	NC_018641	TTG	2	6	2075400	2075405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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